More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3890 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2604  GTP-binding protein EngA  83.04 
 
 
446 aa  702    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3890  GTP-binding protein EngA  100 
 
 
448 aa  888    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337837  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4043  GTP-binding protein EngA  86.61 
 
 
446 aa  741    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0947633  normal  0.421854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4625  GTP-binding protein EngA  84.38 
 
 
447 aa  718    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137577  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4413  GTP-binding protein EngA  86.61 
 
 
446 aa  741    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4525  GTP-binding protein EngA  88.62 
 
 
446 aa  747    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.68951 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2317  GTP-binding protein EngA  64.36 
 
 
470 aa  594  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318648  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0762  GTP-binding protein EngA  63.62 
 
 
467 aa  590  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0334743 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2545  GTP-binding protein EngA  65.05 
 
 
458 aa  578  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0375  GTP-binding protein EngA  62.08 
 
 
483 aa  570  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0390  GTP-binding protein EngA  61.86 
 
 
483 aa  569  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.270758  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  60.38 
 
 
483 aa  565  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  60.65 
 
 
474 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  60.67 
 
 
456 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  59.7 
 
 
473 aa  558  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  61.16 
 
 
473 aa  551  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4514  GTP-binding protein EngA  59.1 
 
 
477 aa  550  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.194124 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3505  GTP-binding protein EngA  60.8 
 
 
459 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0442058  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  59.02 
 
 
460 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  59.47 
 
 
460 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  57.63 
 
 
474 aa  539  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1686  GTP-binding protein EngA  59.69 
 
 
460 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0325003  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  56.84 
 
 
473 aa  537  1e-151  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2448  GTP-binding protein EngA  59.6 
 
 
459 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14966  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3126  GTP-binding protein EngA  60.18 
 
 
454 aa  530  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  58.66 
 
 
470 aa  529  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2020  GTP-binding protein EngA  59.06 
 
 
455 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.866056  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1166  GTP-binding protein EngA  58.55 
 
 
490 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000230797  normal  0.345653 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2427  GTP-binding protein EngA  58.57 
 
 
489 aa  516  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2498  GTP-binding protein EngA  56.67 
 
 
602 aa  511  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0991  GTP-binding protein EngA  57.14 
 
 
492 aa  512  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2169  GTP-binding protein EngA  56.73 
 
 
479 aa  499  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414386  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1203  small GTP-binding protein  54.77 
 
 
490 aa  499  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.996743  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2203  GTP-binding protein EngA  56.76 
 
 
456 aa  496  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2160  GTP-binding protein EngA  56.56 
 
 
487 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191337  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1356  GTP-binding protein EngA  56.56 
 
 
487 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0284939 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2699  GTP-binding protein EngA  56.56 
 
 
487 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220146  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3084  GTP-binding protein EngA  52.11 
 
 
500 aa  488  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0863  GTP-binding protein EngA  55.34 
 
 
461 aa  478  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145711  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  55.08 
 
 
451 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3106  GTP-binding protein EngA  52.46 
 
 
479 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.564911 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  44.32 
 
 
444 aa  355  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0686  GTP-binding protein EngA  43.15 
 
 
473 aa  352  7e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0656  GTP-binding protein EngA  43.15 
 
 
480 aa  352  7e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  43.48 
 
 
439 aa  347  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.19 
 
 
438 aa  346  4e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1759  GTP-binding protein EngA  43.15 
 
 
473 aa  346  6e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  42.99 
 
 
439 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  42.6 
 
 
441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  42.86 
 
 
441 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  40.55 
 
 
438 aa  333  4e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.34 
 
 
464 aa  332  6e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  40.05 
 
 
439 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  38.99 
 
 
440 aa  332  9e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0504  GTP-binding protein EngA  38.22 
 
 
442 aa  331  2e-89  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.696313  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1210  GTP-binding protein EngA  43.41 
 
 
463 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3386  GTP-binding protein EngA  42.99 
 
 
442 aa  327  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  39.73 
 
 
440 aa  326  4.0000000000000003e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0857  GTP-binding protein EngA  41.48 
 
 
487 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  42.63 
 
 
446 aa  326  5e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2892  GTPase family protein  41.83 
 
 
463 aa  325  7e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  42.06 
 
 
445 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1719  GTP-binding protein EngA  42.06 
 
 
445 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.576586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1467  GTP-binding protein EngA  42.35 
 
 
445 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496612  normal  0.453892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0900  GTP-binding protein EngA  41.36 
 
 
487 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0887  GTP-binding protein EngA  41.14 
 
 
487 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  42.57 
 
 
464 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  42.06 
 
 
445 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  42.06 
 
 
445 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  42.06 
 
 
445 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  41.72 
 
 
449 aa  323  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  41.72 
 
 
449 aa  323  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1341  GTP-binding protein EngA  41.03 
 
 
445 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2223  GTP-binding protein EngA  41.03 
 
 
445 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2350  GTP-binding protein EngA  41.03 
 
 
445 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2185  GTP-binding protein EngA  41.03 
 
 
445 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880216  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1102  GTP-binding protein EngA  41.03 
 
 
445 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0066  GTP-binding protein EngA  41.03 
 
 
445 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225046  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0524  GTP-binding protein EngA  38.44 
 
 
439 aa  323  5e-87  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1830  GTP-binding protein EngA  41.03 
 
 
460 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  41.83 
 
 
445 aa  322  7e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2663  GTP-binding protein EngA  40.77 
 
 
490 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.194974 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02403  GTP-binding protein EngA  40.77 
 
 
490 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000560332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1157  small GTP-binding protein  40.77 
 
 
490 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1879  GTP-binding protein EngA  39.55 
 
 
437 aa  321  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1166  GTP-binding protein EngA  40.77 
 
 
490 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000585661  normal  0.0127623 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0625  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.37 
 
 
480 aa  322  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2238  GTP-binding protein EngA  40.86 
 
 
445 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.746998  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3735  GTP-binding protein EngA  40.77 
 
 
490 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0134821  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02365  hypothetical protein  40.77 
 
 
490 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00134909  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2886  GTP-binding protein EngA  40.77 
 
 
490 aa  321  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684219  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2662  GTP-binding protein EngA  40.77 
 
 
490 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000307508  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2795  GTP-binding protein EngA  40.77 
 
 
490 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000215643  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  38.76 
 
 
436 aa  320  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  38.18 
 
 
438 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  38.18 
 
 
438 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  41.28 
 
 
448 aa  320  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  40.97 
 
 
494 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  43.08 
 
 
467 aa  320  3.9999999999999996e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  40.69 
 
 
495 aa  320  3.9999999999999996e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>