More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3882 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3882  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 385 aa  776    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.170748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7362  GTP-binding protein Era  70.53 
 
 		 320 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448501  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6613  GTP-binding protein Era  70.3 
 
 		 315 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2973  GTP-binding protein Era  67.46 
 
 		 307 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0683  GTP-binding protein Era  67.23 
 
 		 310 aa  421  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2641  GTP-binding protein Era  63.95 
 
 		 320 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2652  GTP-binding protein Era  66.44 
 
 		 307 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0337857 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2613  GTP-binding protein Era  66.78 
 
 		 307 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2233  GTP-binding protein Era  62.58 
 
 		 319 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.085201 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0951  GTP-binding protein Era  67.35 
 
 		 305 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1917  GTP-binding protein Era  66.44 
 
 		 303 aa  413  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4682  GTP-binding protein Era  65.08 
 
 		 308 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  0.813655 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0990  GTP-binding protein Era  67.69 
 
 		 310 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2275  GTP-binding protein Era  66.89 
 
 		 326 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2626  GTP-binding protein Era  65.88 
 
 		 311 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303676  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2550  GTP-binding protein Era  67.23 
 
 		 326 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512596  normal  0.0657743 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0656  GTP-binding protein Era  65.65 
 
 		 311 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.582352  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0663  GTP-binding protein Era  65.65 
 
 		 311 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.747923  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2250  GTP-binding protein Era  65.42 
 
 		 305 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3454  GTP-binding protein Era  66.99 
 
 		 332 aa  408  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1450  GTP-binding protein Era  64.53 
 
 		 327 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1152  GTP-binding protein Era  67 
 
 		 313 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0999  GTP-binding protein Era  67.34 
 
 		 313 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17106  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2440  GTP-binding protein Era  66.55 
 
 		 316 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  60.94 
 
 		 318 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0474  GTP-binding protein Era  60.34 
 
 		 301 aa  375  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0524  GTP-binding protein Era  56.35 
 
 		 312 aa  355  8.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  56.19 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0418  GTP-binding protein Era  59.53 
 
 		 303 aa  347  2e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  57.19 
 
 		 297 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2558  GTP-binding protein Era  56.04 
 
 		 301 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.693757  hitchhiker  0.00166668 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0309  GTP-binding protein Era  57.86 
 
 		 304 aa  332  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1676  GTP-binding protein Era  57.86 
 
 		 304 aa  332  6e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.022599  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0201  GTP-binding protein Era  55.15 
 
 		 308 aa  332  9e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.377172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2570  GTP-binding protein Era  56.86 
 
 		 304 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1738  GTP-binding protein Era  52.77 
 
 		 329 aa  323  4e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355873  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  55.1 
 
 		 297 aa  320  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1570  GTP-binding protein Era  52.27 
 
 		 314 aa  320  3.9999999999999996e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1212  GTP-binding protein Era  53.08 
 
 		 297 aa  316  4e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  51.03 
 
 		 297 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0251  GTP-binding protein Era  52.4 
 
 		 295 aa  296  4e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.338146  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0743  GTP-binding protein Era  45.99 
 
 		 294 aa  270  2.9999999999999997e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0476  GTP-binding protein Era  44.29 
 
 		 296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0550  GTP-binding protein Era  43.57 
 
 		 296 aa  248  1e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0497931  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0959  GTP-binding protein Era  40.7 
 
 		 308 aa  227  3e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2207  GTP-binding protein Era  41.61 
 
 		 307 aa  226  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547377 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  42.28 
 
 		 308 aa  226  6e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  41.44 
 
 		 314 aa  222  7e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  39.93 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43907  predicted protein  42.09 
 
 		 351 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  39.26 
 
 		 308 aa  215  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  39.66 
 
 		 297 aa  215  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  42.33 
 
 		 312 aa  215  8e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  38.87 
 
 		 324 aa  215  9e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  37.29 
 
 		 298 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  42.41 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2740  GTP-binding protein Era  39.26 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1149  GTP-binding protein Era  40.14 
 
 		 335 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.28675  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  38.78 
 
 		 298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  39.8 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  39.73 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  39.12 
 
 		 339 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  39.12 
 
 		 339 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3025  GTP-binding protein Era  39.12 
 
 		 339 aa  210  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.118015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  39.19 
 
 		 303 aa  209  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1202  GTP-binding protein Era  39.46 
 
 		 338 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1279  GTP-binding protein Era  39.46 
 
 		 338 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.446406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1246  GTP-binding protein Era  39.46 
 
 		 338 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3111  GTP-binding protein Era  39.46 
 
 		 338 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00956624  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  39.12 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2765  GTP-binding protein Era  37.99 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00576917  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1349  GTP-binding protein Era  38.78 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1244  GTP-binding protein Era  39.46 
 
 		 329 aa  208  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000178109  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  39.32 
 
 		 300 aa  206  4e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  39.22 
 
 		 306 aa  206  7e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1055  GTP-binding protein Era  39.46 
 
 		 331 aa  205  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.305359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  39.73 
 
 		 300 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1038  GTP-binding protein Era  39.46 
 
 		 330 aa  204  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00137835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0881  GTP-binding protein Era  38.78 
 
 		 332 aa  203  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427391  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3726  GTP-binding protein Era  41.67 
 
 		 340 aa  202  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.251603 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2784  GTP-binding protein Era  41.02 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  39.66 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  38.7 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  37.46 
 
 		 300 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  45.9 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  41.24 
 
 		 293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  42.81 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  38.75 
 
 		 303 aa  199  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  37.67 
 
 		 303 aa  199  7.999999999999999e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1069  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3802  GTP-binding protein Era  39.53 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  34.83 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  35.4 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  38.75 
 
 		 289 aa  196  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  39.66 
 
 		 301 aa  196  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02460  GTP-binding protein Era  39.19 
 
 		 301 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1102  GTP-binding protein Era  39.19 
 
 		 301 aa  195  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0130588  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1111  GTP-binding protein Era  39.19 
 
 		 301 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2721  GTP-binding protein Era  39.19 
 
 		 301 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>