109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE04210 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006687  CNE04210  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  376  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03934  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08290)  53.04 
 
 		 179 aa  208  4e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  45 
 
 		 186 aa  187  5.999999999999999e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.348621 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  45 
 
 		 186 aa  187  5.999999999999999e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13157  predicted protein  40.23 
 
 		 177 aa  140  7e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  35.33 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.803161 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  35.33 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  32.76 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05020  ADP ribosylation factor (Eurofung)  36.3 
 
 		 185 aa  100  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  34.52 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  33.94 
 
 		 182 aa  99  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8659  predicted protein  35.12 
 
 		 184 aa  99  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05912  ADP ribosylation factor A (Eurofung)  34.13 
 
 		 182 aa  98.6  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04290  small monomeric GTPase, putative  36.53 
 
 		 186 aa  97.4  9e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8244  predicted protein  33.53 
 
 		 175 aa  97.4  9e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222929  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38412  predicted protein  33.54 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69050  predicted protein  34.97 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.121793 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43251  predicted protein  33.91 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8255  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37806  predicted protein  32.52 
 
 		 211 aa  95.9  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163906  normal  0.029284 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56002  predicted protein  34.81 
 
 		 162 aa  95.1  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0254308  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03220  ARF small monomeric GTPase, putative  32.93 
 
 		 182 aa  95.1  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03430  SAR small monomeric GTPase, putative  29.03 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000269904  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51819  predicted protein  29.01 
 
 		 187 aa  85.5  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00411  Small COPII coat GTPase sar1 (EC 3.6.5.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGB9]  29.03 
 
 		 189 aa  84.7  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.395555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54420  predicted protein  31.65 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0877951  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67516  GTP-binding protein  27.81 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00440  ADP-ribosylation-like factor, putative  30.25 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29284  predicted protein  30.15 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43732  predicted protein  29.08 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105149  normal  0.152758 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56609  predicted protein  27.22 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.158476  normal  0.886863 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  27.33 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  32.2 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03960  ADP-ribosylation factor, putative  30.4 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710992  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  31.62 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_51199  predicted protein  33.81 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  33.33 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.495831 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  28.1 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3991  small GTP-binding protein  26.99 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  31.36 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  29.66 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02285  hypothetical protein  29.75 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  29.68 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3603  small GTP-binding protein  28.22 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.802563 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  27.12 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0208811 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  28.57 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15349  predicted protein  30.77 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00089  Small GTPase AvaA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8TGD9]  27.38 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  29.76 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  27.73 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  32.54 
 
 		 201 aa  52.4  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  28.57 
 
 		 207 aa  52  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52766  putative ADP-ribosylation factor in the carboxypeptidase Y pathway  30.77 
 
 		 242 aa  52  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167275  normal  0.735667 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  30.51 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00634  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G16970)  33 
 
 		 276 aa  52  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00256949  normal  0.850865 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  27.49 
 
 		 206 aa  51.6  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  32.26 
 
 		 252 aa  52  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  33.67 
 
 		 885 aa  51.2  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2067  small GTP-binding protein  27.16 
 
 		 387 aa  51.2  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.66233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03625  small GTP-binding protein  29.22 
 
 		 161 aa  51.2  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  27.73 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14983  predicted protein  27.41 
 
 		 207 aa  50.8  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227158  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 		 240 aa  50.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  28.93 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  25.6 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07206  GTP binding protein (SPG1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10330)  33.33 
 
 		 314 aa  48.5  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.214538  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02300  arf-related protein (arp), putative  27.42 
 
 		 223 aa  48.5  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.241389  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02474  ras-like GTP-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03100)  28.69 
 
 		 307 aa  48.1  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0080  small GTP-binding protein  25.5 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0120715  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64341  GTP-binding protein of the ras family  21.12 
 
 		 182 aa  48.1  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01820  ras-related protein ypt3 (rab), putative  34.52 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0881  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.54 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.334755  hitchhiker  0.000103971 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  29.21 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  26.14 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51169  predicted protein  22.35 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62699  predicted protein  23.72 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.1708  normal  0.632986 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08868  hypothetical protein similar to small GTPase RAS2 (Broad)  24.84 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000000107682 
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  32.5 
 
 		 233 aa  45.1  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68134  predicted protein  27.35 
 
 		 220 aa  45.4  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  29.51 
 
 		 202 aa  45.1  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2190  small GTP-binding protein  29.03 
 
 		 161 aa  45.1  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44586  predicted protein  24.53 
 
 		 178 aa  44.7  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.395695  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05482  Small GTPase RanA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T4V9]  19.76 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337207  normal  0.914788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2203  small GTP-binding protein  26.5 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04330  signal transducer, putative  27.91 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00186621  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  29.44 
 
 		 329 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  22.35 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3035  translation initiation factor IF-2  31.62 
 
 		 884 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.19789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3221  translation initiation factor IF-2  32.08 
 
 		 815 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.109257 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  28.97 
 
 		 258 aa  43.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.222182 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  22.42 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01660  small monomeric GTPase, putative  32.1 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  25 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  24.59 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00590  conserved hypothetical protein  23.72 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0238603  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04140  Rho small monomeric GTPase, putative  29.41 
 
 		 224 aa  42.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764266  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33115  predicted protein  31.67 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.26784 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09072  Ras family GTPase (Rab4b), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02540)  34.18 
 
 		 358 aa  42.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02000  GTPase, putative  26.5 
 
 		 175 aa  42.4  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0080  small GTP-binding protein  25.21 
 
 		 171 aa  42  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.561103  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84260  predicted protein  19.76 
 
 		 214 aa  42  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.514091 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>