More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1219 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1467  GTP-binding protein EngA  80.59 
 
 
445 aa  734    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496612  normal  0.453892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1155  GTP-binding protein EngA  95.3 
 
 
447 aa  868    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1219  GTP-binding protein EngA  100 
 
 
447 aa  903    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0055991  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2185  GTP-binding protein EngA  79.15 
 
 
445 aa  729    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880216  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1341  GTP-binding protein EngA  79.15 
 
 
445 aa  729    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380293  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1416  GTP-binding protein EngA  78.3 
 
 
446 aa  722    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592606 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1287  GTP-binding protein EngA  72.42 
 
 
454 aa  660    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.720297  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2082  GTP-binding protein EngA  88.14 
 
 
447 aa  816    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543675  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2350  GTP-binding protein EngA  79.15 
 
 
445 aa  729    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  80.72 
 
 
445 aa  741    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0066  GTP-binding protein EngA  79.15 
 
 
445 aa  729    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225046  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2238  GTP-binding protein EngA  79.15 
 
 
445 aa  730    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.746998  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1598  GTP-binding protein EngA  78.56 
 
 
445 aa  723    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111864  normal  0.122269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2102  GTP-binding protein EngA  86.8 
 
 
447 aa  815    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0508209  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2223  GTP-binding protein EngA  79.15 
 
 
445 aa  729    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1102  GTP-binding protein EngA  79.15 
 
 
445 aa  729    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  81.26 
 
 
445 aa  740    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  81.26 
 
 
445 aa  740    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2537  GTP-binding protein EngA  78.1 
 
 
445 aa  723    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358302  hitchhiker  0.0000595621 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  81.04 
 
 
445 aa  739    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  81.26 
 
 
445 aa  740    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1719  GTP-binding protein EngA  80.81 
 
 
445 aa  738    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.576586 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0668  GTP-binding protein EngA  71.08 
 
 
454 aa  651    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1830  GTP-binding protein EngA  79.15 
 
 
460 aa  729    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1063  GTP-binding protein EngA  95.75 
 
 
447 aa  870    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2373  GTP-binding protein EngA  68.92 
 
 
466 aa  622  1e-177  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.537703  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2981  GTP-binding protein EngA  63.98 
 
 
443 aa  607  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1992  GTP-binding protein EngA  63.98 
 
 
446 aa  596  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.916192  normal  0.0223311 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1614  GTP-binding protein EngA  64.29 
 
 
499 aa  592  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106208 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3386  GTP-binding protein EngA  66.37 
 
 
442 aa  587  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1428  GTP-binding protein EngA  62.42 
 
 
447 aa  578  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0495777  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0598  GTP-binding protein EngA  63.37 
 
 
469 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2303  GTP-binding protein EngA  62.39 
 
 
447 aa  570  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0637103  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2191  GTP-binding protein EngA  60.85 
 
 
447 aa  566  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2864  GTP-binding protein EngA  62.86 
 
 
448 aa  564  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1876  GTP-binding protein EngA  61.63 
 
 
445 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.900999 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2604  GTP-binding protein EngA  59.73 
 
 
447 aa  558  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156486  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1174  GTP-binding protein EngA  63.8 
 
 
447 aa  550  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1094  GTP-binding protein EngA  63.8 
 
 
447 aa  550  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5015  GTP-binding protein EngA  61.38 
 
 
448 aa  548  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110296  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0076  GTP-binding protein EngA  57.83 
 
 
468 aa  516  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1131  GTP-binding protein EngA  55.3 
 
 
473 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1360  small GTP-binding protein  52.03 
 
 
445 aa  487  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508315  hitchhiker  0.00000394324 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0625  small GTP-binding protein domain-containing protein  53.97 
 
 
480 aa  484  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  53.67 
 
 
467 aa  483  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  55.3 
 
 
464 aa  483  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1438  GTP-binding protein EngA  53.05 
 
 
471 aa  481  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.432419  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1315  GTP-binding protein EngA  51.19 
 
 
493 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01071  GTP-binding protein EngA  50.21 
 
 
498 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2203  ribosome-associated GTPase EngA  54.85 
 
 
567 aa  471  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14930  GTP-binding protein EngA  51.19 
 
 
493 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004345  GTP-binding protein EngA  50.21 
 
 
498 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0738  ribosome-associated GTPase EngA  52.38 
 
 
484 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.922813  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3496  GTP-binding protein EngA  50.98 
 
 
492 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02977  GTP-binding protein EngA  49.78 
 
 
481 aa  468  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4247  GTP-binding protein EngA  49.37 
 
 
498 aa  467  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2858  small GTP-binding protein protein  52.26 
 
 
467 aa  467  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0292  GTP-binding protein EngA  48.4 
 
 
494 aa  462  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40240  GTP-binding protein EngA  50.98 
 
 
491 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02403  GTP-binding protein EngA  50.53 
 
 
490 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000560332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1157  small GTP-binding protein  50.53 
 
 
490 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1166  GTP-binding protein EngA  50.53 
 
 
490 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000585661  normal  0.0127623 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  51.69 
 
 
449 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  50.54 
 
 
490 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2663  GTP-binding protein EngA  50.53 
 
 
490 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.194974 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2662  GTP-binding protein EngA  50.53 
 
 
490 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000307508  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0733  GTP-binding protein EngA  48.2 
 
 
500 aa  460  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2795  GTP-binding protein EngA  50.53 
 
 
490 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000215643  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3735  GTP-binding protein EngA  50.53 
 
 
490 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0134821  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02365  hypothetical protein  50.53 
 
 
490 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00134909  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1172  GTP-binding protein EngA  49.35 
 
 
489 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.120565  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1325  GTP-binding protein EngA  47.3 
 
 
511 aa  458  9.999999999999999e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.359502  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1759  GTP-binding protein EngA  49.89 
 
 
473 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  51.69 
 
 
449 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2886  GTP-binding protein EngA  50.53 
 
 
490 aa  459  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684219  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1498  GTP-binding protein EngA  50.45 
 
 
462 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1485  GTP-binding protein EngA  50.45 
 
 
462 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1262  GTP-binding protein EngA  49.79 
 
 
495 aa  455  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2733  GTP-binding protein EngA  49.68 
 
 
494 aa  456  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1438  GTP-binding protein EngA  48.81 
 
 
489 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1252  GTP-binding protein EngA  48.7 
 
 
490 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319928  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3005  GTP-binding protein EngA  49.36 
 
 
490 aa  453  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.198767  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4321  GTP-binding protein EngA  49.01 
 
 
487 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000597657 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3010  GTP-binding protein EngA  49.58 
 
 
495 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1122  GTP-binding protein EngA  49.16 
 
 
497 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.827994  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2892  GTPase family protein  50.56 
 
 
463 aa  449  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0900  GTP-binding protein EngA  48.79 
 
 
487 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256408 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4597  GTP-binding protein EngA  49.78 
 
 
490 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3605  GTP-binding protein EngA  49.26 
 
 
494 aa  448  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0857  GTP-binding protein EngA  48.57 
 
 
487 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0887  GTP-binding protein EngA  48.79 
 
 
487 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0686  GTP-binding protein EngA  48.67 
 
 
473 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0656  GTP-binding protein EngA  48.67 
 
 
480 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3308  GTP-binding protein EngA  46.35 
 
 
487 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1297  GTP-binding protein EngA  47.98 
 
 
495 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0414  GTP-binding protein EngA  47.98 
 
 
495 aa  442  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0317617  hitchhiker  0.000999032 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  51.92 
 
 
464 aa  442  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1232  GTP-binding protein EngA  46.57 
 
 
488 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1303  GTP-binding protein EngA  46.35 
 
 
488 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1233  GTP-binding protein EngA  46.57 
 
 
488 aa  443  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>