More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3066 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  100 
 
 
300 aa  615  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  61.62 
 
 
302 aa  391  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  61.28 
 
 
302 aa  377  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  59.86 
 
 
308 aa  378  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  60.07 
 
 
302 aa  374  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  57.72 
 
 
303 aa  362  4e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  56.9 
 
 
301 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  57.58 
 
 
301 aa  361  8e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  57.58 
 
 
301 aa  360  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  57.58 
 
 
301 aa  360  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  57.58 
 
 
301 aa  360  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  57.58 
 
 
301 aa  360  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  57.24 
 
 
301 aa  360  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  57.58 
 
 
301 aa  360  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  58.36 
 
 
301 aa  360  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  56.85 
 
 
299 aa  359  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  56.85 
 
 
299 aa  359  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  56.66 
 
 
301 aa  359  3e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  57.24 
 
 
301 aa  359  4e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  57.24 
 
 
301 aa  359  4e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  55.07 
 
 
300 aa  354  1e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  55.14 
 
 
299 aa  349  3e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  53.77 
 
 
298 aa  342  4e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  56.76 
 
 
297 aa  340  2e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  55.41 
 
 
297 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  54.55 
 
 
305 aa  331  9e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  54.55 
 
 
303 aa  329  3e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  52.86 
 
 
303 aa  328  8e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  53.06 
 
 
299 aa  327  1.0000000000000001e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  52.72 
 
 
299 aa  325  7e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  53.77 
 
 
298 aa  324  9e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  54.05 
 
 
298 aa  322  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  51.55 
 
 
302 aa  317  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  52.36 
 
 
297 aa  315  8e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  52.07 
 
 
306 aa  311  5.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  51.84 
 
 
299 aa  310  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  51.37 
 
 
293 aa  309  4e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  47.97 
 
 
303 aa  308  5.9999999999999995e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  48.64 
 
 
301 aa  306  2.0000000000000002e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  49.32 
 
 
296 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  50 
 
 
303 aa  305  7e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 
297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  48.98 
 
 
296 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  50.67 
 
 
307 aa  303  3.0000000000000004e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  47.6 
 
 
294 aa  299  4e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  49.49 
 
 
303 aa  297  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  51.51 
 
 
314 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  51.02 
 
 
301 aa  296  4e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  51.54 
 
 
300 aa  295  4e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  51.51 
 
 
314 aa  295  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  48.99 
 
 
301 aa  294  1e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  48.66 
 
 
300 aa  294  1e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  50.68 
 
 
296 aa  293  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  48.81 
 
 
299 aa  293  3e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  47.14 
 
 
296 aa  292  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  48.65 
 
 
305 aa  288  1e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  48.83 
 
 
337 aa  285  8e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  47.16 
 
 
300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  45.3 
 
 
303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  48.83 
 
 
318 aa  283  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  47.96 
 
 
311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3463  GTP-binding protein Era  45.82 
 
 
299 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.720109  normal  0.032958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3452  GTP-binding protein Era  45.48 
 
 
299 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00911502  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3515  GTP-binding protein Era  45.48 
 
 
299 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  48.5 
 
 
306 aa  280  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1254  GTP-binding protein Era  46.44 
 
 
298 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  47.16 
 
 
310 aa  279  4e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  44.77 
 
 
304 aa  277  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  44.81 
 
 
305 aa  276  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4483  GTP-binding protein Era  51.68 
 
 
318 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  44.9 
 
 
307 aa  276  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  45.31 
 
 
310 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  45.42 
 
 
314 aa  272  4.0000000000000004e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  43.24 
 
 
301 aa  270  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3449  GTP-binding protein Era  45.27 
 
 
299 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0196733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  45.61 
 
 
315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  44.98 
 
 
310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  44.66 
 
 
310 aa  268  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  47.35 
 
 
311 aa  268  5.9999999999999995e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4623  GTP-binding protein Era  43.96 
 
 
298 aa  268  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236944  hitchhiker  0.0010995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2303  GTP-binding protein Era  45.67 
 
 
306 aa  268  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  43 
 
 
301 aa  267  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 
297 aa  267  2e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  44.55 
 
 
303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  45.05 
 
 
300 aa  266  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  47.78 
 
 
293 aa  265  7e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  43.15 
 
 
315 aa  265  8.999999999999999e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3384  GTP-binding protein Era  43.92 
 
 
308 aa  263  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731226  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1752  GTP-binding protein Era  42.33 
 
 
312 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  45.21 
 
 
307 aa  262  4e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0356  GTP-binding protein Era  48.99 
 
 
315 aa  262  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  43.49 
 
 
324 aa  261  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12390  GTP-binding protein Era  45.33 
 
 
300 aa  260  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196376  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3155  GTP-binding protein Era  46.38 
 
 
302 aa  260  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0422741  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  42.32 
 
 
305 aa  259  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2185  GTP-binding protein Era  43.81 
 
 
319 aa  258  6e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646134  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  42.81 
 
 
322 aa  258  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1966  GTP-binding protein Era  45.72 
 
 
319 aa  258  8e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000219392 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2758  GTP-binding protein Era  44.81 
 
 
318 aa  258  8e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0588408  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  43.84 
 
 
295 aa  258  9e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>