More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0990 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0990  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 310 aa  629  1e-179  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2440  GTP-binding protein Era  78.84 
 
 		 316 aa  472  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6613  GTP-binding protein Era  72.93 
 
 		 315 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7362  GTP-binding protein Era  74.15 
 
 		 320 aa  450  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448501  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2641  GTP-binding protein Era  68.54 
 
 		 320 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2973  GTP-binding protein Era  70.27 
 
 		 307 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2275  GTP-binding protein Era  68.18 
 
 		 326 aa  428  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2233  GTP-binding protein Era  70.95 
 
 		 319 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.085201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2550  GTP-binding protein Era  67.86 
 
 		 326 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512596  normal  0.0657743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2613  GTP-binding protein Era  69.59 
 
 		 307 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4682  GTP-binding protein Era  67.77 
 
 		 308 aa  424  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  0.813655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2652  GTP-binding protein Era  69.93 
 
 		 307 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0337857 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2626  GTP-binding protein Era  68.37 
 
 		 311 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303676  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0663  GTP-binding protein Era  67.33 
 
 		 311 aa  422  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.747923  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0656  GTP-binding protein Era  67.33 
 
 		 311 aa  422  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.582352  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1917  GTP-binding protein Era  68.46 
 
 		 303 aa  420  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2250  GTP-binding protein Era  68.33 
 
 		 305 aa  420  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3454  GTP-binding protein Era  71.19 
 
 		 332 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3882  GTP-binding protein Era  67.69 
 
 		 385 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.170748 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0683  GTP-binding protein Era  66.13 
 
 		 310 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  62.99 
 
 		 318 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0951  GTP-binding protein Era  67.12 
 
 		 305 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0999  GTP-binding protein Era  68.94 
 
 		 313 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17106  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1152  GTP-binding protein Era  68.26 
 
 		 313 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1450  GTP-binding protein Era  65.53 
 
 		 327 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0474  GTP-binding protein Era  62.71 
 
 		 301 aa  388  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0524  GTP-binding protein Era  59.12 
 
 		 312 aa  355  5.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0309  GTP-binding protein Era  61.41 
 
 		 304 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1676  GTP-binding protein Era  61.41 
 
 		 304 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.022599  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2570  GTP-binding protein Era  62.03 
 
 		 304 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2558  GTP-binding protein Era  60.47 
 
 		 301 aa  351  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.693757  hitchhiker  0.00166668 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1212  GTP-binding protein Era  55.82 
 
 		 297 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0201  GTP-binding protein Era  61.02 
 
 		 308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.377172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  57.14 
 
 		 297 aa  336  2.9999999999999997e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0418  GTP-binding protein Era  59.66 
 
 		 303 aa  336  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  56.16 
 
 		 309 aa  334  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1738  GTP-binding protein Era  53.72 
 
 		 329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355873  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  54.45 
 
 		 297 aa  325  4.0000000000000003e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  55.33 
 
 		 297 aa  322  5e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1570  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 314 aa  309  2.9999999999999997e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0251  GTP-binding protein Era  52.58 
 
 		 295 aa  297  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.338146  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0743  GTP-binding protein Era  46.69 
 
 		 294 aa  268  8e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0476  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0550  GTP-binding protein Era  45.2 
 
 		 296 aa  258  7e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0497931  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0959  GTP-binding protein Era  43.21 
 
 		 308 aa  245  6.999999999999999e-64  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  41.44 
 
 		 303 aa  237  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  43.81 
 
 		 308 aa  236  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  42.28 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  42.76 
 
 		 298 aa  225  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2207  GTP-binding protein Era  41.81 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547377 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  40.57 
 
 		 324 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  37.97 
 
 		 301 aa  222  6e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  38.75 
 
 		 299 aa  221  8e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  42.27 
 
 		 293 aa  221  9e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  38.75 
 
 		 299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  38.75 
 
 		 299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  40.21 
 
 		 297 aa  220  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2740  GTP-binding protein Era  38.26 
 
 		 305 aa  219  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  41.86 
 
 		 312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  40.21 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  40.34 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  39.52 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1069  GTP-binding protein Era  41.03 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  39.12 
 
 		 300 aa  216  4e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  39.32 
 
 		 307 aa  216  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  40.75 
 
 		 301 aa  215  7e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  40.75 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  40.14 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2852  GTP-binding protein Era  41.55 
 
 		 301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0251331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2931  GTP-binding protein Era  41.55 
 
 		 301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163008  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2719  GTP-binding protein Era  41.55 
 
 		 301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0551516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  40.14 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  40.14 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  36.52 
 
 		 301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  36.52 
 
 		 301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  36.52 
 
 		 301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  36.52 
 
 		 301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2823  GTP-binding protein Era  41.84 
 
 		 301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  36.52 
 
 		 301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  39.31 
 
 		 308 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  36.52 
 
 		 301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2958  GTP-binding protein Era  41.84 
 
 		 301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2742  GTP-binding protein Era  41.84 
 
 		 301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0288239  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02460  GTP-binding protein Era  41.22 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1102  GTP-binding protein Era  41.22 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0130588  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1111  GTP-binding protein Era  41.22 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  38.59 
 
 		 308 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02424  hypothetical protein  41.22 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  36.33 
 
 		 300 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  38.1 
 
 		 300 aa  212  5.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3053  GTP-binding protein Era  40.6 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.0104922 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2721  GTP-binding protein Era  41.22 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2846  GTP-binding protein Era  41.84 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal  0.818064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2783  GTP-binding protein Era  41.84 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  39.02 
 
 		 306 aa  212  7.999999999999999e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  40.89 
 
 		 303 aa  211  9e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3668  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  42.09 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3802  GTP-binding protein Era  41.22 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>