More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3084 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3084  GTP-binding protein EngA  100 
 
 		 500 aa  1013    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  55.69 
 
 		 473 aa  538  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1166  GTP-binding protein EngA  52.69 
 
 		 490 aa  500  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000230797  normal  0.345653 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0991  GTP-binding protein EngA  51.29 
 
 		 492 aa  496  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0375  GTP-binding protein EngA  51.1 
 
 		 483 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2427  GTP-binding protein EngA  51.5 
 
 		 489 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0390  GTP-binding protein EngA  50.5 
 
 		 483 aa  488  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.270758  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  49.3 
 
 		 474 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  50.7 
 
 		 483 aa  482  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  48.7 
 
 		 474 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2545  GTP-binding protein EngA  51.41 
 
 		 458 aa  478  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2317  GTP-binding protein EngA  50.79 
 
 		 470 aa  474  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318648  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4625  GTP-binding protein EngA  52.11 
 
 		 447 aa  471  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137577  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4514  GTP-binding protein EngA  49.3 
 
 		 477 aa  472  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.194124 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0762  GTP-binding protein EngA  50.2 
 
 		 467 aa  474  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0334743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  49.9 
 
 		 456 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  50.1 
 
 		 460 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  49.7 
 
 		 470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2160  GTP-binding protein EngA  52.1 
 
 		 487 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2699  GTP-binding protein EngA  52.3 
 
 		 487 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220146  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  49.5 
 
 		 460 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1356  GTP-binding protein EngA  52.3 
 
 		 487 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0284939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  48.3 
 
 		 473 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3126  GTP-binding protein EngA  48.6 
 
 		 454 aa  464  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2169  GTP-binding protein EngA  49.9 
 
 		 479 aa  464  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3505  GTP-binding protein EngA  49.3 
 
 		 459 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0442058  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2448  GTP-binding protein EngA  49.5 
 
 		 459 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14966  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  47.89 
 
 		 473 aa  459  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3106  GTP-binding protein EngA  50.4 
 
 		 479 aa  455  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.564911 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2203  GTP-binding protein EngA  47.9 
 
 		 456 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2498  GTP-binding protein EngA  46.79 
 
 		 602 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3890  GTP-binding protein EngA  49.7 
 
 		 448 aa  438  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337837  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  48.19 
 
 		 451 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1203  small GTP-binding protein  45.97 
 
 		 490 aa  434  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.996743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  37.63 
 
 		 438 aa  327  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  39.8 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  35.79 
 
 		 439 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  38.08 
 
 		 490 aa  320  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02403  GTP-binding protein EngA  37.47 
 
 		 490 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000560332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1157  small GTP-binding protein  37.47 
 
 		 490 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2662  GTP-binding protein EngA  37.47 
 
 		 490 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000307508  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2795  GTP-binding protein EngA  37.47 
 
 		 490 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000215643  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2663  GTP-binding protein EngA  37.47 
 
 		 490 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.194974 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02365  hypothetical protein  37.47 
 
 		 490 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00134909  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3735  GTP-binding protein EngA  37.47 
 
 		 490 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0134821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1166  GTP-binding protein EngA  37.47 
 
 		 490 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000585661  normal  0.0127623 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2886  GTP-binding protein EngA  37.47 
 
 		 490 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684219  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3010  GTP-binding protein EngA  36.87 
 
 		 495 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004345  GTP-binding protein EngA  37.92 
 
 		 498 aa  311  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  35.61 
 
 		 449 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01071  GTP-binding protein EngA  37.4 
 
 		 498 aa  311  2.9999999999999997e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2604  GTP-binding protein EngA  55.81 
 
 		 446 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3005  GTP-binding protein EngA  36.87 
 
 		 490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1325  GTP-binding protein EngA  37.01 
 
 		 511 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.359502  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  35.79 
 
 		 441 aa  307  3e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2733  GTP-binding protein EngA  36.27 
 
 		 494 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0504  GTP-binding protein EngA  34.26 
 
 		 442 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.696313  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4043  GTP-binding protein EngA  56.6 
 
 		 446 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0947633  normal  0.421854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4413  GTP-binding protein EngA  56.6 
 
 		 446 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1719  GTP-binding protein EngA  37.3 
 
 		 445 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.576586 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1122  GTP-binding protein EngA  36.95 
 
 		 497 aa  306  7e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.827994  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4525  GTP-binding protein EngA  56.13 
 
 		 446 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68951 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  37.3 
 
 		 445 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  37.3 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  37.3 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3386  GTP-binding protein EngA  37.88 
 
 		 442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  37.3 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1467  GTP-binding protein EngA  37.3 
 
 		 445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496612  normal  0.453892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2604  GTP-binding protein EngA  37.13 
 
 		 447 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156486  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1262  GTP-binding protein EngA  36.27 
 
 		 495 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  37.1 
 
 		 445 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0733  GTP-binding protein EngA  35.87 
 
 		 500 aa  303  6.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0414  GTP-binding protein EngA  37.15 
 
 		 495 aa  303  7.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0317617  hitchhiker  0.000999032 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1190  GTP-binding protein EngA  37.15 
 
 		 495 aa  303  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000499446  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1297  GTP-binding protein EngA  37.15 
 
 		 495 aa  303  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4247  GTP-binding protein EngA  37.6 
 
 		 498 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2238  GTP-binding protein EngA  36.67 
 
 		 445 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.746998  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1598  GTP-binding protein EngA  36.47 
 
 		 445 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111864  normal  0.122269 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1102  GTP-binding protein EngA  37.07 
 
 		 445 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1341  GTP-binding protein EngA  37.07 
 
 		 445 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2350  GTP-binding protein EngA  37.07 
 
 		 445 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0066  GTP-binding protein EngA  37.07 
 
 		 445 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225046  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2223  GTP-binding protein EngA  37.07 
 
 		 445 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2185  GTP-binding protein EngA  37.07 
 
 		 445 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880216  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2537  GTP-binding protein EngA  36.47 
 
 		 445 aa  299  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358302  hitchhiker  0.0000595621 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1830  GTP-binding protein EngA  37.07 
 
 		 460 aa  299  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  37.15 
 
 		 495 aa  298  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1686  GTP-binding protein EngA  54.98 
 
 		 460 aa  298  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0325003  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  36.25 
 
 		 446 aa  298  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3605  GTP-binding protein EngA  37.07 
 
 		 494 aa  297  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1876  GTP-binding protein EngA  36.67 
 
 		 445 aa  297  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.900999 
 
 
-
 
NC_002978  WD1098  GTP-binding protein EngA  35.2 
 
 		 441 aa  296  5e-79  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0524  GTP-binding protein EngA  33.6 
 
 		 439 aa  295  9e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3308  GTP-binding protein EngA  36.18 
 
 		 487 aa  295  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1233  GTP-binding protein EngA  36.18 
 
 		 488 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  34.15 
 
 		 441 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1232  GTP-binding protein EngA  36.18 
 
 		 488 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1303  GTP-binding protein EngA  36.18 
 
 		 488 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2020  GTP-binding protein EngA  53.65 
 
 		 455 aa  294  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.866056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2648  GTP-binding protein EngA  36.25 
 
 		 488 aa  295  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>