More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3591 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 308 aa  630  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2207  GTP-binding protein Era  62.83 
 
 		 307 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547377 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  61.44 
 
 		 308 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  61.13 
 
 		 307 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2740  GTP-binding protein Era  49.01 
 
 		 305 aa  324  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  48.51 
 
 		 312 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  42.09 
 
 		 298 aa  249  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  41.81 
 
 		 297 aa  249  6e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  41.75 
 
 		 307 aa  248  7e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  39.93 
 
 		 303 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  38.69 
 
 		 307 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  40.8 
 
 		 297 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  40.79 
 
 		 299 aa  245  9e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  41.58 
 
 		 308 aa  245  9e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  41.33 
 
 		 303 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  44.15 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  39.26 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  40.48 
 
 		 324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  37.67 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  38.93 
 
 		 311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  38.93 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1074  GTP-binding protein Era  39.29 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  42.81 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1122  GTP-binding protein Era  40.47 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1401  GTP-binding protein Era  40.47 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  42.28 
 
 		 293 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4287  GTP-binding protein Era  39.29 
 
 		 300 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2242  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 		 298 aa  232  7.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709672 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  39.67 
 
 		 298 aa  232  7.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1434  GTP-binding protein Era  39.29 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  40.34 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  40.8 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4373  GTP-binding protein Era  38.96 
 
 		 300 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212808 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  38.33 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  40.13 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  38.33 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  39.67 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  39.72 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1244  GTP-binding protein Era  39.8 
 
 		 329 aa  229  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000178109  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  38.16 
 
 		 300 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1246  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 		 338 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  37.67 
 
 		 301 aa  228  7e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13790  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 		 300 aa  229  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264209  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3025  GTP-binding protein Era  40.39 
 
 		 339 aa  228  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.118015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1279  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 		 338 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.446406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  40.39 
 
 		 339 aa  228  7e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  40.39 
 
 		 339 aa  228  7e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1202  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 		 338 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1476  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 		 299 aa  228  7e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0995  GTP-binding protein Era  39.41 
 
 		 300 aa  228  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  42.05 
 
 		 303 aa  228  8e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4216  GTP-binding protein Era  39.29 
 
 		 300 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305152  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0663  GTP-binding protein Era  39.47 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.747923  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1349  GTP-binding protein Era  40.39 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  40.53 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2233  GTP-binding protein Era  40.46 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.085201 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2626  GTP-binding protein Era  39.8 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303676  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0656  GTP-binding protein Era  39.47 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.582352  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3111  GTP-binding protein Era  40.53 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00956624  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3950  GTP-binding protein Era  39.29 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  36.36 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  36.91 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2765  GTP-binding protein Era  41.23 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00576917  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  38.69 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  38.8 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  36.45 
 
 		 301 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1069  GTP-binding protein Era  39.39 
 
 		 301 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 		 334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  39.2 
 
 		 300 aa  225  7e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4748  GTP-binding protein Era  39.53 
 
 		 302 aa  225  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0521069  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3726  GTP-binding protein Era  40.45 
 
 		 340 aa  224  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.251603 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  37.33 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  37.33 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  37.33 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  37.33 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  41.58 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  39 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  37.33 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  37.33 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  37.33 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  37.01 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  37.33 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  37.33 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  37.91 
 
 		 298 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  38.59 
 
 		 318 aa  223  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2550  GTP-binding protein Era  39.67 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512596  normal  0.0657743 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  39.67 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0951  GTP-binding protein Era  38.83 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  37.92 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  40.13 
 
 		 309 aa  223  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2251  GTP-binding protein Era  38.76 
 
 		 311 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1038  GTP-binding protein Era  39.46 
 
 		 330 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00137835  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1450  GTP-binding protein Era  39.8 
 
 		 327 aa  222  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2784  GTP-binding protein Era  39.06 
 
 		 301 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1149  GTP-binding protein Era  39.46 
 
 		 335 aa  222  6e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.28675  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  38.05 
 
 		 301 aa  222  6e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2275  GTP-binding protein Era  39 
 
 		 326 aa  222  6e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  37.38 
 
 		 303 aa  222  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  37.38 
 
 		 303 aa  222  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54320  GTP-binding protein Era  39.2 
 
 		 305 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>