More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0251 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0251  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 295 aa  587  1e-166  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.338146  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  64.63 
 
 		 297 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2652  GTP-binding protein Era  56.66 
 
 		 307 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0337857 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2973  GTP-binding protein Era  55.29 
 
 		 307 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  55.14 
 
 		 318 aa  316  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2613  GTP-binding protein Era  55.63 
 
 		 307 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4682  GTP-binding protein Era  53.08 
 
 		 308 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  0.813655 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1212  GTP-binding protein Era  53.74 
 
 		 297 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2233  GTP-binding protein Era  54.79 
 
 		 319 aa  306  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.085201 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2275  GTP-binding protein Era  54.11 
 
 		 326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2550  GTP-binding protein Era  54.11 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512596  normal  0.0657743 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2250  GTP-binding protein Era  53.24 
 
 		 305 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0951  GTP-binding protein Era  53.42 
 
 		 305 aa  302  5.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1917  GTP-binding protein Era  52.72 
 
 		 303 aa  301  9e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2641  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  51.7 
 
 		 297 aa  299  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3882  GTP-binding protein Era  52.4 
 
 		 385 aa  297  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.170748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3454  GTP-binding protein Era  54.64 
 
 		 332 aa  296  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0990  GTP-binding protein Era  52.58 
 
 		 310 aa  297  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  56.04 
 
 		 309 aa  296  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1738  GTP-binding protein Era  50.49 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355873  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7362  GTP-binding protein Era  52.38 
 
 		 320 aa  295  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448501  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6613  GTP-binding protein Era  53.08 
 
 		 315 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2440  GTP-binding protein Era  52.4 
 
 		 316 aa  291  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0474  GTP-binding protein Era  49.32 
 
 		 301 aa  286  2e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2558  GTP-binding protein Era  54.39 
 
 		 301 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.693757  hitchhiker  0.00166668 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0683  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 310 aa  286  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0524  GTP-binding protein Era  52.2 
 
 		 312 aa  285  5e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0418  GTP-binding protein Era  54.08 
 
 		 303 aa  282  5.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0656  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 311 aa  282  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.582352  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  50.34 
 
 		 297 aa  281  8.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0663  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.747923  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1450  GTP-binding protein Era  48.97 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1152  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 313 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2626  GTP-binding protein Era  49.32 
 
 		 311 aa  277  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303676  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2570  GTP-binding protein Era  54.73 
 
 		 304 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1570  GTP-binding protein Era  47.21 
 
 		 314 aa  276  3e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0999  GTP-binding protein Era  49.66 
 
 		 313 aa  275  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17106  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0309  GTP-binding protein Era  54.05 
 
 		 304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1676  GTP-binding protein Era  54.05 
 
 		 304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.022599  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0201  GTP-binding protein Era  52.88 
 
 		 308 aa  271  8.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.377172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  47 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2207  GTP-binding protein Era  45.97 
 
 		 307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547377 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  42.12 
 
 		 298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  44.26 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0743  GTP-binding protein Era  43.06 
 
 		 294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  44.9 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 		 307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1122  GTP-binding protein Era  44.18 
 
 		 304 aa  229  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1401  GTP-binding protein Era  44.18 
 
 		 304 aa  229  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  42.76 
 
 		 298 aa  229  5e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  42.55 
 
 		 324 aa  229  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0476  GTP-binding protein Era  37.68 
 
 		 296 aa  228  6e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  43.45 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  42.41 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  40.48 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  38.06 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  43 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  45.61 
 
 		 315 aa  223  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0550  GTP-binding protein Era  37.37 
 
 		 296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0497931  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  39.18 
 
 		 303 aa  221  8e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  38.62 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  43.73 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  40.75 
 
 		 303 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  37.72 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  37.72 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  40.75 
 
 		 303 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  40.75 
 
 		 303 aa  220  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  38.28 
 
 		 301 aa  220  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  41.92 
 
 		 307 aa  219  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  38.28 
 
 		 301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  38.28 
 
 		 301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  40.89 
 
 		 297 aa  219  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1038  GTP-binding protein Era  41.16 
 
 		 330 aa  219  6e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00137835  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3111  GTP-binding protein Era  41.16 
 
 		 338 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00956624  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1202  GTP-binding protein Era  41.16 
 
 		 338 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1246  GTP-binding protein Era  41.16 
 
 		 338 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1279  GTP-binding protein Era  41.16 
 
 		 338 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.446406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2765  GTP-binding protein Era  39.12 
 
 		 334 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00576917  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  41.84 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  40.89 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  40.61 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1149  GTP-binding protein Era  40.27 
 
 		 335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.28675  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2156  GTP-binding protein Era  43.71 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  41.67 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1244  GTP-binding protein Era  40.27 
 
 		 329 aa  216  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000178109  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  42.81 
 
 		 312 aa  216  5e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  37.24 
 
 		 301 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  37.24 
 
 		 301 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  37.24 
 
 		 301 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  37.24 
 
 		 301 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  37.24 
 
 		 301 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  37.92 
 
 		 308 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  36.68 
 
 		 299 aa  215  7e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  36.95 
 
 		 294 aa  215  7e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  40.48 
 
 		 338 aa  215  8e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  40.14 
 
 		 334 aa  215  9e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>