More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1387 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 308 aa  624  1e-178  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  49.13 
 
 		 298 aa  305  5.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  48.45 
 
 		 298 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  48.45 
 
 		 298 aa  301  8.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  53.26 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4247  GTP-binding protein Era  53.26 
 
 		 299 aa  299  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 314 aa  296  2e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3060  GTP-binding protein Era  51.7 
 
 		 357 aa  296  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.547585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1011  GTP-binding protein Era  52.92 
 
 		 299 aa  295  9e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262432  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3634  GTP-binding protein Era  52.05 
 
 		 314 aa  293  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.407522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  50.86 
 
 		 294 aa  291  8e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0655  GTP-binding protein Era  51.89 
 
 		 299 aa  291  9e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1135  GTP-binding protein Era  51.89 
 
 		 299 aa  291  9e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1015  GTP-binding protein Era  52.96 
 
 		 287 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0597  GTP-binding protein Era  50.66 
 
 		 348 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  50.52 
 
 		 314 aa  290  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  47.75 
 
 		 300 aa  288  9e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1093  GTP-binding protein Era  51.92 
 
 		 287 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 		 315 aa  287  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2169  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 		 299 aa  285  8e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0368513  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  48.65 
 
 		 305 aa  285  9e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  50.52 
 
 		 300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0651  putative GTP-binding protein  50.66 
 
 		 312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  48.96 
 
 		 293 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  49.48 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  48.5 
 
 		 303 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  49.13 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5260  GTP-binding protein Era  46.89 
 
 		 344 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.678388  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  46.88 
 
 		 311 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01718  GTP-binding protein Era  48.77 
 
 		 285 aa  280  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.515078  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  46.53 
 
 		 311 aa  277  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1069  GTP-binding protein Era  48.79 
 
 		 301 aa  278  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1754  GTP-binding protein Era  48.45 
 
 		 302 aa  278  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.141942  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1731  GTP-binding protein Era  49.48 
 
 		 299 aa  277  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1744  GTP-binding protein Era  47.06 
 
 		 314 aa  277  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000728906  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1149  GTP-binding protein Era  48.45 
 
 		 335 aa  277  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.28675  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0544  GTP-binding protein Era  49.14 
 
 		 299 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1788  GTP-binding protein Era  49.14 
 
 		 299 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2894  GTP-binding protein Era  49.14 
 
 		 299 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2465  GTP-binding protein Era  49.14 
 
 		 311 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2816  GTP-binding protein Era  49.14 
 
 		 299 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2839  GTP-binding protein Era  49.14 
 
 		 299 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2778  GTP-binding protein Era  49.14 
 
 		 299 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  47.59 
 
 		 306 aa  275  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002498  GTP-binding protein Era  46.26 
 
 		 320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1244  GTP-binding protein Era  47.77 
 
 		 329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000178109  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2765  GTP-binding protein Era  48.11 
 
 		 334 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00576917  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2784  GTP-binding protein Era  47.75 
 
 		 301 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3237  GTP-binding protein Era  47.23 
 
 		 340 aa  273  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0752084  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2251  GTP-binding protein Era  46.69 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  48.1 
 
 		 303 aa  272  4.0000000000000004e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1197  GTP-binding protein Era  47.04 
 
 		 344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0842  GTP-binding protein Era  49.48 
 
 		 287 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0615921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  47.75 
 
 		 300 aa  272  4.0000000000000004e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03535  GTP-binding protein Era  46.6 
 
 		 320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  48.1 
 
 		 303 aa  272  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  48.1 
 
 		 303 aa  272  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1038  GTP-binding protein Era  47.35 
 
 		 330 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00137835  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  46.58 
 
 		 300 aa  271  7e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2417  GTP-binding protein Era  48.46 
 
 		 312 aa  271  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.262207 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1064  GTP-binding protein Era  47.96 
 
 		 298 aa  271  9e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0212543  normal  0.0907756 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3802  GTP-binding protein Era  48.1 
 
 		 301 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2524  GTP-binding protein Era  46.18 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00258575  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  48.45 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02460  GTP-binding protein Era  48.1 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1102  GTP-binding protein Era  48.1 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0130588  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02424  hypothetical protein  48.1 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1349  GTP-binding protein Era  48.11 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1111  GTP-binding protein Era  48.1 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  47.77 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  47.77 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  47.95 
 
 		 334 aa  270  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2721  GTP-binding protein Era  48.1 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3025  GTP-binding protein Era  47.77 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.118015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1086  GTP-binding protein Era  48.11 
 
 		 299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2719  GTP-binding protein Era  48.1 
 
 		 301 aa  269  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0551516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2931  GTP-binding protein Era  48.1 
 
 		 301 aa  269  4e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163008  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1055  GTP-binding protein Era  48.11 
 
 		 331 aa  269  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.305359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0368  GTP-binding protein Era  48.01 
 
 		 338 aa  269  4e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0276101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3111  GTP-binding protein Era  47.42 
 
 		 338 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00956624  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2852  GTP-binding protein Era  48.1 
 
 		 301 aa  269  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0251331  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2898  GTP-binding protein Era  48.11 
 
 		 299 aa  269  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22233  normal  0.295103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1202  GTP-binding protein Era  47.42 
 
 		 338 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1279  GTP-binding protein Era  47.42 
 
 		 338 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.446406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0334  GTP-binding protein Era  48.01 
 
 		 330 aa  268  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.94828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  47.4 
 
 		 297 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3266  GTP-binding protein Era  46.84 
 
 		 337 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0242334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0929  GTP-binding protein Era  47.28 
 
 		 312 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163867  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2619  GTP-binding protein Era  46.84 
 
 		 337 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0994  GTP-binding protein Era  47.28 
 
 		 312 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307835  normal  0.0847852 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1246  GTP-binding protein Era  47.42 
 
 		 338 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0375  GTP-binding protein Era  47.02 
 
 		 339 aa  268  7e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.426985  hitchhiker  0.000823221 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0033  GTP-binding protein Era  46.53 
 
 		 305 aa  268  7e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3668  GTP-binding protein Era  47.6 
 
 		 302 aa  268  8e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2958  GTP-binding protein Era  46.8 
 
 		 301 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2742  GTP-binding protein Era  46.8 
 
 		 301 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0288239  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2823  GTP-binding protein Era  46.8 
 
 		 301 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2846  GTP-binding protein Era  46.8 
 
 		 301 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal  0.818064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2783  GTP-binding protein Era  46.8 
 
 		 301 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4216  GTP-binding protein Era  47.8 
 
 		 300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>