More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2160 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1356  GTP-binding protein EngA  97.94 
 
 		 487 aa  938    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0284939 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2699  GTP-binding protein EngA  97.94 
 
 		 487 aa  938    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220146  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2169  GTP-binding protein EngA  72.37 
 
 		 479 aa  701    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1166  GTP-binding protein EngA  76.32 
 
 		 490 aa  758    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000230797  normal  0.345653 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2160  GTP-binding protein EngA  100 
 
 		 487 aa  978    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0991  GTP-binding protein EngA  76.73 
 
 		 492 aa  773    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2427  GTP-binding protein EngA  75.83 
 
 		 489 aa  737    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  60.5 
 
 		 473 aa  568  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_004310  BR0375  GTP-binding protein EngA  59.58 
 
 		 483 aa  551  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  58.25 
 
 		 474 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0390  GTP-binding protein EngA  58.96 
 
 		 483 aa  547  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.270758  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  57.77 
 
 		 473 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2317  GTP-binding protein EngA  59.24 
 
 		 470 aa  543  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318648  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  56.85 
 
 		 483 aa  543  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2545  GTP-binding protein EngA  58.99 
 
 		 458 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3505  GTP-binding protein EngA  55.7 
 
 		 459 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0442058  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  55.7 
 
 		 460 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1686  GTP-binding protein EngA  57.38 
 
 		 460 aa  533  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0325003  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  58.05 
 
 		 470 aa  532  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4514  GTP-binding protein EngA  55.9 
 
 		 477 aa  534  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.194124 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0762  GTP-binding protein EngA  57.08 
 
 		 467 aa  530  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0334743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  55.06 
 
 		 460 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  54.62 
 
 		 474 aa  528  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2448  GTP-binding protein EngA  55.49 
 
 		 459 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14966  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  53.8 
 
 		 456 aa  521  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2020  GTP-binding protein EngA  56.33 
 
 		 455 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.866056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  54.56 
 
 		 473 aa  512  1e-144  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2498  GTP-binding protein EngA  53.62 
 
 		 602 aa  506  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2604  GTP-binding protein EngA  58.19 
 
 		 446 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4625  GTP-binding protein EngA  59.35 
 
 		 447 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137577  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4043  GTP-binding protein EngA  56.96 
 
 		 446 aa  491  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0947633  normal  0.421854 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2203  GTP-binding protein EngA  54.99 
 
 		 456 aa  491  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4413  GTP-binding protein EngA  56.96 
 
 		 446 aa  491  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3126  GTP-binding protein EngA  55.53 
 
 		 454 aa  485  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1203  small GTP-binding protein  53.85 
 
 		 490 aa  485  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.996743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3890  GTP-binding protein EngA  56.34 
 
 		 448 aa  482  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337837  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4525  GTP-binding protein EngA  56.34 
 
 		 446 aa  481  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3084  GTP-binding protein EngA  51.7 
 
 		 500 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0863  GTP-binding protein EngA  52.78 
 
 		 461 aa  451  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145711  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3106  GTP-binding protein EngA  48.74 
 
 		 479 aa  426  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.564911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  47.54 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  38.33 
 
 		 440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  39.74 
 
 		 438 aa  332  8e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  38.67 
 
 		 495 aa  327  3e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  37.99 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  38.2 
 
 		 440 aa  323  5e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.8 
 
 		 464 aa  322  9.000000000000001e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  38.2 
 
 		 440 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1210  GTP-binding protein EngA  41.67 
 
 		 463 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  40.48 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  38.34 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  38.36 
 
 		 441 aa  316  6e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  41.09 
 
 		 444 aa  316  7e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  40.48 
 
 		 441 aa  315  9e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  36.36 
 
 		 439 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  38.01 
 
 		 448 aa  311  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0733  GTP-binding protein EngA  39.2 
 
 		 500 aa  311  2e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  38.03 
 
 		 449 aa  310  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  38.75 
 
 		 490 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  37.58 
 
 		 440 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1155  GTP-binding protein EngA  39.92 
 
 		 447 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  39.13 
 
 		 440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1232  GTP-binding protein EngA  39.23 
 
 		 488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1233  GTP-binding protein EngA  39.23 
 
 		 488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3308  GTP-binding protein EngA  39.23 
 
 		 487 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2648  GTP-binding protein EngA  39.23 
 
 		 488 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1303  GTP-binding protein EngA  39.23 
 
 		 488 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1063  GTP-binding protein EngA  39.7 
 
 		 447 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  38.73 
 
 		 436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.47 
 
 		 438 aa  307  3e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2663  GTP-binding protein EngA  38.89 
 
 		 490 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.194974 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2102  GTP-binding protein EngA  40.38 
 
 		 447 aa  306  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0508209  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01071  GTP-binding protein EngA  39.23 
 
 		 498 aa  306  6e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02403  GTP-binding protein EngA  38.89 
 
 		 490 aa  306  7e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000560332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1157  small GTP-binding protein  38.89 
 
 		 490 aa  306  7e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02365  hypothetical protein  38.89 
 
 		 490 aa  306  7e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00134909  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1166  GTP-binding protein EngA  38.89 
 
 		 490 aa  306  7e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000585661  normal  0.0127623 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2662  GTP-binding protein EngA  38.89 
 
 		 490 aa  306  7e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000307508  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2795  GTP-binding protein EngA  38.89 
 
 		 490 aa  306  7e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000215643  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3735  GTP-binding protein EngA  38.89 
 
 		 490 aa  306  7e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0134821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  37.91 
 
 		 440 aa  306  7e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0980  ribosome-associated GTPase EngA  39.69 
 
 		 478 aa  305  8.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  38.86 
 
 		 437 aa  306  8.000000000000001e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2886  GTP-binding protein EngA  38.89 
 
 		 490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684219  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0598  GTP-binding protein EngA  40.59 
 
 		 469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  37.06 
 
 		 436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004345  GTP-binding protein EngA  39.22 
 
 		 498 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  37.47 
 
 		 436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  38.65 
 
 		 436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1122  GTP-binding protein EngA  39.09 
 
 		 497 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.827994  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1219  GTP-binding protein EngA  39.28 
 
 		 447 aa  301  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0055991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  38.43 
 
 		 436 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2082  GTP-binding protein EngA  38.9 
 
 		 447 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543675  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5226  ribosome-associated GTPase EngA  37.45 
 
 		 435 aa  300  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.814163 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1879  GTP-binding protein EngA  37.06 
 
 		 437 aa  300  5e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1098  GTP-binding protein EngA  37.61 
 
 		 441 aa  299  7e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0504  GTP-binding protein EngA  34.84 
 
 		 442 aa  299  9e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.696313  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3005  GTP-binding protein EngA  38.12 
 
 		 490 aa  299  9e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2858  small GTP-binding protein protein  38.59 
 
 		 467 aa  298  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1309  GTP-binding protein EngA  38.89 
 
 		 490 aa  298  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00502538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>