More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2909 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 308 aa  628  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2207  GTP-binding protein Era  73.11 
 
 		 307 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547377 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  66.12 
 
 		 307 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  61.44 
 
 		 308 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  55.48 
 
 		 312 aa  340  1e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2740  GTP-binding protein Era  49.17 
 
 		 305 aa  316  3e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  40.94 
 
 		 303 aa  261  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0251  GTP-binding protein Era  47 
 
 		 295 aa  261  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.338146  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  41.56 
 
 		 302 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  42.21 
 
 		 298 aa  256  5e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  42.21 
 
 		 302 aa  255  6e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  42.57 
 
 		 296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  42.9 
 
 		 299 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  41.23 
 
 		 301 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  39.67 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  39.67 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  41.83 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2233  GTP-binding protein Era  45.82 
 
 		 319 aa  250  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.085201 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0951  GTP-binding protein Era  45.64 
 
 		 305 aa  249  4e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  42.44 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  40.58 
 
 		 314 aa  249  5e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2613  GTP-binding protein Era  46.31 
 
 		 307 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2652  GTP-binding protein Era  45.64 
 
 		 307 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0337857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1917  GTP-binding protein Era  44.12 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  40.58 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  40.26 
 
 		 301 aa  245  6e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2973  GTP-binding protein Era  44.63 
 
 		 307 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  39.94 
 
 		 301 aa  245  8e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  39.94 
 
 		 301 aa  245  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  39.94 
 
 		 301 aa  245  8e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  39.94 
 
 		 301 aa  245  8e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  39.94 
 
 		 301 aa  245  8e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  39.94 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  39.94 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  39.81 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  40.92 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7362  GTP-binding protein Era  45.15 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448501  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  38.03 
 
 		 299 aa  242  5e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2641  GTP-binding protein Era  42.62 
 
 		 320 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2250  GTP-binding protein Era  43.29 
 
 		 305 aa  242  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  40.74 
 
 		 300 aa  242  7e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2550  GTP-binding protein Era  44.15 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512596  normal  0.0657743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4682  GTP-binding protein Era  43.29 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  0.813655 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  41.58 
 
 		 302 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  41.67 
 
 		 311 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  39.54 
 
 		 300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2275  GTP-binding protein Era  44.15 
 
 		 326 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  42.67 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  40.52 
 
 		 297 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6613  GTP-binding protein Era  44.48 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  41.86 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0683  GTP-binding protein Era  44.3 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0990  GTP-binding protein Era  43.81 
 
 		 310 aa  236  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1122  GTP-binding protein Era  41.28 
 
 		 304 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1401  GTP-binding protein Era  41.28 
 
 		 304 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1450  GTP-binding protein Era  43.67 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  41.28 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  39.4 
 
 		 298 aa  236  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  41.97 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  39.67 
 
 		 298 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 		 297 aa  235  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  39.16 
 
 		 303 aa  235  6e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  39.61 
 
 		 301 aa  235  7e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3726  GTP-binding protein Era  42.07 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.251603 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  39.29 
 
 		 301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  41.38 
 
 		 303 aa  233  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  39.05 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  39.67 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1212  GTP-binding protein Era  42.52 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  41.08 
 
 		 324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2626  GTP-binding protein Era  44.3 
 
 		 311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303676  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  38.61 
 
 		 306 aa  232  5e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  41 
 
 		 293 aa  232  6e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0663  GTP-binding protein Era  43.19 
 
 		 311 aa  232  7.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.747923  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  38.38 
 
 		 311 aa  232  7.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3454  GTP-binding protein Era  44.82 
 
 		 332 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0656  GTP-binding protein Era  43.19 
 
 		 311 aa  231  8.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.582352  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 		 305 aa  231  9e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  38.69 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  38.38 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1152  GTP-binding protein Era  43.23 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  41.83 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2784  GTP-binding protein Era  39.61 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2169  GTP-binding protein Era  40.86 
 
 		 299 aa  230  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0368513  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2816  GTP-binding protein Era  40.86 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0544  GTP-binding protein Era  40.86 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2894  GTP-binding protein Era  40.86 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1788  GTP-binding protein Era  40.86 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1731  GTP-binding protein Era  41.2 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2839  GTP-binding protein Era  40.86 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2778  GTP-binding protein Era  40.86 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2465  GTP-binding protein Era  40.86 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  39.53 
 
 		 294 aa  229  5e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0999  GTP-binding protein Era  43 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17106  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0033  GTP-binding protein Era  42.9 
 
 		 305 aa  229  5e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3053  GTP-binding protein Era  38.64 
 
 		 301 aa  229  5e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.0104922 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2242  GTP-binding protein Era  40.85 
 
 		 298 aa  229  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709672 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  38.89 
 
 		 297 aa  229  6e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>