More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1450 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1450  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 327 aa  676    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0683  GTP-binding protein Era  85.38 
 
 		 310 aa  548  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1152  GTP-binding protein Era  85.81 
 
 		 313 aa  527  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0999  GTP-binding protein Era  86.15 
 
 		 313 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17106  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0951  GTP-binding protein Era  73.47 
 
 		 305 aa  471  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0663  GTP-binding protein Era  73.81 
 
 		 311 aa  464  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.747923  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2626  GTP-binding protein Era  74.49 
 
 		 311 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303676  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0656  GTP-binding protein Era  73.81 
 
 		 311 aa  464  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.582352  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0474  GTP-binding protein Era  64.43 
 
 		 301 aa  409  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2641  GTP-binding protein Era  63.93 
 
 		 320 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3882  GTP-binding protein Era  64.53 
 
 		 385 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.170748 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1917  GTP-binding protein Era  65.2 
 
 		 303 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2250  GTP-binding protein Era  64.75 
 
 		 305 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  62.84 
 
 		 318 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2973  GTP-binding protein Era  62.17 
 
 		 307 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4682  GTP-binding protein Era  63.18 
 
 		 308 aa  394  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  0.813655 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7362  GTP-binding protein Era  63.39 
 
 		 320 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448501  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6613  GTP-binding protein Era  63.39 
 
 		 315 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0990  GTP-binding protein Era  65.53 
 
 		 310 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2652  GTP-binding protein Era  63.18 
 
 		 307 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0337857 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2613  GTP-binding protein Era  63.18 
 
 		 307 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2275  GTP-binding protein Era  62.93 
 
 		 326 aa  381  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2233  GTP-binding protein Era  59.38 
 
 		 319 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.085201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2550  GTP-binding protein Era  63.27 
 
 		 326 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512596  normal  0.0657743 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3454  GTP-binding protein Era  59.35 
 
 		 332 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2440  GTP-binding protein Era  61.56 
 
 		 316 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0418  GTP-binding protein Era  61.82 
 
 		 303 aa  362  5.0000000000000005e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0524  GTP-binding protein Era  58.31 
 
 		 312 aa  354  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1676  GTP-binding protein Era  61.15 
 
 		 304 aa  348  6e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.022599  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0309  GTP-binding protein Era  61.15 
 
 		 304 aa  348  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2570  GTP-binding protein Era  61.15 
 
 		 304 aa  348  7e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0201  GTP-binding protein Era  60.13 
 
 		 308 aa  348  7e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.377172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  56.12 
 
 		 309 aa  348  8e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2558  GTP-binding protein Era  60.34 
 
 		 301 aa  345  8.999999999999999e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.693757  hitchhiker  0.00166668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1738  GTP-binding protein Era  55.37 
 
 		 329 aa  341  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355873  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  53.95 
 
 		 297 aa  322  6e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1570  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 314 aa  310  2e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1212  GTP-binding protein Era  50.86 
 
 		 297 aa  308  5.9999999999999995e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  51.2 
 
 		 297 aa  301  9e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  50.68 
 
 		 297 aa  300  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0251  GTP-binding protein Era  48.97 
 
 		 295 aa  281  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.338146  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0476  GTP-binding protein Era  49.09 
 
 		 296 aa  271  1e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0743  GTP-binding protein Era  48.94 
 
 		 294 aa  270  2.9999999999999997e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0550  GTP-binding protein Era  48.72 
 
 		 296 aa  264  1e-69  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0497931  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0959  GTP-binding protein Era  45.55 
 
 		 308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  45.17 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  43.67 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  42.21 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  41.92 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  40.68 
 
 		 303 aa  232  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  40.48 
 
 		 301 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  43.26 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  40.97 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  41.58 
 
 		 297 aa  229  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2207  GTP-binding protein Era  42.76 
 
 		 307 aa  229  5e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547377 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  40.14 
 
 		 301 aa  228  9e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  42.27 
 
 		 302 aa  228  9e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  41.1 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  39.79 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  39.79 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  39.79 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  39.79 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  39.79 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  39.79 
 
 		 301 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  39.79 
 
 		 301 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  39.58 
 
 		 293 aa  226  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  42.27 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  42.07 
 
 		 300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  39.45 
 
 		 301 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  41.22 
 
 		 303 aa  226  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  39.1 
 
 		 301 aa  225  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  41.64 
 
 		 324 aa  225  6e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  44.11 
 
 		 312 aa  225  7e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  41.44 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  41.08 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  41.52 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  41.52 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  39.73 
 
 		 298 aa  222  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  39.8 
 
 		 308 aa  222  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  41.18 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  37.15 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  39.58 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2740  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 		 305 aa  220  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  40.75 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  41.78 
 
 		 300 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  41.16 
 
 		 307 aa  212  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  41.78 
 
 		 301 aa  212  7e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  39.45 
 
 		 301 aa  212  7e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  40.21 
 
 		 296 aa  212  9e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  40.55 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  41.95 
 
 		 489 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  38.54 
 
 		 294 aa  210  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  38.28 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  40.75 
 
 		 303 aa  209  5e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  38.14 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  40.89 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  39.14 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  41.38 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  38.75 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  39.29 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>