More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0208 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 297 aa  595  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1212  GTP-binding protein Era  67.34 
 
 		 297 aa  410  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  62.16 
 
 		 297 aa  376  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2973  GTP-binding protein Era  58.56 
 
 		 307 aa  348  9e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1917  GTP-binding protein Era  57.82 
 
 		 303 aa  345  4e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2641  GTP-binding protein Era  57.19 
 
 		 320 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  59.25 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2250  GTP-binding protein Era  57.19 
 
 		 305 aa  341  7e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7362  GTP-binding protein Era  57.53 
 
 		 320 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448501  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3882  GTP-binding protein Era  57.19 
 
 		 385 aa  340  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.170748 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  55.82 
 
 		 318 aa  338  5e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0951  GTP-binding protein Era  55.14 
 
 		 305 aa  337  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6613  GTP-binding protein Era  56.85 
 
 		 315 aa  335  7e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4682  GTP-binding protein Era  56.16 
 
 		 308 aa  335  7.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  0.813655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2652  GTP-binding protein Era  55.82 
 
 		 307 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0337857 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2550  GTP-binding protein Era  55.48 
 
 		 326 aa  334  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512596  normal  0.0657743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2233  GTP-binding protein Era  55.48 
 
 		 319 aa  333  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.085201 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2626  GTP-binding protein Era  55.82 
 
 		 311 aa  332  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303676  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2275  GTP-binding protein Era  55.14 
 
 		 326 aa  332  6e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0656  GTP-binding protein Era  56.16 
 
 		 311 aa  331  7.000000000000001e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.582352  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0683  GTP-binding protein Era  56.85 
 
 		 310 aa  331  8e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2613  GTP-binding protein Era  56.85 
 
 		 307 aa  331  8e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0663  GTP-binding protein Era  56.16 
 
 		 311 aa  331  9e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.747923  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0990  GTP-binding protein Era  54.45 
 
 		 310 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  54.08 
 
 		 297 aa  323  3e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1450  GTP-binding protein Era  53.95 
 
 		 327 aa  322  5e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3454  GTP-binding protein Era  54.79 
 
 		 332 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1152  GTP-binding protein Era  55.33 
 
 		 313 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0999  GTP-binding protein Era  54.98 
 
 		 313 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17106  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1738  GTP-binding protein Era  50.65 
 
 		 329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355873  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1570  GTP-binding protein Era  51.47 
 
 		 314 aa  308  9e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0474  GTP-binding protein Era  51.03 
 
 		 301 aa  305  7e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0251  GTP-binding protein Era  51.7 
 
 		 295 aa  299  4e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.338146  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2558  GTP-binding protein Era  54.18 
 
 		 301 aa  295  5e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.693757  hitchhiker  0.00166668 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2440  GTP-binding protein Era  51.71 
 
 		 316 aa  291  9e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0524  GTP-binding protein Era  50.34 
 
 		 312 aa  288  8e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0201  GTP-binding protein Era  53.2 
 
 		 308 aa  287  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.377172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2570  GTP-binding protein Era  52.51 
 
 		 304 aa  278  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0309  GTP-binding protein Era  52.17 
 
 		 304 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1676  GTP-binding protein Era  52.17 
 
 		 304 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.022599  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0418  GTP-binding protein Era  51.33 
 
 		 303 aa  275  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0743  GTP-binding protein Era  42.24 
 
 		 294 aa  251  1e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  43.33 
 
 		 307 aa  241  9e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2207  GTP-binding protein Era  43.33 
 
 		 307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547377 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  44.71 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0476  GTP-binding protein Era  39.15 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  40.34 
 
 		 298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0550  GTP-binding protein Era  40.36 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0497931  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  40.8 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  39.86 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  38.57 
 
 		 306 aa  229  5e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  41.2 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  39.39 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  38.01 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  43.71 
 
 		 312 aa  219  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2740  GTP-binding protein Era  42.33 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  37.93 
 
 		 299 aa  215  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  39.12 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  39.93 
 
 		 296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  38.72 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  41.69 
 
 		 300 aa  212  7e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  35.96 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  39.38 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  39.04 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  39.31 
 
 		 302 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  36.21 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  38.75 
 
 		 289 aa  208  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  36.21 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  36.21 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  36.21 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  37.67 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  36.21 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  39.33 
 
 		 300 aa  208  1e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  36.21 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  36.21 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3777  GTP-binding protein Era  35.35 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  40.21 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  36.21 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  38.06 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  36.68 
 
 		 300 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  37.5 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  37.11 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  35.86 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  35.86 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  39.8 
 
 		 296 aa  205  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1401  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 		 304 aa  205  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  35.52 
 
 		 301 aa  205  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1122  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 		 304 aa  205  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0959  GTP-binding protein Era  38.78 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  37.29 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  39.67 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  39.8 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1279  GTP-binding protein Era  39.38 
 
 		 338 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.446406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  37.5 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1202  GTP-binding protein Era  39.38 
 
 		 338 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  37.76 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3111  GTP-binding protein Era  39.38 
 
 		 338 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00956624  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1246  GTP-binding protein Era  39.38 
 
 		 338 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  35.62 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>