More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3005 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2020  GTP-binding protein EngA  81.09 
 
 		 455 aa  731    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.866056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  82.61 
 
 		 456 aa  783    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2448  GTP-binding protein EngA  95.65 
 
 		 459 aa  867    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14966  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  85.37 
 
 		 460 aa  814    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  100 
 
 		 460 aa  928    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1686  GTP-binding protein EngA  84.35 
 
 		 460 aa  782    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0325003  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3505  GTP-binding protein EngA  91.09 
 
 		 459 aa  836    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0442058  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2545  GTP-binding protein EngA  65.07 
 
 		 458 aa  610  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0762  GTP-binding protein EngA  59.31 
 
 		 467 aa  565  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0334743 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2317  GTP-binding protein EngA  59.7 
 
 		 470 aa  567  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318648  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1166  GTP-binding protein EngA  56.66 
 
 		 490 aa  551  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000230797  normal  0.345653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  57.89 
 
 		 473 aa  549  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0991  GTP-binding protein EngA  55.44 
 
 		 492 aa  546  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0375  GTP-binding protein EngA  55.6 
 
 		 483 aa  541  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4625  GTP-binding protein EngA  60.8 
 
 		 447 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137577  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  57.62 
 
 		 474 aa  542  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  55.37 
 
 		 483 aa  538  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  57.51 
 
 		 474 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  56.81 
 
 		 470 aa  538  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0390  GTP-binding protein EngA  54.98 
 
 		 483 aa  536  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.270758  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2604  GTP-binding protein EngA  61.07 
 
 		 446 aa  536  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  56.84 
 
 		 473 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2498  GTP-binding protein EngA  56.73 
 
 		 602 aa  533  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4514  GTP-binding protein EngA  57.35 
 
 		 477 aa  531  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.194124 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2427  GTP-binding protein EngA  56.17 
 
 		 489 aa  526  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2169  GTP-binding protein EngA  54.76 
 
 		 479 aa  527  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3890  GTP-binding protein EngA  59.02 
 
 		 448 aa  521  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337837  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4413  GTP-binding protein EngA  60.36 
 
 		 446 aa  523  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4043  GTP-binding protein EngA  60.36 
 
 		 446 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0947633  normal  0.421854 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4525  GTP-binding protein EngA  60.36 
 
 		 446 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68951 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2160  GTP-binding protein EngA  55.06 
 
 		 487 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  54.12 
 
 		 473 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2699  GTP-binding protein EngA  54.64 
 
 		 487 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1356  GTP-binding protein EngA  54.64 
 
 		 487 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0284939 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2203  GTP-binding protein EngA  54.59 
 
 		 456 aa  489  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  55.46 
 
 		 451 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3126  GTP-binding protein EngA  53.96 
 
 		 454 aa  483  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1203  small GTP-binding protein  50.56 
 
 		 490 aa  471  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.996743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3084  GTP-binding protein EngA  49.2 
 
 		 500 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0863  GTP-binding protein EngA  53.19 
 
 		 461 aa  453  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145711  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3106  GTP-binding protein EngA  52.4 
 
 		 479 aa  449  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.564911 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  42.21 
 
 		 439 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.3 
 
 		 464 aa  355  1e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  40.36 
 
 		 438 aa  351  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  41.08 
 
 		 495 aa  348  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  42.86 
 
 		 441 aa  345  7e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  40.81 
 
 		 440 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0504  GTP-binding protein EngA  38.46 
 
 		 442 aa  344  2e-93  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.696313  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  40.58 
 
 		 440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2102  GTP-binding protein EngA  41.45 
 
 		 447 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0508209  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0625  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.41 
 
 		 480 aa  343  5e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  39.91 
 
 		 439 aa  342  9e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1759  GTP-binding protein EngA  41.34 
 
 		 473 aa  341  2e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004345  GTP-binding protein EngA  41.07 
 
 		 498 aa  341  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.63 
 
 		 438 aa  340  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01071  GTP-binding protein EngA  41.07 
 
 		 498 aa  341  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  41.22 
 
 		 446 aa  340  4e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  42.01 
 
 		 445 aa  339  5e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  42.01 
 
 		 445 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  40.18 
 
 		 444 aa  339  7e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0524  GTP-binding protein EngA  39.16 
 
 		 439 aa  339  8e-92  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2238  GTP-binding protein EngA  42.05 
 
 		 445 aa  338  8e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.746998  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  40.13 
 
 		 440 aa  339  8e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2373  GTP-binding protein EngA  40.7 
 
 		 466 aa  338  9e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.537703  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  42.01 
 
 		 445 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  42.01 
 
 		 445 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  42.01 
 
 		 445 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1467  GTP-binding protein EngA  40.88 
 
 		 445 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496612  normal  0.453892 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1719  GTP-binding protein EngA  41.23 
 
 		 445 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.576586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4247  GTP-binding protein EngA  39.2 
 
 		 498 aa  337  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2082  GTP-binding protein EngA  41.05 
 
 		 447 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  41.74 
 
 		 448 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  38.56 
 
 		 449 aa  335  9e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02977  GTP-binding protein EngA  41.36 
 
 		 481 aa  335  1e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1830  GTP-binding protein EngA  41.39 
 
 		 460 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  42.57 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1341  GTP-binding protein EngA  41.39 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380293  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0066  GTP-binding protein EngA  41.39 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225046  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2350  GTP-binding protein EngA  41.39 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1598  GTP-binding protein EngA  40.22 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111864  normal  0.122269 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1102  GTP-binding protein EngA  41.39 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2185  GTP-binding protein EngA  41.39 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880216  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2223  GTP-binding protein EngA  41.39 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2203  ribosome-associated GTPase EngA  40.88 
 
 		 567 aa  333  3e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  40 
 
 		 440 aa  333  3e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  41.03 
 
 		 490 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1360  small GTP-binding protein  38.41 
 
 		 445 aa  333  5e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508315  hitchhiker  0.00000394324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2537  GTP-binding protein EngA  41.14 
 
 		 445 aa  332  6e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358302  hitchhiker  0.0000595621 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  40 
 
 		 441 aa  333  6e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0292  GTP-binding protein EngA  39.16 
 
 		 494 aa  332  7.000000000000001e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2981  GTP-binding protein EngA  41.56 
 
 		 443 aa  332  8e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  37.08 
 
 		 439 aa  331  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  41.41 
 
 		 464 aa  332  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0733  GTP-binding protein EngA  40.21 
 
 		 500 aa  331  2e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3386  GTP-binding protein EngA  41.72 
 
 		 442 aa  330  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1416  GTP-binding protein EngA  40.43 
 
 		 446 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592606 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1157  small GTP-binding protein  40.6 
 
 		 490 aa  330  4e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2663  GTP-binding protein EngA  40.6 
 
 		 490 aa  330  4e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.194974 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2662  GTP-binding protein EngA  40.6 
 
 		 490 aa  330  4e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000307508  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2795  GTP-binding protein EngA  40.6 
 
 		 490 aa  330  4e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000215643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>