More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2604 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4525  GTP-binding protein EngA  85.43 
 
 		 446 aa  713    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2604  GTP-binding protein EngA  100 
 
 		 446 aa  875    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4043  GTP-binding protein EngA  84.53 
 
 		 446 aa  712    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0947633  normal  0.421854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3890  GTP-binding protein EngA  83.26 
 
 		 448 aa  707    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337837  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4625  GTP-binding protein EngA  92.84 
 
 		 447 aa  790    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137577  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4413  GTP-binding protein EngA  84.53 
 
 		 446 aa  712    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2317  GTP-binding protein EngA  66.52 
 
 		 470 aa  612  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318648  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0762  GTP-binding protein EngA  66.45 
 
 		 467 aa  608  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0334743 
 
 
-
 
NC_004310  BR0375  GTP-binding protein EngA  63.48 
 
 		 483 aa  592  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  63.48 
 
 		 483 aa  591  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0390  GTP-binding protein EngA  62.85 
 
 		 483 aa  588  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.270758  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  63.96 
 
 		 456 aa  585  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  63.79 
 
 		 474 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2545  GTP-binding protein EngA  65.34 
 
 		 458 aa  579  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  62.2 
 
 		 473 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  62.99 
 
 		 473 aa  569  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3505  GTP-binding protein EngA  63.09 
 
 		 459 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0442058  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4514  GTP-binding protein EngA  61.8 
 
 		 477 aa  565  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.194124 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  62.19 
 
 		 460 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  61.97 
 
 		 460 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1686  GTP-binding protein EngA  62.95 
 
 		 460 aa  566  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0325003  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  62.77 
 
 		 470 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  61.29 
 
 		 474 aa  562  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  58.76 
 
 		 473 aa  558  1e-158  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2448  GTP-binding protein EngA  61.88 
 
 		 459 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14966  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1166  GTP-binding protein EngA  60.68 
 
 		 490 aa  545  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000230797  normal  0.345653 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2427  GTP-binding protein EngA  60.43 
 
 		 489 aa  546  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2020  GTP-binding protein EngA  62.75 
 
 		 455 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.866056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2498  GTP-binding protein EngA  58.39 
 
 		 602 aa  535  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0991  GTP-binding protein EngA  58.17 
 
 		 492 aa  535  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3126  GTP-binding protein EngA  60.18 
 
 		 454 aa  532  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2169  GTP-binding protein EngA  59.51 
 
 		 479 aa  527  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1356  GTP-binding protein EngA  58.84 
 
 		 487 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0284939 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2160  GTP-binding protein EngA  58.41 
 
 		 487 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2699  GTP-binding protein EngA  58.84 
 
 		 487 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220146  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2203  GTP-binding protein EngA  57.65 
 
 		 456 aa  505  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1203  small GTP-binding protein  54.12 
 
 		 490 aa  498  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.996743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3084  GTP-binding protein EngA  52.01 
 
 		 500 aa  488  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0863  GTP-binding protein EngA  55.34 
 
 		 461 aa  473  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145711  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  55.78 
 
 		 451 aa  474  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3106  GTP-binding protein EngA  52.14 
 
 		 479 aa  465  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.564911 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  44.93 
 
 		 439 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.65 
 
 		 438 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  43.58 
 
 		 444 aa  364  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1759  GTP-binding protein EngA  43.95 
 
 		 473 aa  352  5e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  45.82 
 
 		 464 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  41.97 
 
 		 438 aa  351  1e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  44.04 
 
 		 439 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  42.76 
 
 		 441 aa  349  5e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  43.44 
 
 		 449 aa  347  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  43.48 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  43.44 
 
 		 449 aa  347  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  41.28 
 
 		 439 aa  346  4e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0625  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.16 
 
 		 480 aa  346  4e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2892  GTPase family protein  43.37 
 
 		 463 aa  345  7e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0656  GTP-binding protein EngA  42.83 
 
 		 480 aa  345  7e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0686  GTP-binding protein EngA  42.76 
 
 		 473 aa  345  8e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  39.4 
 
 		 440 aa  343  5e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  45.19 
 
 		 467 aa  341  1e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  44.22 
 
 		 464 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1719  GTP-binding protein EngA  42.79 
 
 		 445 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.576586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1879  GTP-binding protein EngA  40.6 
 
 		 437 aa  339  5e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1467  GTP-binding protein EngA  43.36 
 
 		 445 aa  339  7e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496612  normal  0.453892 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  40.69 
 
 		 441 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  42.57 
 
 		 445 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1341  GTP-binding protein EngA  41.8 
 
 		 445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380293  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1102  GTP-binding protein EngA  41.8 
 
 		 445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2350  GTP-binding protein EngA  41.8 
 
 		 445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0066  GTP-binding protein EngA  41.8 
 
 		 445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225046  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1830  GTP-binding protein EngA  41.8 
 
 		 460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2185  GTP-binding protein EngA  41.8 
 
 		 445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880216  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2223  GTP-binding protein EngA  41.8 
 
 		 445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  42.28 
 
 		 445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2238  GTP-binding protein EngA  41.57 
 
 		 445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.746998  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  42.57 
 
 		 445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  42.57 
 
 		 445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  39.77 
 
 		 436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  42.57 
 
 		 445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  41.2 
 
 		 449 aa  335  7e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  40.18 
 
 		 440 aa  335  7e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1210  GTP-binding protein EngA  44.47 
 
 		 463 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0504  GTP-binding protein EngA  38.96 
 
 		 442 aa  335  9e-91  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.696313  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3386  GTP-binding protein EngA  44.19 
 
 		 442 aa  335  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2203  ribosome-associated GTPase EngA  44.39 
 
 		 567 aa  335  1e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  39.82 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  41.76 
 
 		 494 aa  334  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  41.57 
 
 		 448 aa  334  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  37.76 
 
 		 439 aa  333  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  39.95 
 
 		 440 aa  333  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  39.3 
 
 		 438 aa  332  5e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  38.5 
 
 		 438 aa  333  5e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  38.5 
 
 		 438 aa  333  5e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  39.63 
 
 		 436 aa  332  6e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1416  GTP-binding protein EngA  41.48 
 
 		 446 aa  332  8e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592606 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  43.25 
 
 		 446 aa  332  8e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  39.77 
 
 		 440 aa  332  9e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  39.36 
 
 		 441 aa  332  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0980  ribosome-associated GTPase EngA  42.47 
 
 		 478 aa  331  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  38.18 
 
 		 440 aa  330  2e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  41.8 
 
 		 493 aa  331  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>