More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0989 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  100 
 
 
305 aa  620  1e-176  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  67.11 
 
 
303 aa  428  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  57.86 
 
 
303 aa  363  3e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  56.86 
 
 
299 aa  356  2.9999999999999997e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  56.86 
 
 
299 aa  354  1e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  59.74 
 
 
301 aa  350  2e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  53.51 
 
 
302 aa  331  7.000000000000001e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  54.52 
 
 
302 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  54.67 
 
 
303 aa  327  2.0000000000000001e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  55.07 
 
 
301 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  55.07 
 
 
301 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  55.07 
 
 
301 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  55.07 
 
 
301 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  55.07 
 
 
301 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  55.07 
 
 
301 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  54.73 
 
 
301 aa  318  6e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  54.73 
 
 
301 aa  318  7e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  54.73 
 
 
301 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  54.73 
 
 
301 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  51.32 
 
 
299 aa  316  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  51.32 
 
 
299 aa  316  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  53.16 
 
 
301 aa  315  4e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  51.67 
 
 
302 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  50.99 
 
 
303 aa  309  5e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  50.49 
 
 
300 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  49.67 
 
 
299 aa  304  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  49.67 
 
 
308 aa  296  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  51.01 
 
 
293 aa  297  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  47.3 
 
 
298 aa  294  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  48.65 
 
 
300 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  47.35 
 
 
298 aa  285  8e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  48.65 
 
 
297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  48.66 
 
 
297 aa  282  6.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  46.1 
 
 
303 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  45.45 
 
 
301 aa  281  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  47.65 
 
 
305 aa  281  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  49.66 
 
 
296 aa  276  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  47.49 
 
 
298 aa  275  7e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  47.46 
 
 
294 aa  271  8.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  47 
 
 
297 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  48.32 
 
 
310 aa  270  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  47.67 
 
 
337 aa  267  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  46.78 
 
 
299 aa  266  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  47.32 
 
 
314 aa  265  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  47.32 
 
 
314 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0356  GTP-binding protein Era  50.84 
 
 
315 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  46.33 
 
 
296 aa  264  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 
307 aa  263  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  45.75 
 
 
306 aa  262  4.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  45.03 
 
 
311 aa  262  6e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  46 
 
 
300 aa  261  8e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  46.18 
 
 
297 aa  260  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  44.75 
 
 
302 aa  259  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  47.32 
 
 
318 aa  259  4e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  46.94 
 
 
293 aa  256  3e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19471  GTP-binding protein Era  44.95 
 
 
343 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  47.46 
 
 
301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  47.2 
 
 
301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  44.93 
 
 
303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  43.96 
 
 
301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2303  GTP-binding protein Era  42.76 
 
 
306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  43.67 
 
 
296 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4483  GTP-binding protein Era  48.31 
 
 
318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  42.81 
 
 
303 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  42.62 
 
 
315 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  47.12 
 
 
300 aa  251  1e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  43.33 
 
 
296 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  45.33 
 
 
451 aa  250  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 
307 aa  249  4e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  42.53 
 
 
313 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  45.67 
 
 
449 aa  249  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  43.33 
 
 
303 aa  248  6e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1511  GTP-binding protein Era  44.88 
 
 
319 aa  248  7e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  43.29 
 
 
300 aa  248  8e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  43.37 
 
 
311 aa  248  8e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1254  GTP-binding protein Era  43.85 
 
 
298 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  41.78 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  43.14 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  45.45 
 
 
299 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  41.88 
 
 
313 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  41.78 
 
 
314 aa  241  7.999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  41.67 
 
 
297 aa  241  9e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0864  GTP-binding protein Era  41.95 
 
 
296 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1008  GTP-binding protein Era  41.95 
 
 
296 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.028746 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002498  GTP-binding protein Era  40.82 
 
 
320 aa  240  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2203  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 
306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.00609862 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  41.16 
 
 
314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13500  GTP-binding protein Era  40.46 
 
 
314 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03535  GTP-binding protein Era  40.82 
 
 
320 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3243  GTP-binding protein Era  42.14 
 
 
311 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0404456  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2524  GTP-binding protein Era  41.47 
 
 
321 aa  238  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00258575  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4623  GTP-binding protein Era  41.91 
 
 
298 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236944  hitchhiker  0.0010995 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  42.03 
 
 
295 aa  236  4e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  41.33 
 
 
314 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1966  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 
319 aa  235  6e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000219392 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  42.33 
 
 
312 aa  235  6e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14801  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 
303 aa  235  8e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1685  GTP-binding protein Era  42.03 
 
 
295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3384  GTP-binding protein Era  42.28 
 
 
308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731226  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  40.86 
 
 
311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>