More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1122 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1401  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 304 aa  609  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1122  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 304 aa  609  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  49.18 
 
 		 306 aa  288  9e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  50.52 
 
 		 315 aa  286  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  48.29 
 
 		 298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0033  GTP-binding protein Era  48.85 
 
 		 305 aa  280  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1244  GTP-binding protein Era  45.13 
 
 		 329 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000178109  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2242  GTP-binding protein Era  47.8 
 
 		 298 aa  272  5.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709672 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  45.89 
 
 		 298 aa  271  7e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  46.23 
 
 		 298 aa  271  9e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  44.41 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  44.41 
 
 		 300 aa  269  4e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1149  GTP-binding protein Era  45.1 
 
 		 335 aa  269  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.28675  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4748  GTP-binding protein Era  47.28 
 
 		 302 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0521069  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  43.1 
 
 		 311 aa  269  5e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  43.1 
 
 		 311 aa  268  7e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0995  GTP-binding protein Era  47.26 
 
 		 300 aa  268  8e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  45.55 
 
 		 334 aa  268  8e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54320  GTP-binding protein Era  46.94 
 
 		 305 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1055  GTP-binding protein Era  45.1 
 
 		 331 aa  267  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.305359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  43.33 
 
 		 314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  45.92 
 
 		 339 aa  265  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  45.92 
 
 		 339 aa  265  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3025  GTP-binding protein Era  45.92 
 
 		 339 aa  265  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.118015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1074  GTP-binding protein Era  47.95 
 
 		 300 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4287  GTP-binding protein Era  47.95 
 
 		 300 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1349  GTP-binding protein Era  45.92 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  45.58 
 
 		 338 aa  264  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2244  GTP-binding protein Era  47.6 
 
 		 305 aa  265  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1434  GTP-binding protein Era  47.6 
 
 		 302 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1202  GTP-binding protein Era  44.56 
 
 		 338 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4373  GTP-binding protein Era  47.6 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212808 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1279  GTP-binding protein Era  44.56 
 
 		 338 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.446406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3111  GTP-binding protein Era  44.56 
 
 		 338 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00956624  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1246  GTP-binding protein Era  44.56 
 
 		 338 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1069  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 		 301 aa  261  8e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  43.58 
 
 		 303 aa  261  8.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  46.21 
 
 		 308 aa  261  8.999999999999999e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  43.58 
 
 		 303 aa  261  8.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  43.58 
 
 		 303 aa  261  8.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1038  GTP-binding protein Era  45.58 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00137835  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4216  GTP-binding protein Era  46.23 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305152  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 		 299 aa  261  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3950  GTP-binding protein Era  46.23 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2765  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 		 334 aa  260  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00576917  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0881  GTP-binding protein Era  45.18 
 
 		 332 aa  260  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427391  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  44.3 
 
 		 314 aa  259  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  45.02 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  44.48 
 
 		 300 aa  258  6e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3053  GTP-binding protein Era  45.79 
 
 		 301 aa  258  7e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.0104922 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2784  GTP-binding protein Era  44.11 
 
 		 301 aa  258  8e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01718  GTP-binding protein Era  49.47 
 
 		 285 aa  258  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.515078  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1754  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.141942  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13790  GTP-binding protein Era  45.61 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264209  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  43.99 
 
 		 294 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  43.15 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0655  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 		 299 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1135  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 		 299 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  43.34 
 
 		 300 aa  256  4e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1685  GTP-binding protein Era  44.67 
 
 		 295 aa  255  5e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  42.81 
 
 		 301 aa  256  5e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4247  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 		 299 aa  255  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1476  GTP-binding protein Era  46.23 
 
 		 299 aa  255  8e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0375  GTP-binding protein Era  44.59 
 
 		 339 aa  254  9e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.426985  hitchhiker  0.000823221 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02460  GTP-binding protein Era  45.45 
 
 		 301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1102  GTP-binding protein Era  45.45 
 
 		 301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0130588  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1111  GTP-binding protein Era  45.45 
 
 		 301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3668  GTP-binding protein Era  42.09 
 
 		 302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2721  GTP-binding protein Era  45.45 
 
 		 301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1011  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 		 299 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262432  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02424  hypothetical protein  45.45 
 
 		 301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  43.84 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2931  GTP-binding protein Era  45.45 
 
 		 301 aa  253  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163008  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2524  GTP-binding protein Era  42.62 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00258575  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2719  GTP-binding protein Era  45.45 
 
 		 301 aa  253  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0551516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2852  GTP-binding protein Era  45.45 
 
 		 301 aa  253  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0251331  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 		 293 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2958  GTP-binding protein Era  45.15 
 
 		 301 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2823  GTP-binding protein Era  45.15 
 
 		 301 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2742  GTP-binding protein Era  45.15 
 
 		 301 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0288239  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3802  GTP-binding protein Era  45.45 
 
 		 301 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  43.49 
 
 		 300 aa  251  8.000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2846  GTP-binding protein Era  44.82 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal  0.818064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2783  GTP-binding protein Era  44.82 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3060  GTP-binding protein Era  44.74 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.547585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0334  GTP-binding protein Era  42.3 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.94828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1731  GTP-binding protein Era  44.03 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3634  GTP-binding protein Era  44.59 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.407522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0597  GTP-binding protein Era  44.3 
 
 		 348 aa  250  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0368  GTP-binding protein Era  42.3 
 
 		 338 aa  250  3e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0276101 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03535  GTP-binding protein Era  41.41 
 
 		 320 aa  249  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2169  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 		 299 aa  249  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0368513  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1093  GTP-binding protein Era  44.25 
 
 		 287 aa  248  9e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2465  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 		 311 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0544  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 		 299 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2894  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 		 299 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1788  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 		 299 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2778  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 		 299 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2038  GTP-binding protein Era  42.76 
 
 		 324 aa  248  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.655908  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2839  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 		 299 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>