More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0791 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  100 
 
 
312 aa  637    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  55.93 
 
 
301 aa  345  8e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  53.4 
 
 
307 aa  310  2e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  50.97 
 
 
315 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  45.66 
 
 
315 aa  266  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  41.89 
 
 
301 aa  257  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  40.48 
 
 
299 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  40.48 
 
 
299 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  41.55 
 
 
301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  41.55 
 
 
301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  41.55 
 
 
301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  41.55 
 
 
301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  41.55 
 
 
301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  41.55 
 
 
301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  42.91 
 
 
302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  40.54 
 
 
301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  41.55 
 
 
301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  41.22 
 
 
301 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  41.22 
 
 
301 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  39.46 
 
 
299 aa  251  1e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  44.78 
 
 
322 aa  249  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  44 
 
 
303 aa  249  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3449  GTP-binding protein Era  43 
 
 
299 aa  248  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0196733 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  41.72 
 
 
303 aa  248  1e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  42.28 
 
 
299 aa  248  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  44.56 
 
 
300 aa  246  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  41.14 
 
 
303 aa  246  3e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17220  GTP-binding protein Era  41.48 
 
 
313 aa  246  4e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00402768  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  40.67 
 
 
303 aa  246  4.9999999999999997e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  40.96 
 
 
300 aa  245  6e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  43.24 
 
 
298 aa  245  9e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  42.66 
 
 
300 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 
299 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  39.73 
 
 
302 aa  242  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  42.23 
 
 
300 aa  242  7e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  43.58 
 
 
299 aa  241  9e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  41.69 
 
 
308 aa  241  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  45.92 
 
 
451 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 
314 aa  240  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 
302 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3243  GTP-binding protein Era  43.73 
 
 
311 aa  240  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0404456  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13500  GTP-binding protein Era  40.89 
 
 
314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3384  GTP-binding protein Era  42.53 
 
 
308 aa  240  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731226  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  39.46 
 
 
298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2303  GTP-binding protein Era  41.72 
 
 
306 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  39.73 
 
 
293 aa  239  5e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  43.24 
 
 
468 aa  239  5.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  43.48 
 
 
311 aa  238  8e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11760  GTP-binding protein Era  42 
 
 
310 aa  238  8e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.28121  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  39.13 
 
 
300 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  42.18 
 
 
297 aa  236  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2758  GTP-binding protein Era  41.85 
 
 
318 aa  236  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0588408  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  44.56 
 
 
449 aa  236  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  44.3 
 
 
301 aa  236  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  40.61 
 
 
303 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  43.73 
 
 
297 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  42.33 
 
 
305 aa  235  6e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  41.39 
 
 
314 aa  235  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4623  GTP-binding protein Era  41.61 
 
 
298 aa  235  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236944  hitchhiker  0.0010995 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1271  GTP-binding protein Era  40.72 
 
 
307 aa  235  7e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1254  GTP-binding protein Era  41.02 
 
 
298 aa  235  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  41.55 
 
 
301 aa  235  9e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  40.2 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  38.36 
 
 
296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  40.92 
 
 
303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  42.66 
 
 
297 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 
305 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  38.01 
 
 
296 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2116  GTP-binding protein Era  41.39 
 
 
310 aa  232  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 
313 aa  232  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  44.33 
 
 
301 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  44.33 
 
 
300 aa  231  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  41.81 
 
 
304 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0593  GTP-binding protein Era  37.85 
 
 
354 aa  230  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  40.2 
 
 
298 aa  229  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  38.98 
 
 
302 aa  230  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  40.86 
 
 
318 aa  229  4e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  40.61 
 
 
489 aa  229  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2203  GTP-binding protein Era  42.24 
 
 
306 aa  229  6e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.00609862 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1662  GTP-binding protein Era  43.61 
 
 
305 aa  229  6e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.438796  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  40.61 
 
 
297 aa  228  8e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3463  GTP-binding protein Era  41.89 
 
 
299 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.720109  normal  0.032958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3452  GTP-binding protein Era  42.23 
 
 
299 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00911502  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3515  GTP-binding protein Era  42.23 
 
 
299 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  40.58 
 
 
337 aa  226  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  41.95 
 
 
303 aa  226  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  38.91 
 
 
294 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  38.7 
 
 
301 aa  226  5.0000000000000005e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1752  GTP-binding protein Era  41.47 
 
 
312 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  37.63 
 
 
301 aa  223  4e-57  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7045  GTP-binding protein Era  41.06 
 
 
375 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14421  GTP-binding protein Era  38.67 
 
 
303 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3155  GTP-binding protein Era  41.86 
 
 
302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0422741  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2185  GTP-binding protein Era  40.94 
 
 
319 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646134  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  40.61 
 
 
303 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  38.23 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1511  GTP-binding protein Era  41.45 
 
 
319 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  38.59 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  40.21 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1377  GTP-binding protein Era  38.38 
 
 
303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0974001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>