More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2207 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2207  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 307 aa  621  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547377 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  73.11 
 
 		 308 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  64.5 
 
 		 307 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  62.83 
 
 		 308 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  50.83 
 
 		 312 aa  324  9e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2740  GTP-binding protein Era  50.5 
 
 		 305 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  46.33 
 
 		 307 aa  263  3e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  43.89 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0251  GTP-binding protein Era  45.97 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.338146  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  42.9 
 
 		 299 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0951  GTP-binding protein Era  45.64 
 
 		 305 aa  249  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  41.61 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  44.3 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  43.62 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 		 318 aa  242  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  39.09 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  42.24 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2641  GTP-binding protein Era  43.33 
 
 		 320 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  42.19 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  43.33 
 
 		 297 aa  239  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  41.53 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2973  GTP-binding protein Era  44 
 
 		 307 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  37.83 
 
 		 299 aa  238  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  37.83 
 
 		 299 aa  238  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  39.94 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  37.79 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2652  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0337857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  41.75 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4682  GTP-binding protein Era  43.33 
 
 		 308 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  0.813655 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2233  GTP-binding protein Era  42.76 
 
 		 319 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.085201 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  42.05 
 
 		 298 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  43.19 
 
 		 311 aa  235  7e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2613  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 		 307 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  41.67 
 
 		 308 aa  235  8e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2550  GTP-binding protein Era  41.91 
 
 		 326 aa  235  9e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512596  normal  0.0657743 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  42.62 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0656  GTP-binding protein Era  43.52 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.582352  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1917  GTP-binding protein Era  42.24 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0683  GTP-binding protein Era  43.29 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  41.75 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0663  GTP-binding protein Era  43.52 
 
 		 311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.747923  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2275  GTP-binding protein Era  42.24 
 
 		 326 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2626  GTP-binding protein Era  43.67 
 
 		 311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303676  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  40.92 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  36.51 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  40.65 
 
 		 301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  43.52 
 
 		 293 aa  232  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  41.2 
 
 		 303 aa  232  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  41.2 
 
 		 303 aa  232  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  41.2 
 
 		 303 aa  232  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  39.74 
 
 		 294 aa  232  6e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 301 aa  232  6e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2242  GTP-binding protein Era  42.67 
 
 		 298 aa  232  6e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709672 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2250  GTP-binding protein Era  42.62 
 
 		 305 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3053  GTP-binding protein Era  41.56 
 
 		 301 aa  231  8.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.0104922 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  40.59 
 
 		 300 aa  231  8.000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1212  GTP-binding protein Era  42.33 
 
 		 297 aa  231  8.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  41.42 
 
 		 303 aa  231  8.000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  39.93 
 
 		 296 aa  231  9e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  37.79 
 
 		 301 aa  231  9e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  42.19 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 		 338 aa  230  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3668  GTP-binding protein Era  40.26 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7362  GTP-binding protein Era  42.52 
 
 		 320 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448501  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  39.06 
 
 		 311 aa  229  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  41.2 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 298 aa  230  3e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1279  GTP-binding protein Era  39.53 
 
 		 338 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.446406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1069  GTP-binding protein Era  40.65 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1202  GTP-binding protein Era  39.53 
 
 		 338 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3111  GTP-binding protein Era  39.53 
 
 		 338 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00956624  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1246  GTP-binding protein Era  39.53 
 
 		 338 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  39.06 
 
 		 311 aa  229  5e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1450  GTP-binding protein Era  42.76 
 
 		 327 aa  229  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  40.92 
 
 		 297 aa  229  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002498  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 		 320 aa  229  6e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0864  GTP-binding protein Era  43.96 
 
 		 296 aa  229  6e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1008  GTP-binding protein Era  43.96 
 
 		 296 aa  229  6e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.028746 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  39.2 
 
 		 339 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  39.2 
 
 		 339 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  37.99 
 
 		 301 aa  229  6e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3025  GTP-binding protein Era  39.2 
 
 		 339 aa  229  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.118015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  37.66 
 
 		 301 aa  228  7e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  37.66 
 
 		 301 aa  228  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  37.66 
 
 		 301 aa  228  7e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  37.66 
 
 		 301 aa  228  7e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  37.66 
 
 		 301 aa  228  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1244  GTP-binding protein Era  39.2 
 
 		 329 aa  227  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000178109  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1349  GTP-binding protein Era  39.2 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  37.66 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03535  GTP-binding protein Era  39.53 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  40.13 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  37.66 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1122  GTP-binding protein Era  40.86 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2784  GTP-binding protein Era  40.32 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1401  GTP-binding protein Era  40.86 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  37.01 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  39.67 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3882  GTP-binding protein Era  41.61 
 
 		 385 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.170748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>