More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3106 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3106  GTP-binding protein EngA  100 
 
 		 479 aa  957    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.564911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  64.22 
 
 		 451 aa  570  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2545  GTP-binding protein EngA  55.41 
 
 		 458 aa  498  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  53.38 
 
 		 460 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  53.23 
 
 		 473 aa  484  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  54.33 
 
 		 470 aa  484  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2317  GTP-binding protein EngA  52.35 
 
 		 470 aa  478  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318648  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  51.84 
 
 		 456 aa  478  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1166  GTP-binding protein EngA  52.2 
 
 		 490 aa  471  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000230797  normal  0.345653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0762  GTP-binding protein EngA  52.26 
 
 		 467 aa  474  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0334743 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3126  GTP-binding protein EngA  51.28 
 
 		 454 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_004310  BR0375  GTP-binding protein EngA  51.91 
 
 		 483 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  52.4 
 
 		 460 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0390  GTP-binding protein EngA  51.48 
 
 		 483 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.270758  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3084  GTP-binding protein EngA  50.81 
 
 		 500 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1686  GTP-binding protein EngA  52.49 
 
 		 460 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0325003  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0991  GTP-binding protein EngA  50 
 
 		 492 aa  467  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2203  GTP-binding protein EngA  51.61 
 
 		 456 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2427  GTP-binding protein EngA  51.37 
 
 		 489 aa  468  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2498  GTP-binding protein EngA  50.11 
 
 		 602 aa  463  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3505  GTP-binding protein EngA  51.63 
 
 		 459 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0442058  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  50.11 
 
 		 474 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  50.95 
 
 		 474 aa  460  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  48.95 
 
 		 483 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4625  GTP-binding protein EngA  51.93 
 
 		 447 aa  455  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137577  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2448  GTP-binding protein EngA  52.38 
 
 		 459 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14966  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4413  GTP-binding protein EngA  53.65 
 
 		 446 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2604  GTP-binding protein EngA  51.5 
 
 		 446 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4043  GTP-binding protein EngA  53.65 
 
 		 446 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0947633  normal  0.421854 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  50.85 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2169  GTP-binding protein EngA  50.86 
 
 		 479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4514  GTP-binding protein EngA  50.32 
 
 		 477 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.194124 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4525  GTP-binding protein EngA  52.78 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68951 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2020  GTP-binding protein EngA  51.19 
 
 		 455 aa  444  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.866056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3890  GTP-binding protein EngA  53 
 
 		 448 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337837  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0863  GTP-binding protein EngA  50.32 
 
 		 461 aa  440  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145711  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  46.37 
 
 		 473 aa  437  1e-121  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1203  small GTP-binding protein  48.07 
 
 		 490 aa  433  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.996743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2160  GTP-binding protein EngA  48.95 
 
 		 487 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2699  GTP-binding protein EngA  49.26 
 
 		 487 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1356  GTP-binding protein EngA  49.26 
 
 		 487 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0284939 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  43.67 
 
 		 438 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  42.23 
 
 		 439 aa  371  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  41.48 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  41.03 
 
 		 490 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  38.68 
 
 		 440 aa  347  3e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.08 
 
 		 464 aa  345  7e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  42.32 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  43.6 
 
 		 467 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  41.23 
 
 		 448 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  39.25 
 
 		 441 aa  343  5e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02403  GTP-binding protein EngA  41.03 
 
 		 490 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000560332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1157  small GTP-binding protein  41.03 
 
 		 490 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2662  GTP-binding protein EngA  41.03 
 
 		 490 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000307508  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2795  GTP-binding protein EngA  41.03 
 
 		 490 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000215643  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1166  GTP-binding protein EngA  41.03 
 
 		 490 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000585661  normal  0.0127623 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3735  GTP-binding protein EngA  41.03 
 
 		 490 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0134821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02365  hypothetical protein  41.03 
 
 		 490 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00134909  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2663  GTP-binding protein EngA  41.03 
 
 		 490 aa  342  7e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.194974 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2886  GTP-binding protein EngA  41.03 
 
 		 490 aa  342  8e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684219  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3005  GTP-binding protein EngA  40 
 
 		 490 aa  342  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.08 
 
 		 438 aa  342  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  40.17 
 
 		 495 aa  342  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  37.28 
 
 		 440 aa  340  2e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  42.28 
 
 		 464 aa  340  4e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1390  GTP-binding protein EngA  39.45 
 
 		 443 aa  340  4e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1329  GTP-binding protein EngA  39.45 
 
 		 443 aa  340  4e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  40.13 
 
 		 440 aa  340  5e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3010  GTP-binding protein EngA  40.3 
 
 		 495 aa  339  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  40.13 
 
 		 440 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1262  GTP-binding protein EngA  40.3 
 
 		 495 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  39.51 
 
 		 440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  40.43 
 
 		 449 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  40.43 
 
 		 449 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  39.44 
 
 		 449 aa  334  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  40.94 
 
 		 445 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  40.94 
 
 		 445 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  40.94 
 
 		 445 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  40.94 
 
 		 445 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  41.36 
 
 		 446 aa  333  4e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1719  GTP-binding protein EngA  40.34 
 
 		 445 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.576586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4321  GTP-binding protein EngA  39.32 
 
 		 487 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000597657 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2238  GTP-binding protein EngA  40.47 
 
 		 445 aa  331  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.746998  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1992  GTP-binding protein EngA  40.39 
 
 		 446 aa  331  1e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.916192  normal  0.0223311 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4247  GTP-binding protein EngA  40.58 
 
 		 498 aa  331  2e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  40.72 
 
 		 445 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1467  GTP-binding protein EngA  40.39 
 
 		 445 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496612  normal  0.453892 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02977  GTP-binding protein EngA  39.53 
 
 		 481 aa  330  3e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  37.99 
 
 		 438 aa  330  3e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  37.99 
 
 		 438 aa  330  3e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2604  GTP-binding protein EngA  40.82 
 
 		 447 aa  330  4e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156486  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1325  GTP-binding protein EngA  37.35 
 
 		 511 aa  330  4e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.359502  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0414  GTP-binding protein EngA  39.16 
 
 		 495 aa  330  5.0000000000000004e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0317617  hitchhiker  0.000999032 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1297  GTP-binding protein EngA  39.16 
 
 		 495 aa  330  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1190  GTP-binding protein EngA  39.16 
 
 		 495 aa  330  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000499446  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0733  GTP-binding protein EngA  37.94 
 
 		 500 aa  329  6e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1759  GTP-binding protein EngA  38.92 
 
 		 473 aa  329  7e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1341  GTP-binding protein EngA  40.47 
 
 		 445 aa  329  8e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2185  GTP-binding protein EngA  40.47 
 
 		 445 aa  329  8e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880216  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0066  GTP-binding protein EngA  40.47 
 
 		 445 aa  329  8e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>