More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2973 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2973  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 307 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2613  GTP-binding protein Era  89.25 
 
 		 307 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2652  GTP-binding protein Era  87.3 
 
 		 307 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0337857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2641  GTP-binding protein Era  82.41 
 
 		 320 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2250  GTP-binding protein Era  84.49 
 
 		 305 aa  531  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1917  GTP-binding protein Era  84.8 
 
 		 303 aa  522  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4682  GTP-binding protein Era  79.41 
 
 		 308 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  0.813655 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6613  GTP-binding protein Era  72.13 
 
 		 315 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7362  GTP-binding protein Era  73.22 
 
 		 320 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448501  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2233  GTP-binding protein Era  70.72 
 
 		 319 aa  441  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.085201 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2626  GTP-binding protein Era  69.41 
 
 		 311 aa  434  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303676  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2275  GTP-binding protein Era  72.45 
 
 		 326 aa  436  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2550  GTP-binding protein Era  72.11 
 
 		 326 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512596  normal  0.0657743 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0990  GTP-binding protein Era  70.27 
 
 		 310 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3882  GTP-binding protein Era  67.46 
 
 		 385 aa  427  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.170748 
 
 
-
 
NC_004310  BR0663  GTP-binding protein Era  69.39 
 
 		 311 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.747923  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0656  GTP-binding protein Era  69.39 
 
 		 311 aa  427  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.582352  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0951  GTP-binding protein Era  68.01 
 
 		 305 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0683  GTP-binding protein Era  65.9 
 
 		 310 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3454  GTP-binding protein Era  70.37 
 
 		 332 aa  418  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0999  GTP-binding protein Era  65.1 
 
 		 313 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17106  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1152  GTP-binding protein Era  65.76 
 
 		 313 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1450  GTP-binding protein Era  62.17 
 
 		 327 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2440  GTP-binding protein Era  68.37 
 
 		 316 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  61.59 
 
 		 318 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0474  GTP-binding protein Era  62.71 
 
 		 301 aa  388  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  58.39 
 
 		 309 aa  353  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  58.56 
 
 		 297 aa  348  9e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1212  GTP-binding protein Era  57.19 
 
 		 297 aa  347  2e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  57.14 
 
 		 297 aa  337  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0524  GTP-binding protein Era  55.93 
 
 		 312 aa  335  5e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0418  GTP-binding protein Era  56.95 
 
 		 303 aa  328  5.0000000000000004e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2558  GTP-binding protein Era  56.95 
 
 		 301 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.693757  hitchhiker  0.00166668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1738  GTP-binding protein Era  53.09 
 
 		 329 aa  326  4.0000000000000003e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355873  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1570  GTP-binding protein Era  50.98 
 
 		 314 aa  318  1e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0251  GTP-binding protein Era  55.29 
 
 		 295 aa  317  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.338146  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2570  GTP-binding protein Era  54.85 
 
 		 304 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0201  GTP-binding protein Era  55.7 
 
 		 308 aa  311  9e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.377172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1676  GTP-binding protein Era  54.18 
 
 		 304 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.022599  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0309  GTP-binding protein Era  54.18 
 
 		 304 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  51.71 
 
 		 297 aa  306  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
NC_002978  WD0743  GTP-binding protein Era  44.25 
 
 		 294 aa  255  7e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0476  GTP-binding protein Era  42.81 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  45.17 
 
 		 298 aa  250  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  45.7 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0959  GTP-binding protein Era  45.45 
 
 		 308 aa  246  4e-64  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  44.63 
 
 		 308 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  44.14 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0550  GTP-binding protein Era  42.91 
 
 		 296 aa  242  5e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0497931  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  42.96 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2207  GTP-binding protein Era  44 
 
 		 307 aa  239  5e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547377 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  42.62 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  43.62 
 
 		 307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  41.67 
 
 		 303 aa  235  7e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  43.1 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  38.85 
 
 		 298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  40.21 
 
 		 300 aa  232  6e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  43.01 
 
 		 324 aa  231  9e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  40.2 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  40.2 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  43.34 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 306 aa  226  5.0000000000000005e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  39.2 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  41.18 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 301 aa  222  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 301 aa  221  9e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  45.67 
 
 		 449 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  39.31 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  41.36 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  45.67 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  39.66 
 
 		 301 aa  220  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  39.66 
 
 		 301 aa  220  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  39.66 
 
 		 301 aa  220  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  39.66 
 
 		 301 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  39.66 
 
 		 301 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  41.24 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  40.21 
 
 		 301 aa  218  7e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  39.31 
 
 		 301 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  39.31 
 
 		 301 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  40.34 
 
 		 303 aa  218  8.999999999999998e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  39.8 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  41.97 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  40.68 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  39.04 
 
 		 307 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  39.66 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  37.09 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  40.75 
 
 		 301 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  39.19 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  40.75 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  41.28 
 
 		 300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  41.41 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  38.23 
 
 		 301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2958  GTP-binding protein Era  41.22 
 
 		 301 aa  212  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2823  GTP-binding protein Era  41.22 
 
 		 301 aa  212  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  40.48 
 
 		 303 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  40.48 
 
 		 303 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  40.48 
 
 		 303 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2742  GTP-binding protein Era  41.22 
 
 		 301 aa  212  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0288239  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2783  GTP-binding protein Era  41.22 
 
 		 301 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>