More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1570 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1570  GTP-binding protein Era  100 
 
 
314 aa  640    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221135  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1738  GTP-binding protein Era  59.87 
 
 
329 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355873  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  58.5 
 
 
318 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_004310  BR0663  GTP-binding protein Era  54.69 
 
 
311 aa  328  6e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.747923  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0656  GTP-binding protein Era  54.69 
 
 
311 aa  328  6e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.582352  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1212  GTP-binding protein Era  53.07 
 
 
297 aa  328  7e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171275  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  53.23 
 
 
309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  51.79 
 
 
297 aa  327  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0683  GTP-binding protein Era  52.92 
 
 
310 aa  323  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2613  GTP-binding protein Era  52.94 
 
 
307 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3882  GTP-binding protein Era  52.27 
 
 
385 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.170748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7362  GTP-binding protein Era  52.94 
 
 
320 aa  319  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448501  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4682  GTP-binding protein Era  51.63 
 
 
308 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  0.813655 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6613  GTP-binding protein Era  53.92 
 
 
315 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0951  GTP-binding protein Era  52.29 
 
 
305 aa  318  7.999999999999999e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1917  GTP-binding protein Era  52.23 
 
 
303 aa  318  9e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2973  GTP-binding protein Era  50.98 
 
 
307 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2626  GTP-binding protein Era  52.29 
 
 
311 aa  317  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303676  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2652  GTP-binding protein Era  51.63 
 
 
307 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0337857 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2233  GTP-binding protein Era  52.09 
 
 
319 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.085201 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2641  GTP-binding protein Era  51.31 
 
 
320 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2250  GTP-binding protein Era  51.79 
 
 
305 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1152  GTP-binding protein Era  51.45 
 
 
313 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2275  GTP-binding protein Era  51.31 
 
 
326 aa  311  9e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2550  GTP-binding protein Era  51.63 
 
 
326 aa  311  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512596  normal  0.0657743 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3454  GTP-binding protein Era  52.92 
 
 
332 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136633  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1450  GTP-binding protein Era  50 
 
 
327 aa  310  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0999  GTP-binding protein Era  51.62 
 
 
313 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17106  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0990  GTP-binding protein Era  50 
 
 
310 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  51.47 
 
 
297 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0524  GTP-binding protein Era  48.41 
 
 
312 aa  302  5.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0474  GTP-binding protein Era  49.19 
 
 
301 aa  301  1e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2440  GTP-binding protein Era  50.98 
 
 
316 aa  295  8e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2570  GTP-binding protein Era  52.08 
 
 
304 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2558  GTP-binding protein Era  50.65 
 
 
301 aa  293  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.693757  hitchhiker  0.00166668 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0418  GTP-binding protein Era  51.13 
 
 
303 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0309  GTP-binding protein Era  50.8 
 
 
304 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939671  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1676  GTP-binding protein Era  50.8 
 
 
304 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.022599  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0201  GTP-binding protein Era  50.16 
 
 
308 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.377172  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  46.56 
 
 
297 aa  280  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0251  GTP-binding protein Era  47.21 
 
 
295 aa  276  4e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.338146  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0743  GTP-binding protein Era  41.33 
 
 
294 aa  240  2.9999999999999997e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0476  GTP-binding protein Era  38.26 
 
 
296 aa  227  3e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  42.3 
 
 
324 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0550  GTP-binding protein Era  38.59 
 
 
296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0497931  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  38.26 
 
 
297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  38.46 
 
 
307 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  38.59 
 
 
303 aa  216  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  38.71 
 
 
298 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  38.69 
 
 
303 aa  210  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  36.96 
 
 
300 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  37.26 
 
 
297 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  37.66 
 
 
308 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  39.56 
 
 
303 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  39.55 
 
 
303 aa  205  7e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  37.14 
 
 
296 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  37.94 
 
 
299 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  38 
 
 
306 aa  203  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  38.64 
 
 
289 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  34.62 
 
 
296 aa  201  9e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  36.96 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  36.3 
 
 
298 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0959  GTP-binding protein Era  36.86 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  35.62 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  35.62 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  39.35 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  37.82 
 
 
302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  35.46 
 
 
301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  38.21 
 
 
308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  36.27 
 
 
308 aa  199  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  35.14 
 
 
301 aa  199  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  35.14 
 
 
301 aa  199  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  35.76 
 
 
303 aa  199  7e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  35.5 
 
 
301 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  35.5 
 
 
301 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  35.5 
 
 
301 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  35.5 
 
 
301 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  35.5 
 
 
301 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  37.14 
 
 
305 aa  198  7.999999999999999e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  34.64 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  34.82 
 
 
301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  35.18 
 
 
301 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  35.18 
 
 
301 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  38 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  35.95 
 
 
299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  37.79 
 
 
303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  35.95 
 
 
299 aa  195  7e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  38.56 
 
 
301 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  36.04 
 
 
302 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  34.73 
 
 
302 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  37.9 
 
 
310 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2207  GTP-binding protein Era  35.78 
 
 
307 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547377 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2156  GTP-binding protein Era  37.86 
 
 
310 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  37.58 
 
 
298 aa  193  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  37.05 
 
 
301 aa  193  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  36.72 
 
 
303 aa  193  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1878  GTP-binding protein Era  35.41 
 
 
295 aa  192  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  38.64 
 
 
301 aa  192  7e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  37.82 
 
 
310 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  38.64 
 
 
312 aa  192  8e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>