More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3115 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0375  GTP-binding protein EngA  70.89 
 
 
483 aa  697    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  64.57 
 
 
473 aa  642    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  95.15 
 
 
473 aa  890    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  84 
 
 
474 aa  804    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0390  GTP-binding protein EngA  70.27 
 
 
483 aa  693    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.270758  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  67.09 
 
 
470 aa  652    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  70.89 
 
 
483 aa  688    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4514  GTP-binding protein EngA  84 
 
 
477 aa  805    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.194124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  100 
 
 
474 aa  954    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2545  GTP-binding protein EngA  61.97 
 
 
458 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2317  GTP-binding protein EngA  60.42 
 
 
470 aa  564  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318648  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0762  GTP-binding protein EngA  60.51 
 
 
467 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0334743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4625  GTP-binding protein EngA  61.51 
 
 
447 aa  560  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137577  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2604  GTP-binding protein EngA  63.15 
 
 
446 aa  556  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0991  GTP-binding protein EngA  58.13 
 
 
492 aa  557  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  58.7 
 
 
473 aa  553  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1166  GTP-binding protein EngA  58.63 
 
 
490 aa  554  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000230797  normal  0.345653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4413  GTP-binding protein EngA  60.22 
 
 
446 aa  550  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4043  GTP-binding protein EngA  60.22 
 
 
446 aa  550  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0947633  normal  0.421854 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2427  GTP-binding protein EngA  58.69 
 
 
489 aa  550  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4525  GTP-binding protein EngA  60.65 
 
 
446 aa  545  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.68951 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  58.56 
 
 
460 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3890  GTP-binding protein EngA  60 
 
 
448 aa  545  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337837  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2169  GTP-binding protein EngA  58.4 
 
 
479 aa  544  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414386  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3505  GTP-binding protein EngA  58.77 
 
 
459 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0442058  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2699  GTP-binding protein EngA  58.91 
 
 
487 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1356  GTP-binding protein EngA  58.91 
 
 
487 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0284939 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  57.51 
 
 
460 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  57.29 
 
 
456 aa  537  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2448  GTP-binding protein EngA  57.59 
 
 
459 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14966  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1686  GTP-binding protein EngA  58.14 
 
 
460 aa  535  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0325003  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2160  GTP-binding protein EngA  58.25 
 
 
487 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191337  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2498  GTP-binding protein EngA  55.25 
 
 
602 aa  526  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2020  GTP-binding protein EngA  57.29 
 
 
455 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.866056  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3126  GTP-binding protein EngA  54.89 
 
 
454 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2203  GTP-binding protein EngA  52.88 
 
 
456 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0863  GTP-binding protein EngA  54.33 
 
 
461 aa  486  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145711  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3084  GTP-binding protein EngA  48.5 
 
 
500 aa  474  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1203  small GTP-binding protein  49.24 
 
 
490 aa  474  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.996743  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  51.29 
 
 
451 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3106  GTP-binding protein EngA  50.11 
 
 
479 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.564911 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  41.43 
 
 
439 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  41.39 
 
 
444 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0524  GTP-binding protein EngA  39.24 
 
 
439 aa  333  3e-90  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  40.6 
 
 
464 aa  333  4e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  42.02 
 
 
449 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  42.02 
 
 
449 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.44 
 
 
464 aa  330  3e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0504  GTP-binding protein EngA  37.66 
 
 
442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.696313  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  38.66 
 
 
438 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2203  ribosome-associated GTPase EngA  41.35 
 
 
567 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  40.72 
 
 
490 aa  325  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  41.26 
 
 
467 aa  325  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  39.36 
 
 
495 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3010  GTP-binding protein EngA  41.01 
 
 
495 aa  325  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3605  GTP-binding protein EngA  40.63 
 
 
494 aa  324  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3005  GTP-binding protein EngA  40.41 
 
 
490 aa  323  4e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.198767  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02403  GTP-binding protein EngA  39.75 
 
 
490 aa  323  5e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000560332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1157  small GTP-binding protein  39.75 
 
 
490 aa  323  5e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02365  hypothetical protein  39.75 
 
 
490 aa  323  5e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00134909  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3735  GTP-binding protein EngA  39.75 
 
 
490 aa  323  5e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0134821  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1360  small GTP-binding protein  38.94 
 
 
445 aa  323  5e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508315  hitchhiker  0.00000394324 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2795  GTP-binding protein EngA  39.75 
 
 
490 aa  323  5e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000215643  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1166  GTP-binding protein EngA  39.75 
 
 
490 aa  323  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000585661  normal  0.0127623 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2662  GTP-binding protein EngA  39.75 
 
 
490 aa  323  5e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000307508  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2663  GTP-binding protein EngA  39.75 
 
 
490 aa  323  6e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.194974 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1232  GTP-binding protein EngA  39.4 
 
 
488 aa  322  7e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1233  GTP-binding protein EngA  39.4 
 
 
488 aa  322  7e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2648  GTP-binding protein EngA  39.02 
 
 
488 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3308  GTP-binding protein EngA  39.4 
 
 
487 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1759  GTP-binding protein EngA  39.87 
 
 
473 aa  321  9.999999999999999e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  38.58 
 
 
441 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  37.96 
 
 
440 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1303  GTP-binding protein EngA  39.4 
 
 
488 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2886  GTP-binding protein EngA  39.75 
 
 
490 aa  321  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684219  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01071  GTP-binding protein EngA  40.33 
 
 
498 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1098  GTP-binding protein EngA  38.12 
 
 
441 aa  320  1.9999999999999998e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4247  GTP-binding protein EngA  40.12 
 
 
498 aa  321  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  37.09 
 
 
440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  37.74 
 
 
440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0625  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.05 
 
 
480 aa  319  5e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1309  GTP-binding protein EngA  39.48 
 
 
490 aa  319  6e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00502538  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2361  GTP-binding protein EngA  39.79 
 
 
488 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.596104  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1122  GTP-binding protein EngA  40.21 
 
 
497 aa  318  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.827994  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  37.61 
 
 
439 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0738  ribosome-associated GTPase EngA  41.28 
 
 
484 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.922813  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.61 
 
 
438 aa  318  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1325  GTP-binding protein EngA  37.78 
 
 
511 aa  318  2e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.359502  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1297  GTP-binding protein EngA  39.29 
 
 
495 aa  317  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1190  GTP-binding protein EngA  39.29 
 
 
495 aa  317  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000499446  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0414  GTP-binding protein EngA  39.29 
 
 
495 aa  317  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0317617  hitchhiker  0.000999032 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0733  GTP-binding protein EngA  38.9 
 
 
500 aa  317  4e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1262  GTP-binding protein EngA  39.53 
 
 
495 aa  316  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  39.35 
 
 
448 aa  316  5e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2733  GTP-binding protein EngA  40.17 
 
 
494 aa  315  9e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1120  GTP-binding protein EngA  38.57 
 
 
488 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02977  GTP-binding protein EngA  39.53 
 
 
481 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1260  GTP-binding protein EngA  40.04 
 
 
491 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00475437  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3122  GTP-binding protein EngA  39.61 
 
 
482 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004345  GTP-binding protein EngA  38.99 
 
 
498 aa  313  3.9999999999999997e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>