More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0579 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  100 
 
 
298 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  65.54 
 
 
297 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  56.27 
 
 
305 aa  346  3e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  54.79 
 
 
302 aa  344  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  55.07 
 
 
301 aa  344  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  54.05 
 
 
301 aa  343  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  54.36 
 
 
302 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  54.73 
 
 
301 aa  342  5e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  54.73 
 
 
301 aa  341  7e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  54.73 
 
 
301 aa  341  7e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  54.73 
 
 
301 aa  341  7e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  54.73 
 
 
301 aa  341  7e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  54.73 
 
 
301 aa  341  7e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  54.73 
 
 
301 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  54.73 
 
 
301 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  53.38 
 
 
301 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  57.19 
 
 
298 aa  338  8e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  54.79 
 
 
297 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  52.88 
 
 
300 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  53.2 
 
 
302 aa  332  4e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  54.42 
 
 
302 aa  332  4e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  52.74 
 
 
296 aa  332  5e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  52.74 
 
 
296 aa  331  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  50.84 
 
 
299 aa  328  7e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  50.84 
 
 
299 aa  328  7e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  52.56 
 
 
299 aa  325  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  53.77 
 
 
300 aa  324  9e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  53.56 
 
 
300 aa  324  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  52.04 
 
 
298 aa  323  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  53.95 
 
 
303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 
299 aa  318  7e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  53.95 
 
 
303 aa  318  7e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  49.32 
 
 
294 aa  314  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  50.34 
 
 
308 aa  311  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  50.17 
 
 
293 aa  310  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  52.38 
 
 
299 aa  309  2.9999999999999997e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  52.04 
 
 
299 aa  309  4e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  48.81 
 
 
303 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  52.72 
 
 
301 aa  307  1.0000000000000001e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  50 
 
 
297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  50 
 
 
301 aa  303  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  49.15 
 
 
303 aa  296  3e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  48.98 
 
 
296 aa  295  4e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  47.26 
 
 
303 aa  294  1e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  45.92 
 
 
303 aa  288  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  47.35 
 
 
305 aa  285  8e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  46.94 
 
 
324 aa  282  6.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  48.14 
 
 
293 aa  280  2e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  45.89 
 
 
297 aa  278  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  48.46 
 
 
296 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  46.21 
 
 
301 aa  275  1.0000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  45.89 
 
 
303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  45.21 
 
 
306 aa  268  7e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  44.64 
 
 
489 aa  265  7e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  44.03 
 
 
307 aa  263  3e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  42 
 
 
314 aa  261  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  45.64 
 
 
310 aa  259  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  43.96 
 
 
300 aa  259  4e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 
468 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  40.61 
 
 
297 aa  258  6e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  44.75 
 
 
311 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  43.96 
 
 
301 aa  257  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1254  GTP-binding protein Era  41.55 
 
 
298 aa  257  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  46.46 
 
 
337 aa  256  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1511  GTP-binding protein Era  45.64 
 
 
319 aa  256  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  40.94 
 
 
322 aa  256  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11760  GTP-binding protein Era  40.67 
 
 
310 aa  256  3e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.28121  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  44.03 
 
 
315 aa  256  4e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  43.58 
 
 
307 aa  255  6e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  41.02 
 
 
300 aa  255  7e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  41.92 
 
 
300 aa  254  9e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  41.64 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  45.21 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  43.3 
 
 
451 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19471  GTP-binding protein Era  42.9 
 
 
343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  44.25 
 
 
299 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0251  GTP-binding protein Era  42.12 
 
 
295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.338146  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  43.54 
 
 
449 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  40.27 
 
 
311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  42.37 
 
 
303 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3449  GTP-binding protein Era  40.89 
 
 
299 aa  252  5.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0196733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2303  GTP-binding protein Era  41.16 
 
 
306 aa  252  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  43.99 
 
 
305 aa  252  6e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1752  GTP-binding protein Era  39.13 
 
 
312 aa  251  7e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4623  GTP-binding protein Era  41.5 
 
 
298 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236944  hitchhiker  0.0010995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5225  GTP-binding protein Era  42.71 
 
 
306 aa  250  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.761652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3243  GTP-binding protein Era  41.22 
 
 
311 aa  251  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0404456  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  45.76 
 
 
307 aa  250  2e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0356  GTP-binding protein Era  45.76 
 
 
315 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  42.03 
 
 
300 aa  250  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  41.75 
 
 
296 aa  249  3e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  43.19 
 
 
310 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  43.19 
 
 
310 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  40.8 
 
 
305 aa  249  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  43.52 
 
 
313 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  42.72 
 
 
311 aa  249  5e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  43.19 
 
 
310 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17220  GTP-binding protein Era  41.42 
 
 
313 aa  248  6e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00402768  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  43.73 
 
 
314 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3463  GTP-binding protein Era  41.22 
 
 
299 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.720109  normal  0.032958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>