More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1711 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 307 aa  610  9.999999999999999e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  51.33 
 
 		 302 aa  294  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  50.67 
 
 		 302 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  48.5 
 
 		 310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  48.5 
 
 		 310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  48.17 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  46.96 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  47.67 
 
 		 301 aa  276  4e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2156  GTP-binding protein Era  45.95 
 
 		 310 aa  275  5e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  46.26 
 
 		 303 aa  275  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  47.33 
 
 		 301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  47 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  47 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  47 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  46.67 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  47 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  47 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  46.98 
 
 		 298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  47 
 
 		 301 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  48.47 
 
 		 298 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  47 
 
 		 301 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  47.28 
 
 		 296 aa  272  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  46.94 
 
 		 299 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  46.62 
 
 		 296 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  48.48 
 
 		 303 aa  271  1e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  45.67 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  47.14 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  46.64 
 
 		 303 aa  267  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  44 
 
 		 303 aa  264  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2207  GTP-binding protein Era  46.33 
 
 		 307 aa  263  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547377 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  45.21 
 
 		 300 aa  262  4e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  46.64 
 
 		 293 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  45.36 
 
 		 302 aa  262  6e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  45.3 
 
 		 294 aa  261  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  44.9 
 
 		 297 aa  259  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  47.3 
 
 		 300 aa  258  6e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  43.33 
 
 		 307 aa  255  6e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  44.03 
 
 		 299 aa  255  8e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  44.03 
 
 		 299 aa  255  8e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  46.13 
 
 		 299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  49.15 
 
 		 302 aa  253  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  44.93 
 
 		 307 aa  252  5.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  43.27 
 
 		 311 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  43.77 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  43.27 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  41.83 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  45.76 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  42.91 
 
 		 303 aa  249  4e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  44.3 
 
 		 303 aa  248  6e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2740  GTP-binding protein Era  42 
 
 		 305 aa  248  7e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  46.46 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  41.64 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  45.42 
 
 		 311 aa  246  4e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0033  GTP-binding protein Era  42.71 
 
 		 305 aa  246  4e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  38.69 
 
 		 308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1122  GTP-binding protein Era  41.81 
 
 		 304 aa  245  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1401  GTP-binding protein Era  41.81 
 
 		 304 aa  245  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  42.57 
 
 		 312 aa  245  8e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  45.33 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  45.7 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  44.92 
 
 		 306 aa  243  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2244  GTP-binding protein Era  43.97 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  46.03 
 
 		 300 aa  242  5e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  43.77 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0375  GTP-binding protein Era  41.5 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.426985  hitchhiker  0.000823221 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  45.27 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  41.61 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  44.11 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  44.11 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  43.92 
 
 		 295 aa  240  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  48.49 
 
 		 301 aa  240  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5225  GTP-binding protein Era  41.8 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.761652 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0214  GTP-binding protein Era  42.28 
 
 		 293 aa  239  5e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.890226  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  43.75 
 
 		 305 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  41.75 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  44.22 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  41.53 
 
 		 298 aa  237  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  44.9 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0951  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  42.52 
 
 		 298 aa  235  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 		 300 aa  235  7e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1685  GTP-binding protein Era  43.24 
 
 		 295 aa  234  9e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  41.39 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  42.03 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  38.93 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1878  GTP-binding protein Era  41.72 
 
 		 295 aa  232  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  43.62 
 
 		 303 aa  232  5e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2242  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 298 aa  232  6e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709672 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  43.54 
 
 		 300 aa  232  7.000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54320  GTP-binding protein Era  44.48 
 
 		 305 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2784  GTP-binding protein Era  43.29 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0418  GTP-binding protein Era  41.69 
 
 		 303 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  40.48 
 
 		 297 aa  229  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  46.26 
 
 		 298 aa  230  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0334  GTP-binding protein Era  40.52 
 
 		 330 aa  229  3e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.94828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  44.07 
 
 		 301 aa  230  3e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0368  GTP-binding protein Era  40.52 
 
 		 338 aa  229  3e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0276101 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0655  GTP-binding protein Era  42.42 
 
 		 299 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1135  GTP-binding protein Era  42.42 
 
 		 299 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>