More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2875 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 318 aa  652    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0683  GTP-binding protein Era  67.67 
 
 		 310 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7362  GTP-binding protein Era  64.22 
 
 		 320 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448501  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6613  GTP-binding protein Era  65.71 
 
 		 315 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_004310  BR0663  GTP-binding protein Era  64.33 
 
 		 311 aa  408  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.747923  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2626  GTP-binding protein Era  65 
 
 		 311 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303676  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0990  GTP-binding protein Era  62.99 
 
 		 310 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0951  GTP-binding protein Era  66.33 
 
 		 305 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0656  GTP-binding protein Era  64.33 
 
 		 311 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.582352  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4682  GTP-binding protein Era  63.51 
 
 		 308 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  0.813655 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0999  GTP-binding protein Era  65.77 
 
 		 313 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17106  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2275  GTP-binding protein Era  60.49 
 
 		 326 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1152  GTP-binding protein Era  66.33 
 
 		 313 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2652  GTP-binding protein Era  62.58 
 
 		 307 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0337857 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2233  GTP-binding protein Era  64.29 
 
 		 319 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.085201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2550  GTP-binding protein Era  60.8 
 
 		 326 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512596  normal  0.0657743 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1450  GTP-binding protein Era  62.84 
 
 		 327 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2613  GTP-binding protein Era  62.58 
 
 		 307 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2641  GTP-binding protein Era  61.34 
 
 		 320 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2973  GTP-binding protein Era  61.59 
 
 		 307 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3454  GTP-binding protein Era  63.39 
 
 		 332 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3882  GTP-binding protein Era  60.94 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.170748 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2250  GTP-binding protein Era  61.76 
 
 		 305 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1917  GTP-binding protein Era  61.82 
 
 		 303 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0474  GTP-binding protein Era  59.66 
 
 		 301 aa  379  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1738  GTP-binding protein Era  57.98 
 
 		 329 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355873  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2440  GTP-binding protein Era  62.71 
 
 		 316 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0524  GTP-binding protein Era  60.34 
 
 		 312 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1570  GTP-binding protein Era  58.5 
 
 		 314 aa  365  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  58.05 
 
 		 309 aa  358  6e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2558  GTP-binding protein Era  62.37 
 
 		 301 aa  358  6e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.693757  hitchhiker  0.00166668 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2570  GTP-binding protein Era  62.16 
 
 		 304 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0309  GTP-binding protein Era  61.49 
 
 		 304 aa  353  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1676  GTP-binding protein Era  61.49 
 
 		 304 aa  353  2e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.022599  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1212  GTP-binding protein Era  57.88 
 
 		 297 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0418  GTP-binding protein Era  61.36 
 
 		 303 aa  351  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0201  GTP-binding protein Era  62.21 
 
 		 308 aa  349  4e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.377172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  55.44 
 
 		 297 aa  339  2.9999999999999998e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  55.82 
 
 		 297 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0251  GTP-binding protein Era  55.14 
 
 		 295 aa  316  3e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.338146  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  50.34 
 
 		 297 aa  298  6e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
NC_002978  WD0743  GTP-binding protein Era  50.52 
 
 		 294 aa  281  1e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0476  GTP-binding protein Era  46.43 
 
 		 296 aa  278  7e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0550  GTP-binding protein Era  46.43 
 
 		 296 aa  272  6e-72  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0497931  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0959  GTP-binding protein Era  47.87 
 
 		 308 aa  258  1e-67  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  43.3 
 
 		 297 aa  248  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  43.3 
 
 		 297 aa  246  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  41.87 
 
 		 300 aa  245  8e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  45.07 
 
 		 324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2207  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 		 307 aa  242  5e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547377 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  41.95 
 
 		 307 aa  238  9e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  40.75 
 
 		 303 aa  235  6e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  42.76 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  44.29 
 
 		 303 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  43.1 
 
 		 303 aa  233  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  43.86 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  44.67 
 
 		 312 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  42.12 
 
 		 298 aa  229  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  43.1 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  43.84 
 
 		 301 aa  229  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2740  GTP-binding protein Era  42.28 
 
 		 305 aa  228  9e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  42.18 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  43.15 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1069  GTP-binding protein Era  43.49 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  41.78 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3726  GTP-binding protein Era  43.59 
 
 		 340 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.251603 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  38.59 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  42.96 
 
 		 293 aa  222  6e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  39.79 
 
 		 293 aa  222  7e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2784  GTP-binding protein Era  43.15 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  41.38 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3668  GTP-binding protein Era  42.07 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  40.48 
 
 		 307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  41.41 
 
 		 303 aa  219  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  41.41 
 
 		 303 aa  219  6e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  41.41 
 
 		 303 aa  219  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  41.24 
 
 		 299 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  38.99 
 
 		 307 aa  218  8.999999999999998e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  42.32 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  37.59 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  42.32 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  39.52 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  38.49 
 
 		 302 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  39.73 
 
 		 303 aa  217  2.9999999999999998e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  40.21 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  38.41 
 
 		 298 aa  216  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  38.28 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  40.51 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  37.93 
 
 		 301 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  37.93 
 
 		 301 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  37.93 
 
 		 301 aa  216  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  37.93 
 
 		 301 aa  216  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  37.93 
 
 		 301 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  38.28 
 
 		 301 aa  216  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1149  GTP-binding protein Era  38.76 
 
 		 335 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.28675  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  37.93 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  39.52 
 
 		 302 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  37.59 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>