More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2082 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2082  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 313 aa  635    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592415  normal  0.853182 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  70.76 
 
 		 297 aa  436  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1825  GTP-binding protein Era  56.54 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  47.02 
 
 		 451 aa  238  8e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  46.69 
 
 		 449 aa  233  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  42.38 
 
 		 489 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1149  GTP-binding protein Era  42.38 
 
 		 335 aa  223  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.28675  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1244  GTP-binding protein Era  41.72 
 
 		 329 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000178109  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1038  GTP-binding protein Era  42.07 
 
 		 330 aa  222  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00137835  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  40.58 
 
 		 300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  42.44 
 
 		 300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  39.93 
 
 		 294 aa  220  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  45.3 
 
 		 468 aa  218  8.999999999999998e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  42 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002498  GTP-binding protein Era  41.2 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  40.13 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  39.6 
 
 		 298 aa  216  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1055  GTP-binding protein Era  42.05 
 
 		 331 aa  216  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.305359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03535  GTP-binding protein Era  40.53 
 
 		 320 aa  216  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1349  GTP-binding protein Era  41.72 
 
 		 339 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  41.72 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  41.72 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3025  GTP-binding protein Era  41.72 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.118015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  42.02 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1279  GTP-binding protein Era  40.73 
 
 		 338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.446406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3111  GTP-binding protein Era  40.73 
 
 		 338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00956624  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1202  GTP-binding protein Era  40.73 
 
 		 338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1246  GTP-binding protein Era  40.73 
 
 		 338 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2038  GTP-binding protein Era  40.86 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.655908  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  41.53 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  41.06 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2524  GTP-binding protein Era  40.52 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00258575  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  41.72 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  41.72 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  40.47 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  41.72 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  38.69 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  41.2 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  41.39 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  39.8 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  39.6 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  39.74 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  38.67 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  38.67 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2784  GTP-binding protein Era  40.72 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  40.33 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  39.47 
 
 		 308 aa  205  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  38.93 
 
 		 312 aa  205  8e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1069  GTP-binding protein Era  40.72 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  38.33 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  38.33 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  38.33 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  38.33 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  38.33 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  38.67 
 
 		 301 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  38.33 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  40.2 
 
 		 303 aa  205  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  39.33 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  40.33 
 
 		 300 aa  203  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1434  GTP-binding protein Era  44.08 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4373  GTP-binding protein Era  44.08 
 
 		 300 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212808 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  38.93 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  40.07 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  38.33 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4287  GTP-binding protein Era  44.08 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  43 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  38.67 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  40.52 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2765  GTP-binding protein Era  39.4 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00576917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  38.46 
 
 		 297 aa  203  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  38.41 
 
 		 298 aa  202  6e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0881  GTP-binding protein Era  39.93 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427391  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  37.54 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  38.74 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1676  GTP-binding protein Era  40.66 
 
 		 304 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.022599  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  37.38 
 
 		 296 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0309  GTP-binding protein Era  40.66 
 
 		 304 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  38.64 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  39.09 
 
 		 301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2570  GTP-binding protein Era  40.98 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  36.67 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  41 
 
 		 293 aa  199  5e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  38.44 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  37.38 
 
 		 296 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1074  GTP-binding protein Era  43.75 
 
 		 300 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  39.09 
 
 		 301 aa  199  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  39.14 
 
 		 303 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  36.45 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  36.45 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3668  GTP-binding protein Era  39.41 
 
 		 302 aa  196  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  41.53 
 
 		 311 aa  196  6e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  40.13 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  40.33 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  40.53 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3053  GTP-binding protein Era  38.85 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.0104922 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  38.03 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  38.76 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  39.62 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>