More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0371 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 307 aa  629  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  66.12 
 
 		 308 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2207  GTP-binding protein Era  64.5 
 
 		 307 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547377 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  61.13 
 
 		 308 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2740  GTP-binding protein Era  50.5 
 
 		 305 aa  315  4e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  51.17 
 
 		 312 aa  315  7e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  43.33 
 
 		 307 aa  255  6e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  42.9 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  42.24 
 
 		 296 aa  249  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  43.29 
 
 		 299 aa  244  9e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2233  GTP-binding protein Era  43.62 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.085201 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  41.37 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  41.81 
 
 		 302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  46.31 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2250  GTP-binding protein Era  42.28 
 
 		 305 aa  242  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2641  GTP-binding protein Era  42.28 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  43.33 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4682  GTP-binding protein Era  43.29 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  0.813655 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2550  GTP-binding protein Era  43.29 
 
 		 326 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512596  normal  0.0657743 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  41.75 
 
 		 296 aa  239  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  38.82 
 
 		 301 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  41.95 
 
 		 318 aa  238  8e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1917  GTP-binding protein Era  42.28 
 
 		 303 aa  238  8e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2275  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 		 326 aa  238  8e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  39.8 
 
 		 303 aa  238  8e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  41.61 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1401  GTP-binding protein Era  43.52 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1122  GTP-binding protein Era  43.52 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  42.62 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1754  GTP-binding protein Era  42.62 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.141942  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2973  GTP-binding protein Era  42.62 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  41.64 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0251  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 		 295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.338146  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0951  GTP-binding protein Era  44.3 
 
 		 305 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  39.74 
 
 		 303 aa  235  8e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  41.91 
 
 		 314 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  39.93 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2652  GTP-binding protein Era  41.61 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0337857 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  41.75 
 
 		 303 aa  232  7.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0683  GTP-binding protein Era  42.62 
 
 		 310 aa  232  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  41.75 
 
 		 303 aa  232  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  41.75 
 
 		 303 aa  232  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  40.86 
 
 		 298 aa  231  9e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  38.69 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  38.69 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  38.69 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  38.69 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  38.69 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  39.02 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  43.09 
 
 		 314 aa  230  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  38.69 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2626  GTP-binding protein Era  42.28 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303676  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  38.69 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  41.33 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  38.03 
 
 		 301 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1069  GTP-binding protein Era  40.85 
 
 		 301 aa  230  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  39.6 
 
 		 297 aa  230  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  39.94 
 
 		 300 aa  229  3e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  40.46 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  40.79 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3668  GTP-binding protein Era  41.12 
 
 		 302 aa  229  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2613  GTP-binding protein Era  41.95 
 
 		 307 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  39.26 
 
 		 307 aa  228  8e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  38.36 
 
 		 301 aa  228  9e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  41.47 
 
 		 309 aa  228  9e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0990  GTP-binding protein Era  42.28 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7362  GTP-binding protein Era  41.53 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448501  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2784  GTP-binding protein Era  40.85 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  40.6 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6613  GTP-binding protein Era  41.95 
 
 		 315 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_004310  BR0663  GTP-binding protein Era  40.94 
 
 		 311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.747923  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0656  GTP-binding protein Era  40.94 
 
 		 311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.582352  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  39.26 
 
 		 297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2251  GTP-binding protein Era  40.53 
 
 		 311 aa  225  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1212  GTP-binding protein Era  41.95 
 
 		 297 aa  225  6e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  40.13 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  37.25 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3802  GTP-binding protein Era  42.81 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3053  GTP-binding protein Era  41.78 
 
 		 301 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.0104922 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1450  GTP-binding protein Era  41.08 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0864  GTP-binding protein Era  41.47 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1008  GTP-binding protein Era  41.47 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.028746 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  42.09 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  41.58 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1731  GTP-binding protein Era  40.78 
 
 		 305 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000233953  decreased coverage  0.0035862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3726  GTP-binding protein Era  39.23 
 
 		 340 aa  222  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.251603 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1152  GTP-binding protein Era  41.08 
 
 		 313 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002498  GTP-binding protein Era  39.46 
 
 		 320 aa  222  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  41.58 
 
 		 300 aa  222  6e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  36.63 
 
 		 303 aa  222  7e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02460  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 		 301 aa  222  8e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1102  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 		 301 aa  222  8e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0130588  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1111  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 		 301 aa  222  8e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2721  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 		 301 aa  222  8e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02424  hypothetical protein  42.47 
 
 		 301 aa  222  8e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2852  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 		 301 aa  221  9e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0251331  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2719  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 		 301 aa  221  9e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0551516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2931  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 		 301 aa  221  9e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163008  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2765  GTP-binding protein Era  40.74 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00576917  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  42 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>