More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2558 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2558  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 301 aa  608  1e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.693757  hitchhiker  0.00166668 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0524  GTP-binding protein Era  81.67 
 
 		 312 aa  504  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2570  GTP-binding protein Era  79.4 
 
 		 304 aa  474  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1676  GTP-binding protein Era  78.74 
 
 		 304 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.022599  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0201  GTP-binding protein Era  79.67 
 
 		 308 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.377172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0309  GTP-binding protein Era  78.74 
 
 		 304 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0418  GTP-binding protein Era  75.92 
 
 		 303 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0663  GTP-binding protein Era  61.36 
 
 		 311 aa  384  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.747923  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0656  GTP-binding protein Era  61.36 
 
 		 311 aa  384  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.582352  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  62.37 
 
 		 318 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2626  GTP-binding protein Era  60.34 
 
 		 311 aa  377  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303676  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0951  GTP-binding protein Era  61.69 
 
 		 305 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2550  GTP-binding protein Era  62.08 
 
 		 326 aa  371  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512596  normal  0.0657743 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0990  GTP-binding protein Era  60.88 
 
 		 310 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2233  GTP-binding protein Era  61.41 
 
 		 319 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.085201 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0683  GTP-binding protein Era  61.02 
 
 		 310 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2275  GTP-binding protein Era  61.41 
 
 		 326 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1450  GTP-binding protein Era  60.34 
 
 		 327 aa  368  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0999  GTP-binding protein Era  62.03 
 
 		 313 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17106  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7362  GTP-binding protein Era  60 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448501  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1152  GTP-binding protein Era  61.69 
 
 		 313 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6613  GTP-binding protein Era  59.73 
 
 		 315 aa  363  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2440  GTP-binding protein Era  59.87 
 
 		 316 aa  359  4e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1738  GTP-binding protein Era  58.2 
 
 		 329 aa  356  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355873  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3882  GTP-binding protein Era  56.04 
 
 		 385 aa  356  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.170748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3454  GTP-binding protein Era  60.61 
 
 		 332 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0474  GTP-binding protein Era  55.93 
 
 		 301 aa  351  1e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  56.8 
 
 		 309 aa  349  3e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2652  GTP-binding protein Era  58.98 
 
 		 307 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0337857 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2973  GTP-binding protein Era  56.95 
 
 		 307 aa  345  5e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4682  GTP-binding protein Era  55.93 
 
 		 308 aa  344  8e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  0.813655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2613  GTP-binding protein Era  58.31 
 
 		 307 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2641  GTP-binding protein Era  55.59 
 
 		 320 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1917  GTP-binding protein Era  55.41 
 
 		 303 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2250  GTP-binding protein Era  56.27 
 
 		 305 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  53.38 
 
 		 297 aa  326  3e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1212  GTP-binding protein Era  53.51 
 
 		 297 aa  322  6e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  54.18 
 
 		 297 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1570  GTP-binding protein Era  50.65 
 
 		 314 aa  315  7e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0251  GTP-binding protein Era  54.39 
 
 		 295 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.338146  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 		 297 aa  292  4e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0476  GTP-binding protein Era  42.37 
 
 		 296 aa  255  7e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0743  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0959  GTP-binding protein Era  46.37 
 
 		 308 aa  252  5.000000000000001e-66  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0550  GTP-binding protein Era  43.49 
 
 		 296 aa  251  7e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0497931  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  42.18 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2740  GTP-binding protein Era  41.67 
 
 		 305 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  43 
 
 		 307 aa  232  5e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2207  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 		 307 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547377 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  42.33 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  41.28 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  41.75 
 
 		 303 aa  225  6e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  38.51 
 
 		 300 aa  225  7e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  40.27 
 
 		 302 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  40.27 
 
 		 308 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  42.52 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  40.27 
 
 		 302 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  40.61 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  41.1 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  41.64 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  38.1 
 
 		 298 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  36.99 
 
 		 301 aa  216  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  38.18 
 
 		 303 aa  215  7e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  40.71 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  38.01 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  38.01 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  38.01 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  38.01 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  38.01 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  38.01 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  37.67 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  38.01 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  38.85 
 
 		 300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1246  GTP-binding protein Era  37.76 
 
 		 338 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1202  GTP-binding protein Era  37.76 
 
 		 338 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  39.25 
 
 		 297 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3111  GTP-binding protein Era  37.76 
 
 		 338 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00956624  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1279  GTP-binding protein Era  37.76 
 
 		 338 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.446406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  40.49 
 
 		 324 aa  211  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1349  GTP-binding protein Era  37.41 
 
 		 339 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  37.33 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  37.33 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  42.23 
 
 		 303 aa  210  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  37.07 
 
 		 338 aa  209  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  37.07 
 
 		 339 aa  209  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  37.07 
 
 		 339 aa  209  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  40.14 
 
 		 300 aa  209  5e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3025  GTP-binding protein Era  37.07 
 
 		 339 aa  209  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.118015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  40.54 
 
 		 308 aa  208  7e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  38.51 
 
 		 296 aa  208  7e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1038  GTP-binding protein Era  37.41 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00137835  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2765  GTP-binding protein Era  37.07 
 
 		 334 aa  207  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00576917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  38.72 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1244  GTP-binding protein Era  36.73 
 
 		 329 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000178109  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  39.79 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  39.86 
 
 		 305 aa  205  8e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  36.79 
 
 		 299 aa  203  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  36.79 
 
 		 299 aa  203  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  37.16 
 
 		 296 aa  203  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>