More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2142 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2142  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 299 aa  607  1e-173  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1878  GTP-binding protein Era  60.27 
 
 		 295 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0214  GTP-binding protein Era  58.42 
 
 		 293 aa  359  3e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.890226  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01555  putative GTP-binding protein  58.28 
 
 		 294 aa  354  1e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  57.34 
 
 		 298 aa  354  1e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3856  GTP-binding protein Era  56 
 
 		 308 aa  337  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00601446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5225  GTP-binding protein Era  54.58 
 
 		 306 aa  328  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.761652 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  53.06 
 
 		 296 aa  311  9e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3777  GTP-binding protein Era  48.98 
 
 		 295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  47.44 
 
 		 289 aa  276  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  45.89 
 
 		 311 aa  262  4e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  42.96 
 
 		 300 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  45.08 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  44.18 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 		 324 aa  252  6e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  42.56 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  41.89 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  41.61 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  40.68 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  40.68 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  40.68 
 
 		 301 aa  246  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  40.68 
 
 		 301 aa  246  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  40.68 
 
 		 301 aa  246  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  40.68 
 
 		 301 aa  246  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  40.68 
 
 		 301 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  40.68 
 
 		 301 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  40.21 
 
 		 299 aa  245  6.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  44.15 
 
 		 303 aa  244  9e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  40.34 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  40.34 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  41.75 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  40.48 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  40.48 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  41.1 
 
 		 302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  41.36 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  43.1 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  39.32 
 
 		 301 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  43.3 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  42.61 
 
 		 298 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  42.27 
 
 		 299 aa  238  8e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  40.2 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  41.69 
 
 		 305 aa  238  1e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  37.67 
 
 		 298 aa  237  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  41.75 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  39.38 
 
 		 298 aa  235  6e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  40.94 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  43.54 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  42.12 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 		 308 aa  233  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  41.38 
 
 		 295 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21922  predicted protein  42.86 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0419  GTP-binding protein Era  40.65 
 
 		 305 aa  229  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000385747  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  40.75 
 
 		 293 aa  229  4e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  40.82 
 
 		 303 aa  228  7e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1685  GTP-binding protein Era  40.69 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  40.54 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1999  GTP-binding protein Era  40.97 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00245097  normal  0.170992 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0569  GTP-binding protein Era  41.56 
 
 		 305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0651  putative GTP-binding protein  41.55 
 
 		 312 aa  225  6e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  40.82 
 
 		 300 aa  225  7e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  39.73 
 
 		 314 aa  225  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  39.73 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4748  GTP-binding protein Era  42.09 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0521069  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  37.93 
 
 		 293 aa  223  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1731  GTP-binding protein Era  40.72 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000233953  decreased coverage  0.0035862 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  38.26 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54320  GTP-binding protein Era  41.75 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  37.67 
 
 		 293 aa  223  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1064  GTP-binding protein Era  38.85 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0212543  normal  0.0907756 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1476  GTP-binding protein Era  42.76 
 
 		 299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0456  GTP-binding protein Era  39.74 
 
 		 306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371329  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  38.93 
 
 		 296 aa  222  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 		 298 aa  222  6e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  40.61 
 
 		 307 aa  222  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  39.59 
 
 		 315 aa  221  8e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0929  GTP-binding protein Era  37.84 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163867  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0994  GTP-binding protein Era  37.84 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307835  normal  0.0847852 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  38.7 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  37.54 
 
 		 297 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  39.38 
 
 		 298 aa  219  3e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0350  GTP-binding protein Era  40.59 
 
 		 305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000177967  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  37.83 
 
 		 305 aa  219  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  39.86 
 
 		 307 aa  218  7e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43907  predicted protein  39.8 
 
 		 351 aa  218  7e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  39.66 
 
 		 303 aa  218  7.999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2619  GTP-binding protein Era  38.08 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1793  GTP-binding protein Era  39.53 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375473  normal  0.0439993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  38.57 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  38.67 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3266  GTP-binding protein Era  38.08 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0242334 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  39 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  38.72 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  40.88 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1434  GTP-binding protein Era  40.14 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4216  GTP-binding protein Era  41.38 
 
 		 300 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3950  GTP-binding protein Era  41.38 
 
 		 300 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4373  GTP-binding protein Era  40.14 
 
 		 300 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212808 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  37.29 
 
 		 300 aa  216  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>