More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3777 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3777  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 295 aa  604  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5225  GTP-binding protein Era  58.92 
 
 		 306 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.761652 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  57.29 
 
 		 298 aa  355  5.999999999999999e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3856  GTP-binding protein Era  55.56 
 
 		 308 aa  340  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00601446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1878  GTP-binding protein Era  55.74 
 
 		 295 aa  338  7e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01555  putative GTP-binding protein  54.92 
 
 		 294 aa  329  3e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  53.4 
 
 		 296 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0214  GTP-binding protein Era  52.38 
 
 		 293 aa  316  3e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.890226  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2142  GTP-binding protein Era  48.98 
 
 		 299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  48.63 
 
 		 289 aa  281  8.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0569  GTP-binding protein Era  49.17 
 
 		 305 aa  267  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  46.26 
 
 		 311 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1999  GTP-binding protein Era  46.84 
 
 		 306 aa  265  7e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00245097  normal  0.170992 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0456  GTP-binding protein Era  44.15 
 
 		 306 aa  258  8e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371329  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1731  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 		 305 aa  255  5e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000233953  decreased coverage  0.0035862 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1793  GTP-binding protein Era  44.67 
 
 		 307 aa  255  5e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375473  normal  0.0439993 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0419  GTP-binding protein Era  45.7 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000385747  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  44.71 
 
 		 303 aa  249  4e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  41.75 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  42.42 
 
 		 299 aa  242  5e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  41.69 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1744  GTP-binding protein Era  41.67 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000728906  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 		 299 aa  238  8e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  43.2 
 
 		 299 aa  237  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  42.03 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  43.2 
 
 		 299 aa  237  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  40.2 
 
 		 298 aa  237  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  42.18 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1403  GTP-binding protein Era  43 
 
 		 321 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 296 aa  235  6e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  41.69 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  41.69 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  41.69 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  41.69 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  41.69 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  41.69 
 
 		 301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  41.69 
 
 		 301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0350  GTP-binding protein Era  42.67 
 
 		 305 aa  233  3e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000177967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  41.36 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2619  GTP-binding protein Era  41 
 
 		 337 aa  232  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3266  GTP-binding protein Era  41 
 
 		 337 aa  232  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0242334 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  41.36 
 
 		 301 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5260  GTP-binding protein Era  40.8 
 
 		 344 aa  231  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.678388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  42.52 
 
 		 297 aa  231  9e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  42.66 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  42.32 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  41.47 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21922  predicted protein  41.39 
 
 		 306 aa  230  3e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3237  GTP-binding protein Era  41.33 
 
 		 340 aa  229  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0752084  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  41.53 
 
 		 298 aa  228  8e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 		 306 aa  228  8e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0651  putative GTP-binding protein  40.59 
 
 		 312 aa  228  9e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1197  GTP-binding protein Era  41.14 
 
 		 344 aa  228  9e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  39.12 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  40.48 
 
 		 303 aa  227  1e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  39.59 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  40.86 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  40.68 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0994  GTP-binding protein Era  40.4 
 
 		 312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307835  normal  0.0847852 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  41.41 
 
 		 324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0929  GTP-binding protein Era  40.4 
 
 		 312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163867  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  42.37 
 
 		 301 aa  225  7e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1064  GTP-binding protein Era  40.4 
 
 		 298 aa  224  9e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0212543  normal  0.0907756 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  39.66 
 
 		 302 aa  224  9e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  38.91 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43907  predicted protein  40.4 
 
 		 351 aa  224  1e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  40.27 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  39.8 
 
 		 297 aa  223  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  39.32 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1086  GTP-binding protein Era  41.61 
 
 		 299 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  41.33 
 
 		 305 aa  222  4.9999999999999996e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  41.22 
 
 		 293 aa  222  6e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  35.81 
 
 		 301 aa  221  9e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2169  GTP-binding protein Era  41.67 
 
 		 299 aa  221  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0368513  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  40.13 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2898  GTP-binding protein Era  42.28 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22233  normal  0.295103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2417  GTP-binding protein Era  37.46 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.262207 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  38.18 
 
 		 302 aa  220  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  40.96 
 
 		 489 aa  219  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1731  GTP-binding protein Era  41.95 
 
 		 299 aa  220  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  37.88 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2778  GTP-binding protein Era  41.41 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  39.14 
 
 		 313 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2465  GTP-binding protein Era  41.08 
 
 		 311 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0544  GTP-binding protein Era  41.08 
 
 		 299 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1788  GTP-binding protein Era  41.08 
 
 		 299 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2894  GTP-binding protein Era  41.08 
 
 		 299 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2816  GTP-binding protein Era  41.08 
 
 		 299 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2839  GTP-binding protein Era  41.08 
 
 		 299 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2251  GTP-binding protein Era  38.26 
 
 		 311 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  39.19 
 
 		 311 aa  218  7.999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  38.26 
 
 		 305 aa  217  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  42.46 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  37.54 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3634  GTP-binding protein Era  40.13 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.407522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  40.88 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  40.74 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  38.82 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>