More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0959 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0959  GTP-binding protein Era  100 
 
 
308 aa  634    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0524  GTP-binding protein Era  46.88 
 
 
312 aa  265  5.999999999999999e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0951  GTP-binding protein Era  47.59 
 
 
305 aa  263  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2626  GTP-binding protein Era  48.29 
 
 
311 aa  263  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303676  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0656  GTP-binding protein Era  47.37 
 
 
311 aa  259  6e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.582352  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  47.87 
 
 
318 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_004310  BR0663  GTP-binding protein Era  47.02 
 
 
311 aa  257  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.747923  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2641  GTP-binding protein Era  44.75 
 
 
320 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2233  GTP-binding protein Era  46.45 
 
 
319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.085201 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0683  GTP-binding protein Era  46.1 
 
 
310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0201  GTP-binding protein Era  48.61 
 
 
308 aa  252  7e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.377172  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2550  GTP-binding protein Era  43.48 
 
 
326 aa  250  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512596  normal  0.0657743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7362  GTP-binding protein Era  44.3 
 
 
320 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448501  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0474  GTP-binding protein Era  48.93 
 
 
301 aa  249  4e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2275  GTP-binding protein Era  43.48 
 
 
326 aa  248  7e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6613  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 
315 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2973  GTP-binding protein Era  45.45 
 
 
307 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0990  GTP-binding protein Era  43.21 
 
 
310 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2250  GTP-binding protein Era  44.29 
 
 
305 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1450  GTP-binding protein Era  45.55 
 
 
327 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0418  GTP-binding protein Era  45.92 
 
 
303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4682  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 
308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  0.813655 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1152  GTP-binding protein Era  44.91 
 
 
313 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2558  GTP-binding protein Era  46.37 
 
 
301 aa  238  6.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.693757  hitchhiker  0.00166668 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0309  GTP-binding protein Era  47.06 
 
 
304 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939671  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1676  GTP-binding protein Era  47.06 
 
 
304 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.022599  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2652  GTP-binding protein Era  44.76 
 
 
307 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0337857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1917  GTP-binding protein Era  44.17 
 
 
303 aa  236  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2570  GTP-binding protein Era  46.71 
 
 
304 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3454  GTP-binding protein Era  43.9 
 
 
332 aa  235  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136633  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0743  GTP-binding protein Era  44.48 
 
 
294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2440  GTP-binding protein Era  46.43 
 
 
316 aa  232  6e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2613  GTP-binding protein Era  44.41 
 
 
307 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0999  GTP-binding protein Era  43.97 
 
 
313 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17106  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3882  GTP-binding protein Era  40.7 
 
 
385 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.170748 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  41.46 
 
 
309 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0476  GTP-binding protein Era  38.41 
 
 
296 aa  219  6e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0550  GTP-binding protein Era  38.46 
 
 
296 aa  218  1e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0497931  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1738  GTP-binding protein Era  36.93 
 
 
329 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355873  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  38.57 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0251  GTP-binding protein Era  39.25 
 
 
295 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.338146  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  38.78 
 
 
297 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1212  GTP-binding protein Era  37.8 
 
 
297 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171275  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1570  GTP-binding protein Era  36.86 
 
 
314 aa  201  9e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221135  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  38.14 
 
 
324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  38.49 
 
 
300 aa  193  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  39.93 
 
 
307 aa  192  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  37.8 
 
 
308 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  39.86 
 
 
297 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  37.07 
 
 
311 aa  187  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  37.11 
 
 
293 aa  186  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  34.59 
 
 
303 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  34.13 
 
 
297 aa  185  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  37.2 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  38.18 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  35.1 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  37.5 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  34.24 
 
 
298 aa  183  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  36.9 
 
 
449 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  37.24 
 
 
451 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  35 
 
 
308 aa  179  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  37.93 
 
 
296 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  38.7 
 
 
300 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  37.67 
 
 
299 aa  178  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  35.57 
 
 
297 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  34.23 
 
 
318 aa  178  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  37.33 
 
 
298 aa  178  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  38.49 
 
 
301 aa  178  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  34.46 
 
 
303 aa  178  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  35.49 
 
 
299 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  35.49 
 
 
299 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  35 
 
 
300 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  36.99 
 
 
297 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  33.79 
 
 
314 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  34.54 
 
 
307 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  35.59 
 
 
301 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  33.79 
 
 
314 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  38.19 
 
 
299 aa  176  5e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  37.5 
 
 
299 aa  176  5e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  36.43 
 
 
301 aa  175  8e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  36.05 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  33.67 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  34.81 
 
 
302 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  34.56 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  36.79 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  36.43 
 
 
301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  34.1 
 
 
307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  35.49 
 
 
303 aa  172  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  33.67 
 
 
298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  36.08 
 
 
301 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  36.08 
 
 
301 aa  172  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  36.08 
 
 
301 aa  172  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  34.47 
 
 
301 aa  172  5e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  36.08 
 
 
301 aa  172  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  36.08 
 
 
301 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  35.27 
 
 
468 aa  172  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  35.74 
 
 
301 aa  172  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  37.11 
 
 
293 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  36.64 
 
 
299 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>