More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3492 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  100 
 
 		 473 aa  951    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0991  GTP-binding protein EngA  60.75 
 
 		 492 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1166  GTP-binding protein EngA  61.12 
 
 		 490 aa  566  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000230797  normal  0.345653 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2317  GTP-binding protein EngA  59.24 
 
 		 470 aa  566  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318648  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2545  GTP-binding protein EngA  60.55 
 
 		 458 aa  559  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2427  GTP-binding protein EngA  59.07 
 
 		 489 aa  558  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0375  GTP-binding protein EngA  58 
 
 		 483 aa  556  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  57.93 
 
 		 460 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  58.7 
 
 		 474 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  56.53 
 
 		 483 aa  551  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0390  GTP-binding protein EngA  57.38 
 
 		 483 aa  552  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.270758  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2160  GTP-binding protein EngA  60.5 
 
 		 487 aa  551  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1356  GTP-binding protein EngA  60.29 
 
 		 487 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0284939 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2699  GTP-binding protein EngA  60.29 
 
 		 487 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220146  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  57.83 
 
 		 474 aa  548  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  57.89 
 
 		 460 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  57.63 
 
 		 456 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1686  GTP-binding protein EngA  57.42 
 
 		 460 aa  545  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0325003  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0762  GTP-binding protein EngA  57.59 
 
 		 467 aa  545  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0334743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3505  GTP-binding protein EngA  57.63 
 
 		 459 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0442058  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4625  GTP-binding protein EngA  62.99 
 
 		 447 aa  542  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137577  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  57.53 
 
 		 473 aa  544  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  57.51 
 
 		 470 aa  542  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2604  GTP-binding protein EngA  62.34 
 
 		 446 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2448  GTP-binding protein EngA  57.63 
 
 		 459 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14966  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2169  GTP-binding protein EngA  57.89 
 
 		 479 aa  541  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3084  GTP-binding protein EngA  55.69 
 
 		 500 aa  536  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2498  GTP-binding protein EngA  55.34 
 
 		 602 aa  535  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  56.09 
 
 		 473 aa  532  1e-150  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4514  GTP-binding protein EngA  57.62 
 
 		 477 aa  531  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.194124 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2020  GTP-binding protein EngA  56.99 
 
 		 455 aa  530  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.866056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4043  GTP-binding protein EngA  59.74 
 
 		 446 aa  528  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0947633  normal  0.421854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4413  GTP-binding protein EngA  59.74 
 
 		 446 aa  528  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1203  small GTP-binding protein  54.84 
 
 		 490 aa  527  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.996743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3890  GTP-binding protein EngA  60.17 
 
 		 448 aa  521  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337837  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4525  GTP-binding protein EngA  60.61 
 
 		 446 aa  523  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68951 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3126  GTP-binding protein EngA  54.6 
 
 		 454 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2203  GTP-binding protein EngA  53.65 
 
 		 456 aa  490  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3106  GTP-binding protein EngA  52.01 
 
 		 479 aa  462  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.564911 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0863  GTP-binding protein EngA  52.31 
 
 		 461 aa  459  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145711  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  50.64 
 
 		 451 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  41.79 
 
 		 495 aa  362  1e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  40.62 
 
 		 439 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  37.42 
 
 		 440 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0504  GTP-binding protein EngA  37.79 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.696313  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  40.57 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0524  GTP-binding protein EngA  38.19 
 
 		 439 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.36 
 
 		 438 aa  337  3.9999999999999995e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  39.25 
 
 		 439 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  39.91 
 
 		 438 aa  334  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1098  GTP-binding protein EngA  38.59 
 
 		 441 aa  334  2e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.85 
 
 		 464 aa  333  4e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  39.69 
 
 		 448 aa  332  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  41.29 
 
 		 445 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  39.87 
 
 		 441 aa  331  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  41.08 
 
 		 445 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  41.08 
 
 		 445 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  41.08 
 
 		 445 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  41.08 
 
 		 445 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1719  GTP-binding protein EngA  41.08 
 
 		 445 aa  329  9e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.576586 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01071  GTP-binding protein EngA  40.55 
 
 		 498 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2373  GTP-binding protein EngA  40.89 
 
 		 466 aa  327  3e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.537703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  39.25 
 
 		 440 aa  326  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  39.25 
 
 		 440 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0980  ribosome-associated GTPase EngA  40.04 
 
 		 478 aa  325  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1122  GTP-binding protein EngA  41.72 
 
 		 497 aa  325  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.827994  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1341  GTP-binding protein EngA  40.86 
 
 		 445 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380293  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0066  GTP-binding protein EngA  40.86 
 
 		 445 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225046  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2350  GTP-binding protein EngA  40.86 
 
 		 445 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2238  GTP-binding protein EngA  40.86 
 
 		 445 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.746998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1102  GTP-binding protein EngA  40.86 
 
 		 445 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2185  GTP-binding protein EngA  40.86 
 
 		 445 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880216  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2223  GTP-binding protein EngA  40.86 
 
 		 445 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  41.18 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1467  GTP-binding protein EngA  40.22 
 
 		 445 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496612  normal  0.453892 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1210  GTP-binding protein EngA  41.45 
 
 		 463 aa  324  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1830  GTP-binding protein EngA  40.86 
 
 		 460 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  38.82 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3386  GTP-binding protein EngA  41.95 
 
 		 442 aa  323  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  38.35 
 
 		 449 aa  323  4e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  40.04 
 
 		 490 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004345  GTP-binding protein EngA  40.5 
 
 		 498 aa  323  6e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2082  GTP-binding protein EngA  40.13 
 
 		 447 aa  322  7e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543675  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3010  GTP-binding protein EngA  39.34 
 
 		 495 aa  322  8e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  38.73 
 
 		 436 aa  322  9.000000000000001e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1155  GTP-binding protein EngA  40.39 
 
 		 447 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1063  GTP-binding protein EngA  40.39 
 
 		 447 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  40.04 
 
 		 446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2733  GTP-binding protein EngA  41.13 
 
 		 494 aa  320  3e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  36.8 
 
 		 440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  40.04 
 
 		 439 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1759  GTP-binding protein EngA  38.41 
 
 		 473 aa  319  5e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2102  GTP-binding protein EngA  40.13 
 
 		 447 aa  320  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0508209  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2663  GTP-binding protein EngA  40 
 
 		 490 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.194974 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02403  GTP-binding protein EngA  40 
 
 		 490 aa  318  9e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000560332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1157  small GTP-binding protein  40 
 
 		 490 aa  318  9e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02365  hypothetical protein  40 
 
 		 490 aa  318  9e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00134909  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2886  GTP-binding protein EngA  40 
 
 		 490 aa  319  9e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684219  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1166  GTP-binding protein EngA  40 
 
 		 490 aa  318  9e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000585661  normal  0.0127623 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2662  GTP-binding protein EngA  40 
 
 		 490 aa  318  9e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000307508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>