More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1042 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2082  GTP-binding protein Era  70.76 
 
 		 313 aa  434  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592415  normal  0.853182 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1825  GTP-binding protein Era  63.3 
 
 		 309 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 		 451 aa  252  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  49.32 
 
 		 449 aa  249  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  47.35 
 
 		 468 aa  241  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  43.3 
 
 		 293 aa  239  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  44.86 
 
 		 489 aa  236  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  40.61 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 		 300 aa  232  7.000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  40.61 
 
 		 299 aa  231  9e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  40.61 
 
 		 299 aa  231  9e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  41.33 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  41.33 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  41 
 
 		 301 aa  229  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  41 
 
 		 301 aa  229  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  41 
 
 		 301 aa  229  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  41 
 
 		 301 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  42.19 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  41 
 
 		 301 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  41 
 
 		 301 aa  228  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  40.67 
 
 		 301 aa  228  9e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 		 301 aa  227  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  40.67 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  43.2 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  40.67 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  43.15 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  42.61 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  39.73 
 
 		 294 aa  225  9e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  43.15 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  41.72 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  43.15 
 
 		 301 aa  223  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  38.36 
 
 		 298 aa  223  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  41.47 
 
 		 298 aa  221  9e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  43.49 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  40.41 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  40.2 
 
 		 303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  41.58 
 
 		 314 aa  219  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  40.27 
 
 		 303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  39.04 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  40.66 
 
 		 305 aa  215  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  40.74 
 
 		 301 aa  215  5.9999999999999996e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  42.09 
 
 		 305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  40.61 
 
 		 300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1149  GTP-binding protein Era  42.23 
 
 		 335 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.28675  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19471  GTP-binding protein Era  41.39 
 
 		 343 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14661  GTP-binding protein Era  40.94 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  41.64 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  41.1 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1244  GTP-binding protein Era  41.89 
 
 		 329 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000178109  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  41.02 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  40.66 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  40.67 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  41.55 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1038  GTP-binding protein Era  42.28 
 
 		 330 aa  209  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00137835  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  42.52 
 
 		 311 aa  208  7e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  38.1 
 
 		 297 aa  208  7e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  40.48 
 
 		 303 aa  208  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  39.6 
 
 		 296 aa  208  8e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1377  GTP-binding protein Era  41.08 
 
 		 303 aa  208  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0974001  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  38.21 
 
 		 313 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  39.19 
 
 		 305 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2851  GTP-binding protein Era  40.94 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14421  GTP-binding protein Era  39.39 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  38.78 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002498  GTP-binding protein Era  40.53 
 
 		 320 aa  206  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  41.64 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  38.21 
 
 		 313 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  38.72 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  41.36 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14801  GTP-binding protein Era  40.73 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  40.92 
 
 		 311 aa  206  5e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  40.61 
 
 		 298 aa  205  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2652  GTP-binding protein Era  41.5 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0337857 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  39.53 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  38.8 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  40.4 
 
 		 303 aa  203  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03535  GTP-binding protein Era  39.66 
 
 		 320 aa  203  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  39.73 
 
 		 299 aa  203  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  39.12 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  40.4 
 
 		 303 aa  203  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  39.53 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  40.4 
 
 		 303 aa  203  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  39.93 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0990  GTP-binding protein Era  39.38 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0356  GTP-binding protein Era  42.61 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1055  GTP-binding protein Era  39.94 
 
 		 331 aa  202  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.305359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  42.18 
 
 		 311 aa  202  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  38.91 
 
 		 324 aa  202  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  41.81 
 
 		 334 aa  202  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  42.14 
 
 		 303 aa  202  6e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2570  GTP-binding protein Era  41.41 
 
 		 304 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  41.41 
 
 		 339 aa  202  8e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  41.41 
 
 		 339 aa  202  8e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3025  GTP-binding protein Era  41.41 
 
 		 339 aa  202  8e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.118015  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1349  GTP-binding protein Era  41.41 
 
 		 339 aa  201  9e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2116  GTP-binding protein Era  38.59 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2765  GTP-binding protein Era  40.54 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00576917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>