More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4413 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4525  GTP-binding protein EngA  97.53 
 
 		 446 aa  811    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4625  GTP-binding protein EngA  83.63 
 
 		 447 aa  724    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137577  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4413  GTP-binding protein EngA  100 
 
 		 446 aa  880    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2604  GTP-binding protein EngA  84.08 
 
 		 446 aa  708    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4043  GTP-binding protein EngA  100 
 
 		 446 aa  880    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0947633  normal  0.421854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3890  GTP-binding protein EngA  87.28 
 
 		 448 aa  743    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337837  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2317  GTP-binding protein EngA  66.16 
 
 		 470 aa  605  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318648  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0762  GTP-binding protein EngA  65.21 
 
 		 467 aa  597  1e-169  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0334743 
 
 
-
 
NC_004310  BR0375  GTP-binding protein EngA  63.56 
 
 		 483 aa  585  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0390  GTP-binding protein EngA  62.92 
 
 		 483 aa  581  1.0000000000000001e-165  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.270758  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  62.08 
 
 		 483 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2545  GTP-binding protein EngA  63.88 
 
 		 458 aa  568  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  60.86 
 
 		 474 aa  565  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  61.25 
 
 		 460 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  60.45 
 
 		 456 aa  558  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  59.7 
 
 		 473 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  60.36 
 
 		 460 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  60.61 
 
 		 473 aa  552  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4514  GTP-binding protein EngA  59.31 
 
 		 477 aa  551  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.194124 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  58.8 
 
 		 474 aa  552  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3505  GTP-binding protein EngA  60.94 
 
 		 459 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0442058  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1686  GTP-binding protein EngA  60.36 
 
 		 460 aa  545  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0325003  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2448  GTP-binding protein EngA  60.04 
 
 		 459 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14966  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  59.39 
 
 		 470 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  57.33 
 
 		 473 aa  537  1e-151  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2427  GTP-binding protein EngA  58.87 
 
 		 489 aa  526  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3126  GTP-binding protein EngA  59.38 
 
 		 454 aa  525  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1166  GTP-binding protein EngA  58.89 
 
 		 490 aa  522  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000230797  normal  0.345653 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2498  GTP-binding protein EngA  58.01 
 
 		 602 aa  520  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2169  GTP-binding protein EngA  59.12 
 
 		 479 aa  519  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0991  GTP-binding protein EngA  57.87 
 
 		 492 aa  520  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2020  GTP-binding protein EngA  60.14 
 
 		 455 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.866056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2203  GTP-binding protein EngA  57.27 
 
 		 456 aa  499  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1203  small GTP-binding protein  55.7 
 
 		 490 aa  499  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.996743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2699  GTP-binding protein EngA  57.82 
 
 		 487 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220146  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2160  GTP-binding protein EngA  57.17 
 
 		 487 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1356  GTP-binding protein EngA  57.82 
 
 		 487 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0284939 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3084  GTP-binding protein EngA  52.32 
 
 		 500 aa  489  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  56.33 
 
 		 451 aa  481  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0863  GTP-binding protein EngA  54.47 
 
 		 461 aa  468  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145711  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3106  GTP-binding protein EngA  53.86 
 
 		 479 aa  464  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.564911 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  44.16 
 
 		 444 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1759  GTP-binding protein EngA  43.12 
 
 		 473 aa  348  1e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2238  GTP-binding protein EngA  42.53 
 
 		 445 aa  346  5e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.746998  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.71 
 
 		 438 aa  345  7e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  42.99 
 
 		 445 aa  345  7e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  42.99 
 
 		 445 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  42.99 
 
 		 445 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  42.99 
 
 		 445 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  43.05 
 
 		 445 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1830  GTP-binding protein EngA  41.95 
 
 		 460 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0066  GTP-binding protein EngA  41.95 
 
 		 445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225046  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1341  GTP-binding protein EngA  41.95 
 
 		 445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2350  GTP-binding protein EngA  41.95 
 
 		 445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1102  GTP-binding protein EngA  41.95 
 
 		 445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2223  GTP-binding protein EngA  41.95 
 
 		 445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2185  GTP-binding protein EngA  41.95 
 
 		 445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880216  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1719  GTP-binding protein EngA  42.76 
 
 		 445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.576586 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0686  GTP-binding protein EngA  42.44 
 
 		 473 aa  343  5e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  43.22 
 
 		 439 aa  343  5e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0656  GTP-binding protein EngA  42.44 
 
 		 480 aa  343  5e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1467  GTP-binding protein EngA  42.7 
 
 		 445 aa  343  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496612  normal  0.453892 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.67 
 
 		 464 aa  342  1e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3386  GTP-binding protein EngA  44.22 
 
 		 442 aa  336  5e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1598  GTP-binding protein EngA  41.72 
 
 		 445 aa  335  9e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111864  normal  0.122269 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  40.96 
 
 		 438 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2082  GTP-binding protein EngA  41.86 
 
 		 447 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543675  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2537  GTP-binding protein EngA  42.08 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358302  hitchhiker  0.0000595621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1416  GTP-binding protein EngA  41.08 
 
 		 446 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592606 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  41.24 
 
 		 440 aa  333  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  43.18 
 
 		 441 aa  333  4e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  42.4 
 
 		 464 aa  333  4e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  40.27 
 
 		 439 aa  333  5e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0625  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.2 
 
 		 480 aa  333  5e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  42.79 
 
 		 439 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  41.94 
 
 		 441 aa  332  9e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  41.01 
 
 		 440 aa  331  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  40.09 
 
 		 436 aa  330  3e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  43.53 
 
 		 467 aa  328  9e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1219  GTP-binding protein EngA  42.12 
 
 		 447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0055991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  41.4 
 
 		 449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  41.4 
 
 		 449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2102  GTP-binding protein EngA  42.44 
 
 		 447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0508209  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1155  GTP-binding protein EngA  41.89 
 
 		 447 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2892  GTPase family protein  41.48 
 
 		 463 aa  327  3e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1614  GTP-binding protein EngA  40.63 
 
 		 499 aa  326  5e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106208 
 
 
-
 
NC_002978  WD1098  GTP-binding protein EngA  40.58 
 
 		 441 aa  326  6e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  39.08 
 
 		 440 aa  326  6e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1063  GTP-binding protein EngA  41.67 
 
 		 447 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  40.69 
 
 		 495 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2981  GTP-binding protein EngA  41.57 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1438  GTP-binding protein EngA  41.67 
 
 		 471 aa  323  3e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  39.77 
 
 		 440 aa  323  4e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  39.63 
 
 		 441 aa  323  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1360  small GTP-binding protein  40.72 
 
 		 445 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508315  hitchhiker  0.00000394324 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2373  GTP-binding protein EngA  41.18 
 
 		 466 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.537703  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  42.56 
 
 		 446 aa  321  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0504  GTP-binding protein EngA  37.98 
 
 		 442 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.696313  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  38.64 
 
 		 438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  38.64 
 
 		 438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>