More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3726 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3726  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 340 aa  679    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.251603 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  43.03 
 
 		 303 aa  262  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  45.43 
 
 		 297 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  46.13 
 
 		 298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  43.22 
 
 		 297 aa  250  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  43.04 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  43.09 
 
 		 307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  43.87 
 
 		 299 aa  243  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  42.26 
 
 		 295 aa  239  5e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1685  GTP-binding protein Era  42.26 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  42.68 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  41.08 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  44.59 
 
 		 315 aa  236  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  43.45 
 
 		 302 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2740  GTP-binding protein Era  42.81 
 
 		 305 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  41.01 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  42.07 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  41.4 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  39.81 
 
 		 302 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1069  GTP-binding protein Era  40.19 
 
 		 301 aa  229  7e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  42.72 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  41.9 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  40.82 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  44.41 
 
 		 310 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  39.49 
 
 		 300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  44.09 
 
 		 310 aa  225  8e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2207  GTP-binding protein Era  41.75 
 
 		 307 aa  225  8e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547377 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2784  GTP-binding protein Era  39.56 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  40.45 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  39.62 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2742  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0288239  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2958  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2823  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2783  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  39.62 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2846  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal  0.818064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  43.59 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  37.97 
 
 		 314 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  43.45 
 
 		 310 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  39.23 
 
 		 307 aa  222  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3802  GTP-binding protein Era  40.45 
 
 		 301 aa  222  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02460  GTP-binding protein Era  40.45 
 
 		 301 aa  221  9e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1102  GTP-binding protein Era  40.45 
 
 		 301 aa  221  9e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0130588  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1111  GTP-binding protein Era  40.45 
 
 		 301 aa  221  9e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02424  hypothetical protein  40.45 
 
 		 301 aa  221  9e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2721  GTP-binding protein Era  40.45 
 
 		 301 aa  221  9e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  41.03 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2719  GTP-binding protein Era  40.45 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0551516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2852  GTP-binding protein Era  40.45 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0251331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2931  GTP-binding protein Era  40.45 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163008  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  41.28 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3053  GTP-binding protein Era  39.56 
 
 		 301 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.0104922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  39.12 
 
 		 311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  38.29 
 
 		 303 aa  220  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  38.29 
 
 		 303 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1122  GTP-binding protein Era  40.63 
 
 		 304 aa  220  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  38.29 
 
 		 303 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1401  GTP-binding protein Era  40.63 
 
 		 304 aa  220  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  39.43 
 
 		 300 aa  219  6e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  40.13 
 
 		 306 aa  219  7e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 312 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  40.75 
 
 		 308 aa  218  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2242  GTP-binding protein Era  38.92 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2244  GTP-binding protein Era  39.17 
 
 		 305 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  35.87 
 
 		 303 aa  217  2.9999999999999998e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  38.26 
 
 		 300 aa  216  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  39.23 
 
 		 299 aa  216  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  39.23 
 
 		 299 aa  216  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0881  GTP-binding protein Era  36.69 
 
 		 332 aa  216  7e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427391  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  36.31 
 
 		 301 aa  215  8e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  40.06 
 
 		 300 aa  215  9e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  36.1 
 
 		 339 aa  215  9e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  36.1 
 
 		 339 aa  215  9e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3025  GTP-binding protein Era  36.1 
 
 		 339 aa  215  9e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.118015  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1349  GTP-binding protein Era  36.1 
 
 		 339 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2156  GTP-binding protein Era  41.59 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  36.77 
 
 		 301 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  36.77 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  36.77 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  37.74 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  36.77 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  36.77 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  37.18 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  36.77 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  40.13 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54320  GTP-binding protein Era  40.81 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  36.21 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  37.62 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  40.45 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  36.45 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4748  GTP-binding protein Era  40.88 
 
 		 302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0521069  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1754  GTP-binding protein Era  40.13 
 
 		 302 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.141942  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  38.19 
 
 		 300 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  36.45 
 
 		 301 aa  212  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  36.45 
 
 		 301 aa  212  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  36.13 
 
 		 301 aa  212  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0683  GTP-binding protein Era  43.63 
 
 		 310 aa  212  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  36.19 
 
 		 305 aa  212  7e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  37.18 
 
 		 311 aa  212  9e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>