More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2317 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0762  GTP-binding protein EngA  79.15 
 
 
467 aa  744    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0334743 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2317  GTP-binding protein EngA  100 
 
 
470 aa  922    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318648  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2545  GTP-binding protein EngA  64.44 
 
 
458 aa  597  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4625  GTP-binding protein EngA  66.52 
 
 
447 aa  592  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137577  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2604  GTP-binding protein EngA  66.09 
 
 
446 aa  586  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_004310  BR0375  GTP-binding protein EngA  60.95 
 
 
483 aa  584  1.0000000000000001e-165  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0390  GTP-binding protein EngA  60.33 
 
 
483 aa  580  1e-164  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.270758  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4043  GTP-binding protein EngA  64.43 
 
 
446 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0947633  normal  0.421854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4413  GTP-binding protein EngA  64.43 
 
 
446 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  60.12 
 
 
483 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4525  GTP-binding protein EngA  65.08 
 
 
446 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.68951 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  60.59 
 
 
460 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1686  GTP-binding protein EngA  61.41 
 
 
460 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0325003  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3505  GTP-binding protein EngA  60.77 
 
 
459 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0442058  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3890  GTP-binding protein EngA  64.15 
 
 
448 aa  570  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337837  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  59.24 
 
 
473 aa  566  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  59.7 
 
 
460 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  59.19 
 
 
456 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  60.42 
 
 
474 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2448  GTP-binding protein EngA  58.47 
 
 
459 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14966  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  59.49 
 
 
473 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4514  GTP-binding protein EngA  59.21 
 
 
477 aa  555  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.194124 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2020  GTP-binding protein EngA  60.55 
 
 
455 aa  552  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.866056  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  59.24 
 
 
470 aa  551  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  57.77 
 
 
474 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0991  GTP-binding protein EngA  57.83 
 
 
492 aa  546  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2169  GTP-binding protein EngA  58.76 
 
 
479 aa  540  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414386  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  55.91 
 
 
473 aa  535  1e-151  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1166  GTP-binding protein EngA  57.77 
 
 
490 aa  530  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000230797  normal  0.345653 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2427  GTP-binding protein EngA  56.87 
 
 
489 aa  528  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2160  GTP-binding protein EngA  59.24 
 
 
487 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191337  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2498  GTP-binding protein EngA  54.49 
 
 
602 aa  519  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2699  GTP-binding protein EngA  58.61 
 
 
487 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1356  GTP-binding protein EngA  58.61 
 
 
487 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0284939 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3126  GTP-binding protein EngA  55.15 
 
 
454 aa  495  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1203  small GTP-binding protein  54.35 
 
 
490 aa  496  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.996743  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2203  GTP-binding protein EngA  55.01 
 
 
456 aa  483  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  54.11 
 
 
451 aa  484  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3084  GTP-binding protein EngA  50.4 
 
 
500 aa  474  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3106  GTP-binding protein EngA  52.46 
 
 
479 aa  462  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.564911 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0863  GTP-binding protein EngA  53.53 
 
 
461 aa  440  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145711  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0504  GTP-binding protein EngA  39.27 
 
 
442 aa  343  5e-93  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.696313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  41.14 
 
 
439 aa  342  9e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  40.13 
 
 
438 aa  339  5e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.46 
 
 
464 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1098  GTP-binding protein EngA  40.17 
 
 
441 aa  336  7e-91  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  41.61 
 
 
441 aa  334  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  40.51 
 
 
495 aa  333  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.35 
 
 
438 aa  333  5e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  40.61 
 
 
444 aa  332  9e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1759  GTP-binding protein EngA  38.76 
 
 
473 aa  331  2e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0524  GTP-binding protein EngA  38.27 
 
 
439 aa  329  6e-89  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  38.99 
 
 
439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0625  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.63 
 
 
480 aa  327  3e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  40.13 
 
 
445 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  37.72 
 
 
439 aa  324  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3386  GTP-binding protein EngA  40.99 
 
 
442 aa  323  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  40.13 
 
 
445 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  38.94 
 
 
440 aa  323  4e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  40.13 
 
 
445 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  40.13 
 
 
445 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1719  GTP-binding protein EngA  39.91 
 
 
445 aa  323  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.576586 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  40.58 
 
 
448 aa  323  5e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  39.14 
 
 
445 aa  322  7e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1614  GTP-binding protein EngA  39.1 
 
 
499 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106208 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  40.04 
 
 
464 aa  322  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  37.56 
 
 
440 aa  320  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  39.25 
 
 
440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1438  GTP-binding protein EngA  39.57 
 
 
471 aa  319  6e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.432419  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1210  GTP-binding protein EngA  41.24 
 
 
463 aa  319  7e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  39.47 
 
 
440 aa  319  7e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  41 
 
 
449 aa  319  7.999999999999999e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  41 
 
 
449 aa  319  7.999999999999999e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1467  GTP-binding protein EngA  38.92 
 
 
445 aa  318  9e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496612  normal  0.453892 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2373  GTP-binding protein EngA  38.84 
 
 
466 aa  318  1e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.537703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2185  GTP-binding protein EngA  38.92 
 
 
445 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880216  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1341  GTP-binding protein EngA  38.92 
 
 
445 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2350  GTP-binding protein EngA  38.92 
 
 
445 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1830  GTP-binding protein EngA  38.92 
 
 
460 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0066  GTP-binding protein EngA  38.92 
 
 
445 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225046  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2238  GTP-binding protein EngA  39.1 
 
 
445 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.746998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1102  GTP-binding protein EngA  38.92 
 
 
445 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2223  GTP-binding protein EngA  38.92 
 
 
445 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1063  GTP-binding protein EngA  40.3 
 
 
447 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0598  GTP-binding protein EngA  40.04 
 
 
469 aa  317  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  38.8 
 
 
441 aa  316  6e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1155  GTP-binding protein EngA  39.87 
 
 
447 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004345  GTP-binding protein EngA  38.59 
 
 
498 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02977  GTP-binding protein EngA  38.63 
 
 
481 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  40.58 
 
 
439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1219  GTP-binding protein EngA  39.96 
 
 
447 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0055991  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2102  GTP-binding protein EngA  39.14 
 
 
447 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0508209  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1360  small GTP-binding protein  38.06 
 
 
445 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508315  hitchhiker  0.00000394324 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1287  GTP-binding protein EngA  38.96 
 
 
454 aa  312  9e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.720297  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2663  GTP-binding protein EngA  37.82 
 
 
490 aa  312  9e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.194974 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02403  GTP-binding protein EngA  37.82 
 
 
490 aa  312  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000560332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1157  small GTP-binding protein  37.82 
 
 
490 aa  312  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01071  GTP-binding protein EngA  38.38 
 
 
498 aa  311  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2662  GTP-binding protein EngA  37.82 
 
 
490 aa  312  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000307508  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1166  GTP-binding protein EngA  37.82 
 
 
490 aa  312  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000585661  normal  0.0127623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>