More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3454 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3454  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 332 aa  665    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2233  GTP-binding protein Era  84.34 
 
 		 319 aa  550  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.085201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2550  GTP-binding protein Era  81.63 
 
 		 326 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512596  normal  0.0657743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2275  GTP-binding protein Era  81.63 
 
 		 326 aa  536  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6613  GTP-binding protein Era  84.98 
 
 		 315 aa  531  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7362  GTP-binding protein Era  85.1 
 
 		 320 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448501  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4682  GTP-binding protein Era  70.33 
 
 		 308 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  0.813655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2652  GTP-binding protein Era  70.16 
 
 		 307 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0337857 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2613  GTP-binding protein Era  70.16 
 
 		 307 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2641  GTP-binding protein Era  66.77 
 
 		 320 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0990  GTP-binding protein Era  71.19 
 
 		 310 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2973  GTP-binding protein Era  70.37 
 
 		 307 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2250  GTP-binding protein Era  70 
 
 		 305 aa  427  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1917  GTP-binding protein Era  69.57 
 
 		 303 aa  421  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3882  GTP-binding protein Era  66.99 
 
 		 385 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.170748 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2440  GTP-binding protein Era  71.28 
 
 		 316 aa  414  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0663  GTP-binding protein Era  66.33 
 
 		 311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.747923  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2626  GTP-binding protein Era  64.92 
 
 		 311 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303676  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0656  GTP-binding protein Era  66.33 
 
 		 311 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.582352  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0951  GTP-binding protein Era  66 
 
 		 305 aa  398  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  63.39 
 
 		 318 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0474  GTP-binding protein Era  62.03 
 
 		 301 aa  387  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0683  GTP-binding protein Era  62.03 
 
 		 310 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1450  GTP-binding protein Era  59.35 
 
 		 327 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1152  GTP-binding protein Era  61.87 
 
 		 313 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0999  GTP-binding protein Era  61.87 
 
 		 313 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17106  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  59.33 
 
 		 309 aa  359  5e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0524  GTP-binding protein Era  59.02 
 
 		 312 aa  354  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1738  GTP-binding protein Era  55.95 
 
 		 329 aa  348  9e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355873  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2558  GTP-binding protein Era  60.4 
 
 		 301 aa  345  7e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.693757  hitchhiker  0.00166668 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1212  GTP-binding protein Era  58.22 
 
 		 297 aa  342  5e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1676  GTP-binding protein Era  59.08 
 
 		 304 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.022599  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0309  GTP-binding protein Era  59.08 
 
 		 304 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2570  GTP-binding protein Era  59.27 
 
 		 304 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  57.19 
 
 		 297 aa  333  2e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0201  GTP-binding protein Era  59.14 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.377172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0418  GTP-binding protein Era  58.05 
 
 		 303 aa  331  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  54.79 
 
 		 297 aa  325  6e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1570  GTP-binding protein Era  52.92 
 
 		 314 aa  321  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  53.61 
 
 		 297 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0251  GTP-binding protein Era  54.64 
 
 		 295 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.338146  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0476  GTP-binding protein Era  41.79 
 
 		 296 aa  252  5.000000000000001e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0743  GTP-binding protein Era  42.91 
 
 		 294 aa  251  2e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0550  GTP-binding protein Era  41.7 
 
 		 296 aa  245  6.999999999999999e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0497931  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0959  GTP-binding protein Era  43.9 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  44.82 
 
 		 308 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  39.86 
 
 		 300 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  41.61 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2207  GTP-binding protein Era  40.79 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547377 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  44.82 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  41.44 
 
 		 303 aa  226  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  40.34 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  39.66 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  41.64 
 
 		 297 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  41.5 
 
 		 303 aa  222  4.9999999999999996e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  39.31 
 
 		 301 aa  222  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  39.31 
 
 		 301 aa  222  6e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  39.31 
 
 		 301 aa  222  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  39.31 
 
 		 301 aa  222  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  39.31 
 
 		 301 aa  222  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  41.55 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  39.31 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  42.96 
 
 		 293 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  40.21 
 
 		 324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  38.97 
 
 		 301 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  38.97 
 
 		 301 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  41.91 
 
 		 311 aa  219  6e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  40.28 
 
 		 306 aa  218  7.999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  40.86 
 
 		 307 aa  218  7.999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  41.03 
 
 		 298 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  39.86 
 
 		 302 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  40.85 
 
 		 314 aa  218  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  42.61 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  37.37 
 
 		 298 aa  216  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  41.75 
 
 		 303 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  41.64 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 308 aa  212  5.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  37.67 
 
 		 299 aa  212  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  37.67 
 
 		 299 aa  212  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  41.61 
 
 		 451 aa  212  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2740  GTP-binding protein Era  39.6 
 
 		 305 aa  212  9e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  40.21 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  36.99 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  40.48 
 
 		 300 aa  209  7e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3111  GTP-binding protein Era  41.44 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00956624  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1202  GTP-binding protein Era  41.44 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1246  GTP-binding protein Era  41.44 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1279  GTP-binding protein Era  41.44 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.446406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  39.59 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  40.2 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  37.8 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  41.1 
 
 		 338 aa  206  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 449 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  39.52 
 
 		 301 aa  206  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  38.01 
 
 		 298 aa  205  9e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  39.12 
 
 		 307 aa  205  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  39.16 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>