More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3150 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 297 aa  599  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  74.75 
 
 		 297 aa  472  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  74.41 
 
 		 298 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  71.04 
 
 		 299 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  64.77 
 
 		 296 aa  394  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  59.4 
 
 		 296 aa  353  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  56.23 
 
 		 303 aa  343  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  54.58 
 
 		 302 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  55.41 
 
 		 300 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  54.79 
 
 		 298 aa  337  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  54.73 
 
 		 301 aa  333  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  53.87 
 
 		 302 aa  332  5e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  55.25 
 
 		 305 aa  332  6e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  54.73 
 
 		 301 aa  331  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  54.73 
 
 		 301 aa  331  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  54.73 
 
 		 301 aa  331  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  54.73 
 
 		 301 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  54.73 
 
 		 301 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  54.88 
 
 		 302 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  54.39 
 
 		 301 aa  329  3e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  54.39 
 
 		 301 aa  329  3e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  54.05 
 
 		 301 aa  328  6e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  54.05 
 
 		 301 aa  328  6e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  53.72 
 
 		 301 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  51.85 
 
 		 300 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  52.88 
 
 		 303 aa  318  5e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  53.58 
 
 		 303 aa  318  7e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 		 303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  55.1 
 
 		 307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  49.49 
 
 		 298 aa  310  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  54.08 
 
 		 297 aa  310  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  53.08 
 
 		 299 aa  309  5e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  53.58 
 
 		 299 aa  308  8e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  49.66 
 
 		 299 aa  308  9e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  49.66 
 
 		 299 aa  308  9e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  50.86 
 
 		 293 aa  302  4.0000000000000003e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  47.97 
 
 		 299 aa  301  1e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  48.97 
 
 		 301 aa  297  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  51.53 
 
 		 303 aa  296  4e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  47.6 
 
 		 294 aa  295  8e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  51.54 
 
 		 308 aa  292  5e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  49.15 
 
 		 324 aa  291  6e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  48.8 
 
 		 302 aa  290  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  48.46 
 
 		 303 aa  288  9e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  48.66 
 
 		 303 aa  288  1e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  49.34 
 
 		 310 aa  285  7e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 301 aa  285  9e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  49.01 
 
 		 310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  45.55 
 
 		 296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  45.55 
 
 		 296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  47.14 
 
 		 297 aa  282  4.0000000000000003e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  48.63 
 
 		 301 aa  282  5.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  48.68 
 
 		 310 aa  281  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2156  GTP-binding protein Era  49.36 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  46.96 
 
 		 307 aa  280  2e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  44.07 
 
 		 306 aa  272  6e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  47 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  47.32 
 
 		 314 aa  269  5e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  48.97 
 
 		 306 aa  267  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  45.64 
 
 		 314 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  45.21 
 
 		 295 aa  265  8e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  45.64 
 
 		 314 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  46.42 
 
 		 300 aa  264  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  46.64 
 
 		 300 aa  264  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  46.64 
 
 		 300 aa  263  3e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  46.39 
 
 		 305 aa  261  6.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1055  GTP-binding protein Era  46.76 
 
 		 331 aa  261  8e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.305359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  45.94 
 
 		 299 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3726  GTP-binding protein Era  45.43 
 
 		 340 aa  260  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.251603 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  45.05 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  47.44 
 
 		 293 aa  259  3e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1685  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  45.7 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0651  putative GTP-binding protein  47.14 
 
 		 312 aa  259  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1279  GTP-binding protein Era  46.08 
 
 		 338 aa  258  6e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.446406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3111  GTP-binding protein Era  46.08 
 
 		 338 aa  258  6e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00956624  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1246  GTP-binding protein Era  46.08 
 
 		 338 aa  258  6e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1202  GTP-binding protein Era  46.08 
 
 		 338 aa  258  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  46.42 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  45.18 
 
 		 303 aa  256  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1349  GTP-binding protein Era  46.42 
 
 		 339 aa  256  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  46.42 
 
 		 339 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  46.42 
 
 		 339 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3025  GTP-binding protein Era  46.42 
 
 		 339 aa  256  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.118015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  45.08 
 
 		 297 aa  255  7e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  44.18 
 
 		 293 aa  255  7e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  44.3 
 
 		 300 aa  254  9e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5225  GTP-binding protein Era  44.75 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.761652 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  44.3 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 		 311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3449  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196733 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1069  GTP-binding protein Era  45.3 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  46.1 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1038  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00137835  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  44.63 
 
 		 301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  43.84 
 
 		 311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  44.03 
 
 		 334 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0597  GTP-binding protein Era  46.28 
 
 		 348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2251  GTP-binding protein Era  43.62 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  44.63 
 
 		 301 aa  253  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>