More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0214 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0214  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 293 aa  595  1e-169  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.890226  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01555  putative GTP-binding protein  80.28 
 
 		 294 aa  484  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1878  GTP-binding protein Era  76.55 
 
 		 295 aa  469  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2142  GTP-binding protein Era  58.42 
 
 		 299 aa  349  3e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5225  GTP-binding protein Era  55.44 
 
 		 306 aa  335  7e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.761652 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  54.27 
 
 		 298 aa  330  1e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3856  GTP-binding protein Era  55.63 
 
 		 308 aa  328  5.0000000000000004e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00601446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  56.36 
 
 		 296 aa  328  6e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3777  GTP-binding protein Era  52.38 
 
 		 295 aa  316  3e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  45.86 
 
 		 289 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  45.73 
 
 		 311 aa  258  6e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  44.18 
 
 		 302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  43 
 
 		 302 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 302 aa  249  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  41.24 
 
 		 302 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  43.99 
 
 		 297 aa  245  8e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  44.9 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  42.27 
 
 		 299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  42.27 
 
 		 299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  43.54 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  42.61 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  42.81 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  42.12 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  42.28 
 
 		 307 aa  239  4e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  40.48 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  42.41 
 
 		 297 aa  238  8e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  40.55 
 
 		 299 aa  238  9e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  40.89 
 
 		 301 aa  238  9e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  42.27 
 
 		 301 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  42.27 
 
 		 301 aa  236  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  42.27 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  42.27 
 
 		 301 aa  236  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  42.27 
 
 		 301 aa  236  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  42.03 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  42.27 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  41.44 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  42.27 
 
 		 301 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  41.92 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  42.61 
 
 		 298 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  42.66 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  41.92 
 
 		 301 aa  236  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1999  GTP-binding protein Era  43.29 
 
 		 306 aa  236  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00245097  normal  0.170992 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  40.61 
 
 		 298 aa  235  6e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  41.92 
 
 		 297 aa  234  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  43.06 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  39.53 
 
 		 489 aa  234  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  40.75 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  43.15 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  41.38 
 
 		 293 aa  232  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  39.31 
 
 		 293 aa  232  5e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  39.66 
 
 		 300 aa  232  6e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  39.66 
 
 		 306 aa  231  8.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  42.52 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  42.27 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  41.38 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3668  GTP-binding protein Era  40.69 
 
 		 302 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  42.27 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21922  predicted protein  41.2 
 
 		 306 aa  228  6e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  37.33 
 
 		 301 aa  228  7e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  40.41 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43907  predicted protein  40.82 
 
 		 351 aa  227  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  42.96 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  38.14 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2784  GTP-binding protein Era  41.03 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  39.86 
 
 		 308 aa  225  6e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  38.14 
 
 		 300 aa  225  7e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  41.28 
 
 		 305 aa  225  7e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 		 300 aa  225  8e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1069  GTP-binding protein Era  41.03 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1476  GTP-binding protein Era  41.03 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 301 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  41.3 
 
 		 303 aa  223  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  40.75 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0456  GTP-binding protein Era  41.28 
 
 		 306 aa  223  4e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371329  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  38.14 
 
 		 315 aa  223  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  36.99 
 
 		 298 aa  222  7e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1731  GTP-binding protein Era  41.61 
 
 		 305 aa  222  7e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000233953  decreased coverage  0.0035862 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  37.33 
 
 		 296 aa  221  8e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4748  GTP-binding protein Era  40.69 
 
 		 302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0521069  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0033  GTP-binding protein Era  36.68 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  36.99 
 
 		 296 aa  219  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  36.64 
 
 		 298 aa  219  3e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2038  GTP-binding protein Era  38.7 
 
 		 324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.655908  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0995  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4287  GTP-binding protein Era  39.66 
 
 		 300 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1254  GTP-binding protein Era  37.84 
 
 		 298 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  37.37 
 
 		 300 aa  219  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54320  GTP-binding protein Era  40.34 
 
 		 305 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  39.53 
 
 		 293 aa  218  7e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1074  GTP-binding protein Era  39.66 
 
 		 300 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1434  GTP-binding protein Era  39.31 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  38.28 
 
 		 311 aa  217  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0569  GTP-binding protein Era  41.61 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  40.27 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4373  GTP-binding protein Era  39.31 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 451 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>