More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1793 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1793  GTP-binding protein Era  100 
 
 
307 aa  632  1e-180  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375473  normal  0.0439993 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1999  GTP-binding protein Era  73.29 
 
 
306 aa  479  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00245097  normal  0.170992 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0456  GTP-binding protein Era  69.1 
 
 
306 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371329  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1731  GTP-binding protein Era  67.55 
 
 
305 aa  438  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000233953  decreased coverage  0.0035862 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0350  GTP-binding protein Era  67.54 
 
 
305 aa  429  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000177967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0419  GTP-binding protein Era  64.26 
 
 
305 aa  420  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000385747  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0569  GTP-binding protein Era  63.7 
 
 
305 aa  409  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  48 
 
 
311 aa  258  9e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3777  GTP-binding protein Era  44.67 
 
 
295 aa  255  6e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1878  GTP-binding protein Era  42.81 
 
 
295 aa  245  8e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 
296 aa  242  5e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43907  predicted protein  42.58 
 
 
351 aa  238  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3856  GTP-binding protein Era  42.31 
 
 
308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00601446  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  42.05 
 
 
303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  44.19 
 
 
289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5225  GTP-binding protein Era  40.65 
 
 
306 aa  230  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.761652 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  43 
 
 
298 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  40.65 
 
 
298 aa  226  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  42.19 
 
 
299 aa  225  7e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  40.53 
 
 
297 aa  221  9e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01555  putative GTP-binding protein  40.13 
 
 
294 aa  221  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 
300 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  39.74 
 
 
299 aa  218  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 
297 aa  216  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  38.36 
 
 
301 aa  215  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  41 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  40.26 
 
 
298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  40.53 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  37.1 
 
 
307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  38.03 
 
 
301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  38.76 
 
 
299 aa  212  5.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  38.76 
 
 
299 aa  212  5.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  37.38 
 
 
301 aa  212  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  39.34 
 
 
297 aa  212  7.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1754  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 
302 aa  211  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.141942  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  38.44 
 
 
299 aa  211  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  37.17 
 
 
303 aa  210  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  37.38 
 
 
301 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  37.38 
 
 
301 aa  209  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  37.38 
 
 
301 aa  209  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  37.38 
 
 
301 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  37.38 
 
 
301 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  37.99 
 
 
302 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  38.36 
 
 
302 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0214  GTP-binding protein Era  37.12 
 
 
293 aa  208  8e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.890226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  37.05 
 
 
301 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  35.74 
 
 
301 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  40 
 
 
294 aa  208  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  37.05 
 
 
301 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1377  GTP-binding protein Era  35.97 
 
 
303 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0974001  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  37.79 
 
 
293 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  36.75 
 
 
298 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14421  GTP-binding protein Era  36.18 
 
 
303 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2207  GTP-binding protein Era  37.75 
 
 
307 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547377 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  36.07 
 
 
307 aa  205  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  40.46 
 
 
310 aa  205  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  40.13 
 
 
310 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  37.38 
 
 
303 aa  204  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  39.22 
 
 
302 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  38.14 
 
 
301 aa  205  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  37.58 
 
 
301 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  36.75 
 
 
308 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  39.03 
 
 
297 aa  204  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  36.08 
 
 
308 aa  203  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  37.86 
 
 
296 aa  203  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  36.18 
 
 
293 aa  203  4e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  39.94 
 
 
310 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  37.54 
 
 
298 aa  202  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  37.62 
 
 
303 aa  202  5e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  40.13 
 
 
489 aa  202  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  35.71 
 
 
294 aa  202  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  35.78 
 
 
313 aa  201  9e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2169  GTP-binding protein Era  38.24 
 
 
299 aa  201  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0368513  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0651  putative GTP-binding protein  40.46 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  36.88 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  39.24 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  40.39 
 
 
293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  36.1 
 
 
313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  36.81 
 
 
300 aa  200  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  38.11 
 
 
309 aa  200  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  42.43 
 
 
307 aa  200  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  39.02 
 
 
301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  36.88 
 
 
303 aa  199  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2816  GTP-binding protein Era  37.58 
 
 
299 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0544  GTP-binding protein Era  37.58 
 
 
299 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2894  GTP-binding protein Era  37.58 
 
 
299 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2839  GTP-binding protein Era  37.58 
 
 
299 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1788  GTP-binding protein Era  37.58 
 
 
299 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14661  GTP-binding protein Era  35.64 
 
 
303 aa  198  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2465  GTP-binding protein Era  37.58 
 
 
311 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1086  GTP-binding protein Era  37.91 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2778  GTP-binding protein Era  37.25 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14801  GTP-binding protein Era  35.64 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2142  GTP-binding protein Era  37.87 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  35.83 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4247  GTP-binding protein Era  36.93 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1731  GTP-binding protein Era  37.29 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  36.6 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0994  GTP-binding protein Era  34.85 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307835  normal  0.0847852 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1135  GTP-binding protein Era  37.29 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>