79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_56609 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_56609  predicted protein  100 
 
 		 185 aa  364  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.158476  normal  0.886863 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51819  predicted protein  42.54 
 
 		 187 aa  144  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38412  predicted protein  41.99 
 
 		 184 aa  144  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03220  ARF small monomeric GTPase, putative  36.31 
 
 		 182 aa  107  9.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8244  predicted protein  37.29 
 
 		 175 aa  106  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222929  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  35.88 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.803161 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  36.31 
 
 		 181 aa  104  8e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  36.31 
 
 		 180 aa  104  9e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
NC_006686  CND04290  small monomeric GTPase, putative  37.28 
 
 		 186 aa  104  9e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05912  ADP ribosylation factor A (Eurofung)  36.14 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43251  predicted protein  33.87 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8255  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  36.53 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56002  predicted protein  38.92 
 
 		 162 aa  101  8e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0254308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69050  predicted protein  35.15 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.121793 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  34.32 
 
 		 182 aa  98.6  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8659  predicted protein  31.07 
 
 		 184 aa  98.2  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00440  ADP-ribosylation-like factor, putative  35.85 
 
 		 195 aa  97.1  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37806  predicted protein  32.74 
 
 		 211 aa  91.3  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163906  normal  0.029284 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05020  ADP ribosylation factor (Eurofung)  41.03 
 
 		 185 aa  88.6  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03960  ADP-ribosylation factor, putative  33.33 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710992  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13157  predicted protein  29.76 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03934  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08290)  31.18 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  29.24 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  29.24 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.348621 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67516  GTP-binding protein  32.76 
 
 		 190 aa  70.9  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03430  SAR small monomeric GTPase, putative  26.97 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000269904  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04210  conserved hypothetical protein  27.22 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15349  predicted protein  28.3 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43732  predicted protein  32.14 
 
 		 193 aa  67  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105149  normal  0.152758 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00411  Small COPII coat GTPase sar1 (EC 3.6.5.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGB9]  28.21 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.395555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54420  predicted protein  31.25 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0877951  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00634  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G16970)  32.58 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00256949  normal  0.850865 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52766  putative ADP-ribosylation factor in the carboxypeptidase Y pathway  26.72 
 
 		 242 aa  62  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167275  normal  0.735667 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29284  predicted protein  25.99 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02300  arf-related protein (arp), putative  33.61 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.241389  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  25.58 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2545  GTP-binding protein EngA  28.02 
 
 		 458 aa  52.4  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2604  GTP-binding protein EngA  29.28 
 
 		 446 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1686  GTP-binding protein EngA  28.89 
 
 		 460 aa  51.2  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0325003  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  27.17 
 
 		 473 aa  51.2  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21147  predicted protein  29.93 
 
 		 307 aa  50.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2020  GTP-binding protein EngA  28.65 
 
 		 455 aa  48.1  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.866056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  26.82 
 
 		 456 aa  47.8  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  25.93 
 
 		 460 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4625  GTP-binding protein EngA  27.87 
 
 		 447 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137577  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2896  GTP-binding protein EngA  26.09 
 
 		 453 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0739755  hitchhiker  0.000158888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2448  GTP-binding protein EngA  27.13 
 
 		 459 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14966  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  28.33 
 
 		 474 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08796  small monomeric GTPase (Gtr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09650)  29.03 
 
 		 332 aa  45.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4525  GTP-binding protein EngA  26.97 
 
 		 446 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68951 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  26.97 
 
 		 473 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  27.17 
 
 		 473 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3890  GTP-binding protein EngA  26.97 
 
 		 448 aa  43.9  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337837  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1166  GTP-binding protein EngA  24.59 
 
 		 490 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000230797  normal  0.345653 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3084  GTP-binding protein EngA  24.86 
 
 		 500 aa  43.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3566  ribosome-associated GTPase EngA  24.6 
 
 		 454 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.173152  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  28.09 
 
 		 460 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4413  GTP-binding protein EngA  26.4 
 
 		 446 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2427  GTP-binding protein EngA  25.14 
 
 		 489 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4043  GTP-binding protein EngA  26.4 
 
 		 446 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0947633  normal  0.421854 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2699  GTP-binding protein EngA  25.14 
 
 		 487 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1356  GTP-binding protein EngA  25.14 
 
 		 487 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0284939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  27.74 
 
 		 296 aa  43.1  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0390  GTP-binding protein EngA  24.72 
 
 		 483 aa  42.4  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.270758  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  26.11 
 
 		 474 aa  42.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0375  GTP-binding protein EngA  24.72 
 
 		 483 aa  42.4  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3505  GTP-binding protein EngA  26.88 
 
 		 459 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0442058  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  28.49 
 
 		 345 aa  42.4  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  24.19 
 
 		 452 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  24.19 
 
 		 452 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  28.18 
 
 		 298 aa  42  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0991  GTP-binding protein EngA  25 
 
 		 492 aa  42  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  25.84 
 
 		 483 aa  41.6  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3727  ribosome-associated GTPase EngA  22.83 
 
 		 518 aa  41.6  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  31.31 
 
 		 885 aa  41.6  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2498  GTP-binding protein EngA  24.63 
 
 		 602 aa  41.2  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2059  ABC transporter related protein  32.93 
 
 		 542 aa  41.2  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.455455  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2740  GTP-binding protein Era  26.92 
 
 		 305 aa  40.8  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2169  GTP-binding protein EngA  26.86 
 
 		 479 aa  41.2  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>