More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1806 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 297 aa  597  1e-170  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1212  GTP-binding protein Era  64.19 
 
 		 297 aa  396  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  62.16 
 
 		 297 aa  376  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6613  GTP-binding protein Era  58.9 
 
 		 315 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  55.44 
 
 		 318 aa  339  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2250  GTP-binding protein Era  57.48 
 
 		 305 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2973  GTP-binding protein Era  57.14 
 
 		 307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0990  GTP-binding protein Era  57.14 
 
 		 310 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7362  GTP-binding protein Era  57.88 
 
 		 320 aa  335  5e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448501  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2233  GTP-binding protein Era  56.51 
 
 		 319 aa  333  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.085201 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2613  GTP-binding protein Era  56.12 
 
 		 307 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2652  GTP-binding protein Era  54.76 
 
 		 307 aa  331  9e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0337857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2641  GTP-binding protein Era  56.12 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2550  GTP-binding protein Era  56.51 
 
 		 326 aa  328  6e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512596  normal  0.0657743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2275  GTP-binding protein Era  56.16 
 
 		 326 aa  328  6e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4682  GTP-binding protein Era  54.79 
 
 		 308 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  0.813655 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1570  GTP-binding protein Era  51.79 
 
 		 314 aa  327  2.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  55.48 
 
 		 309 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3454  GTP-binding protein Era  57.19 
 
 		 332 aa  324  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1917  GTP-binding protein Era  54.73 
 
 		 303 aa  322  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3882  GTP-binding protein Era  55.1 
 
 		 385 aa  321  7e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.170748 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0656  GTP-binding protein Era  53.77 
 
 		 311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.582352  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0663  GTP-binding protein Era  53.77 
 
 		 311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.747923  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2626  GTP-binding protein Era  53.42 
 
 		 311 aa  318  9e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303676  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0951  GTP-binding protein Era  53.42 
 
 		 305 aa  314  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0683  GTP-binding protein Era  53.4 
 
 		 310 aa  311  9e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2440  GTP-binding protein Era  53.77 
 
 		 316 aa  302  4.0000000000000003e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1450  GTP-binding protein Era  51.2 
 
 		 327 aa  301  8.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1152  GTP-binding protein Era  53.58 
 
 		 313 aa  299  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0999  GTP-binding protein Era  53.24 
 
 		 313 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17106  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1738  GTP-binding protein Era  47.71 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355873  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0474  GTP-binding protein Era  48.64 
 
 		 301 aa  288  8e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0524  GTP-binding protein Era  48.99 
 
 		 312 aa  288  1e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0251  GTP-binding protein Era  50.34 
 
 		 295 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.338146  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  47.62 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2558  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.693757  hitchhiker  0.00166668 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1676  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.022599  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0309  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0418  GTP-binding protein Era  48.99 
 
 		 303 aa  270  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0201  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 		 308 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.377172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2570  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_002978  WD0743  GTP-binding protein Era  41.32 
 
 		 294 aa  238  9e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0476  GTP-binding protein Era  39.58 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  41.84 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0550  GTP-binding protein Era  39.15 
 
 		 296 aa  225  8e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0497931  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  42.07 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  39.93 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1244  GTP-binding protein Era  41.78 
 
 		 329 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000178109  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1149  GTP-binding protein Era  41.78 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.28675  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1055  GTP-binding protein Era  41.44 
 
 		 331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.305359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  41.78 
 
 		 314 aa  216  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1038  GTP-binding protein Era  41.78 
 
 		 330 aa  215  7e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00137835  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  40.47 
 
 		 308 aa  215  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  41.44 
 
 		 339 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  41.44 
 
 		 339 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  41.98 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3025  GTP-binding protein Era  41.44 
 
 		 339 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.118015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  40.14 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  38.28 
 
 		 306 aa  213  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  41.25 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  39 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1349  GTP-binding protein Era  41.1 
 
 		 339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3111  GTP-binding protein Era  41.78 
 
 		 338 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00956624  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1246  GTP-binding protein Era  41.78 
 
 		 338 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1279  GTP-binding protein Era  41.78 
 
 		 338 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.446406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1202  GTP-binding protein Era  41.78 
 
 		 338 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  40.69 
 
 		 301 aa  212  7.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  39.73 
 
 		 297 aa  211  9e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02460  GTP-binding protein Era  41.38 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1102  GTP-binding protein Era  41.38 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0130588  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3802  GTP-binding protein Era  41.38 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  41.03 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02424  hypothetical protein  41.38 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2784  GTP-binding protein Era  41.38 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  41.03 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2721  GTP-binding protein Era  41.38 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2207  GTP-binding protein Era  41.91 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547377 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  40.69 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  41.03 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1111  GTP-binding protein Era  41.38 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0881  GTP-binding protein Era  41.44 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427391  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  38.97 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  41.1 
 
 		 338 aa  210  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2765  GTP-binding protein Era  40.27 
 
 		 334 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00576917  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  40.67 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3668  GTP-binding protein Era  41.03 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2719  GTP-binding protein Era  41.03 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0551516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2931  GTP-binding protein Era  41.03 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163008  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2852  GTP-binding protein Era  41.03 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0251331  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1069  GTP-binding protein Era  41.03 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  40.75 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2823  GTP-binding protein Era  41.03 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2958  GTP-binding protein Era  41.03 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2742  GTP-binding protein Era  41.03 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0288239  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2783  GTP-binding protein Era  41.03 
 
 		 301 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  40.4 
 
 		 300 aa  209  6e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2846  GTP-binding protein Era  41.03 
 
 		 301 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal  0.818064 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  38.78 
 
 		 296 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  40.2 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3053  GTP-binding protein Era  41.03 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.0104922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>