More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1166 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1356  GTP-binding protein EngA  77.25 
 
 		 487 aa  742    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0284939 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2699  GTP-binding protein EngA  77.25 
 
 		 487 aa  742    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220146  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2160  GTP-binding protein EngA  76.32 
 
 		 487 aa  741    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2169  GTP-binding protein EngA  76.69 
 
 		 479 aa  744    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0991  GTP-binding protein EngA  80 
 
 		 492 aa  795    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1166  GTP-binding protein EngA  100 
 
 		 490 aa  983    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000230797  normal  0.345653 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2427  GTP-binding protein EngA  73.58 
 
 		 489 aa  729    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0375  GTP-binding protein EngA  60 
 
 		 483 aa  574  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0390  GTP-binding protein EngA  59.59 
 
 		 483 aa  571  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.270758  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  61.12 
 
 		 473 aa  566  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  57.85 
 
 		 483 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  60.5 
 
 		 470 aa  556  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2545  GTP-binding protein EngA  60.85 
 
 		 458 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  58.63 
 
 		 474 aa  554  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  56.87 
 
 		 460 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4514  GTP-binding protein EngA  57.95 
 
 		 477 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.194124 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3505  GTP-binding protein EngA  57.51 
 
 		 459 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0442058  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  57.95 
 
 		 473 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  57.72 
 
 		 456 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  56.66 
 
 		 460 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  57.08 
 
 		 474 aa  548  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1686  GTP-binding protein EngA  57.93 
 
 		 460 aa  548  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0325003  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0762  GTP-binding protein EngA  58.3 
 
 		 467 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0334743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2448  GTP-binding protein EngA  56.54 
 
 		 459 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14966  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2317  GTP-binding protein EngA  57.77 
 
 		 470 aa  530  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318648  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2020  GTP-binding protein EngA  56.87 
 
 		 455 aa  525  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.866056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4625  GTP-binding protein EngA  60.98 
 
 		 447 aa  526  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137577  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2498  GTP-binding protein EngA  55.98 
 
 		 602 aa  522  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  54.14 
 
 		 473 aa  523  1e-147  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2604  GTP-binding protein EngA  59.62 
 
 		 446 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4043  GTP-binding protein EngA  57.82 
 
 		 446 aa  504  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0947633  normal  0.421854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4413  GTP-binding protein EngA  57.82 
 
 		 446 aa  504  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3126  GTP-binding protein EngA  56.81 
 
 		 454 aa  495  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4525  GTP-binding protein EngA  58.28 
 
 		 446 aa  495  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3084  GTP-binding protein EngA  52.69 
 
 		 500 aa  497  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3890  GTP-binding protein EngA  57.69 
 
 		 448 aa  495  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337837  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2203  GTP-binding protein EngA  55.44 
 
 		 456 aa  495  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1203  small GTP-binding protein  54.24 
 
 		 490 aa  496  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.996743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0863  GTP-binding protein EngA  55.11 
 
 		 461 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145711  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3106  GTP-binding protein EngA  52.59 
 
 		 479 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.564911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  50.75 
 
 		 451 aa  432  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  41.56 
 
 		 444 aa  335  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  41.74 
 
 		 439 aa  334  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  36.07 
 
 		 440 aa  329  7e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  39.71 
 
 		 495 aa  328  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  41.68 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  39.08 
 
 		 438 aa  323  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1098  GTP-binding protein EngA  39.74 
 
 		 441 aa  322  8e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  38.91 
 
 		 439 aa  322  8e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  40.39 
 
 		 440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  39.74 
 
 		 440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1879  GTP-binding protein EngA  39.65 
 
 		 437 aa  320  3e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  39.87 
 
 		 448 aa  320  5e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  38.65 
 
 		 441 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2373  GTP-binding protein EngA  40.04 
 
 		 466 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.537703  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01071  GTP-binding protein EngA  39.55 
 
 		 498 aa  313  4.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.1 
 
 		 464 aa  313  6.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0598  GTP-binding protein EngA  40.47 
 
 		 469 aa  311  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.91 
 
 		 438 aa  310  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  38.15 
 
 		 441 aa  310  4e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1155  GTP-binding protein EngA  40.76 
 
 		 447 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  37.88 
 
 		 449 aa  310  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  39.43 
 
 		 436 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2102  GTP-binding protein EngA  40.25 
 
 		 447 aa  309  8e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0508209  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004345  GTP-binding protein EngA  39.31 
 
 		 498 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1210  GTP-binding protein EngA  40.79 
 
 		 463 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  38.1 
 
 		 490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1063  GTP-binding protein EngA  40.72 
 
 		 447 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1009  GTPase  36.88 
 
 		 442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  35.85 
 
 		 440 aa  307  3e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1992  GTP-binding protein EngA  41.36 
 
 		 446 aa  307  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.916192  normal  0.0223311 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  37.25 
 
 		 436 aa  306  4.0000000000000004e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  40.42 
 
 		 467 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  35.57 
 
 		 439 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1172  GTP-binding protein EngA  38.81 
 
 		 489 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.120565  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  38.78 
 
 		 436 aa  306  7e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  38.78 
 
 		 436 aa  306  7e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  38.78 
 
 		 436 aa  306  7e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  38.78 
 
 		 436 aa  306  7e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  38.78 
 
 		 436 aa  306  7e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  38.78 
 
 		 436 aa  306  7e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  38.78 
 
 		 436 aa  306  7e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1219  GTP-binding protein EngA  40.38 
 
 		 447 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0055991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  37.74 
 
 		 441 aa  305  9.000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  38.78 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2082  GTP-binding protein EngA  39.32 
 
 		 447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543675  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  35.79 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1325  GTP-binding protein EngA  38.43 
 
 		 511 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.359502  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1232  GTP-binding protein EngA  38.96 
 
 		 488 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1233  GTP-binding protein EngA  38.96 
 
 		 488 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3308  GTP-binding protein EngA  38.96 
 
 		 487 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  37.77 
 
 		 440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1303  GTP-binding protein EngA  38.96 
 
 		 488 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1157  small GTP-binding protein  37.92 
 
 		 490 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02365  hypothetical protein  37.92 
 
 		 490 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00134909  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2663  GTP-binding protein EngA  37.92 
 
 		 490 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.194974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2604  GTP-binding protein EngA  39.66 
 
 		 447 aa  304  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156486  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1166  GTP-binding protein EngA  37.92 
 
 		 490 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000585661  normal  0.0127623 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  40.04 
 
 		 446 aa  303  3.0000000000000004e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3735  GTP-binding protein EngA  37.92 
 
 		 490 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0134821  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>