41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ02880 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006679  CNJ02880  Rho small monomeric GTPase, putative  100 
 
 		 197 aa  406  1e-113  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45361  GTP-binding protein of the rho family  46.43 
 
 		 228 aa  154  6e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.381371  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04782  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  50.94 
 
 		 161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.936481  normal  0.629565 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35392  GTP-binding protein, rho subfamily  43.98 
 
 		 199 aa  140  8e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0874099  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05740  GTP-binding protein rhoA Precursor (Rho1 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9C3Y4]  42.93 
 
 		 193 aa  138  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40058  predicted protein  46.47 
 
 		 198 aa  134  9e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0532739  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02630  Rho1 GTPase  45.51 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822258  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04743  RacA (Eurofung)  42.94 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0182808  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00070  Rho GTPase, putative  38.22 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261976  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04960  small GTPase, putative  39.78 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04953  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  43.79 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00140  Rho small monomeric GTPase, putative  40.12 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35277  Cell division control protein 42 homolog  39.16 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.378034 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07487  CD42_CHICK Cell division control protein 42 homolog (G25K GTP-binding protein)MODA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UR50]  36.36 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.358627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82174  RHO small monomeric GTPase signal transduction  36.97 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.160342 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02687  GTP-binding protein rhoC Precursor (Rho3 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96WY0]  42 
 
 		 280 aa  101  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04330  signal transducer, putative  42 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00186621  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79030  Ras-related small GTPase, Rho type  42.28 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.554484  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04140  Rho small monomeric GTPase, putative  37.97 
 
 		 224 aa  96.7  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764266  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00160  Rho small monomeric GTPase, putative  36 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00283225  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68960  GTP-binding protein (RHO4)  37.5 
 
 		 341 aa  84.7  8e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0983482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41392  predicted protein  30.67 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0613331  normal  0.283654 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30484  predicted protein  30 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0430346  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  29.69 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44586  predicted protein  29.14 
 
 		 178 aa  52.4  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.395695  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00182  Ras-like protein Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12526]  28.19 
 
 		 212 aa  51.2  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326339  normal  0.668577 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61694  predicted protein  28.15 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14983  predicted protein  27.21 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227158  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  28.24 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  25.17 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57530  predicted protein  26 
 
 		 237 aa  45.4  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  24.71 
 
 		 207 aa  44.7  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01910  conserved hypothetical protein  26.6 
 
 		 224 aa  43.9  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606471  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  25.69 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  30.38 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  29.1 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0691  GTP-binding protein LepA  30.33 
 
 		 613 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.141942 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05832  Ras small monomeric GTPase RasB (AFU_orthologue; AFUA_2G07770)  29.58 
 
 		 225 aa  42  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.065815  normal  0.88422 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02810  RAS small monomeric GTPase, putative  29.55 
 
 		 216 aa  42  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.191225  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  29.77 
 
 		 213 aa  42  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  27.08 
 
 		 214 aa  41.2  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.495831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>