More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2626 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2626  GTP-binding protein Era  100 
 
 
311 aa  639    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303676  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0663  GTP-binding protein Era  92.93 
 
 
311 aa  598  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.747923  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0656  GTP-binding protein Era  93.25 
 
 
311 aa  600  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.582352  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0951  GTP-binding protein Era  75.75 
 
 
305 aa  477  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0683  GTP-binding protein Era  75.5 
 
 
310 aa  475  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1450  GTP-binding protein Era  74.49 
 
 
327 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0999  GTP-binding protein Era  74.41 
 
 
313 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17106  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1152  GTP-binding protein Era  74.66 
 
 
313 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0474  GTP-binding protein Era  71.48 
 
 
301 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2973  GTP-binding protein Era  69.41 
 
 
307 aa  434  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2641  GTP-binding protein Era  68.42 
 
 
320 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0990  GTP-binding protein Era  68.37 
 
 
310 aa  423  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2652  GTP-binding protein Era  66.78 
 
 
307 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0337857 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2613  GTP-binding protein Era  69.05 
 
 
307 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6613  GTP-binding protein Era  65.18 
 
 
315 aa  417  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7362  GTP-binding protein Era  66.02 
 
 
320 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448501  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4682  GTP-binding protein Era  66.45 
 
 
308 aa  414  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  0.813655 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2250  GTP-binding protein Era  67.35 
 
 
305 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1917  GTP-binding protein Era  67 
 
 
303 aa  413  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2233  GTP-binding protein Era  65.37 
 
 
319 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.085201 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3882  GTP-binding protein Era  65.88 
 
 
385 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.170748 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2550  GTP-binding protein Era  67.23 
 
 
326 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512596  normal  0.0657743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  65 
 
 
318 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2275  GTP-binding protein Era  66.89 
 
 
326 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2440  GTP-binding protein Era  65.99 
 
 
316 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3454  GTP-binding protein Era  64.92 
 
 
332 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136633  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0524  GTP-binding protein Era  58.98 
 
 
312 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0418  GTP-binding protein Era  62.5 
 
 
303 aa  368  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1676  GTP-binding protein Era  63.51 
 
 
304 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.022599  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0309  GTP-binding protein Era  63.51 
 
 
304 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939671  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2570  GTP-binding protein Era  63.18 
 
 
304 aa  362  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  56.25 
 
 
309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2558  GTP-binding protein Era  60.34 
 
 
301 aa  354  1e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.693757  hitchhiker  0.00166668 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0201  GTP-binding protein Era  60.54 
 
 
308 aa  352  4e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.377172  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1738  GTP-binding protein Era  53.99 
 
 
329 aa  342  5e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355873  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  55.82 
 
 
297 aa  332  4e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1212  GTP-binding protein Era  54.79 
 
 
297 aa  320  3e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171275  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  53.42 
 
 
297 aa  318  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1570  GTP-binding protein Era  52.29 
 
 
314 aa  317  1e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221135  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  51.71 
 
 
297 aa  315  6e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0251  GTP-binding protein Era  49.32 
 
 
295 aa  277  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.338146  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0476  GTP-binding protein Era  48 
 
 
296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0743  GTP-binding protein Era  47.06 
 
 
294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0550  GTP-binding protein Era  47.62 
 
 
296 aa  263  3e-69  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0497931  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0959  GTP-binding protein Era  48.29 
 
 
308 aa  263  3e-69  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 
324 aa  238  6.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  44.95 
 
 
312 aa  235  6e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2207  GTP-binding protein Era  43.67 
 
 
307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547377 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  44.3 
 
 
308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  40.89 
 
 
302 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  39.31 
 
 
301 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  42.28 
 
 
307 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  39.06 
 
 
303 aa  230  3e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  42.41 
 
 
303 aa  229  5e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  41.3 
 
 
297 aa  229  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  39.8 
 
 
308 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  43.6 
 
 
306 aa  228  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  38.28 
 
 
301 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  40.83 
 
 
303 aa  226  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  37.93 
 
 
301 aa  225  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  37.93 
 
 
301 aa  225  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  37.93 
 
 
301 aa  225  7e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  37.93 
 
 
301 aa  225  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  37.93 
 
 
301 aa  225  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  37.93 
 
 
301 aa  225  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  37.93 
 
 
301 aa  225  7e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  39.66 
 
 
299 aa  225  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  37.59 
 
 
301 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  39.18 
 
 
302 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  37.24 
 
 
301 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 
303 aa  223  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  38.41 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  38.36 
 
 
298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  38.49 
 
 
300 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  39.66 
 
 
298 aa  219  5e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  39.31 
 
 
302 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  40.89 
 
 
303 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  37.02 
 
 
298 aa  217  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  38.14 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  40.64 
 
 
301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  38.83 
 
 
297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  40.21 
 
 
300 aa  216  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  38.14 
 
 
299 aa  216  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  38.14 
 
 
299 aa  216  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  41.36 
 
 
307 aa  216  5.9999999999999996e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  37.02 
 
 
293 aa  215  7e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  37.76 
 
 
307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  39.86 
 
 
308 aa  211  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  40.48 
 
 
297 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  41.58 
 
 
293 aa  209  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  39.12 
 
 
300 aa  209  7e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  42.52 
 
 
449 aa  208  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  40.57 
 
 
300 aa  207  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2740  GTP-binding protein Era  38.59 
 
 
305 aa  207  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  40.86 
 
 
299 aa  207  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  40.27 
 
 
301 aa  206  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  40.27 
 
 
301 aa  206  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3726  GTP-binding protein Era  40.62 
 
 
340 aa  206  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.251603 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  38.18 
 
 
296 aa  205  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  37.07 
 
 
303 aa  205  7e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>