More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3149 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  77.65 
 
 
438 aa  728    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  100 
 
 
441 aa  897    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  76.48 
 
 
440 aa  719    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  75.4 
 
 
439 aa  724    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  76.71 
 
 
440 aa  721    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  70.55 
 
 
449 aa  666    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  71.33 
 
 
448 aa  665    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  62.47 
 
 
439 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  52.53 
 
 
444 aa  466  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  51.84 
 
 
436 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  51.15 
 
 
436 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  48.4 
 
 
446 aa  453  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  49.77 
 
 
438 aa  450  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  49.66 
 
 
436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  49.66 
 
 
436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  49.66 
 
 
436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  49.66 
 
 
436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  49.66 
 
 
436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  49.66 
 
 
436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  49.66 
 
 
436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  49.66 
 
 
436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  49.2 
 
 
436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  49.88 
 
 
439 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  47.59 
 
 
438 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  47.59 
 
 
438 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  49.2 
 
 
436 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  49.43 
 
 
436 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  47.13 
 
 
438 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2134  GTP-binding protein EngA  47.03 
 
 
458 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0583205  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  48.96 
 
 
440 aa  438  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  47.94 
 
 
440 aa  437  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  47.14 
 
 
441 aa  436  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  49.31 
 
 
443 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  48.4 
 
 
439 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  49.08 
 
 
437 aa  430  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  48.63 
 
 
441 aa  429  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0799  GTP-binding protein EngA  48.51 
 
 
436 aa  427  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.940642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  47.38 
 
 
441 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2390  GTP-binding protein EngA  47.94 
 
 
441 aa  422  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149599  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  48.74 
 
 
436 aa  424  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  46.44 
 
 
436 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  47.13 
 
 
436 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1654  GTP-binding protein EngA  45.18 
 
 
465 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  45.68 
 
 
440 aa  411  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  45.98 
 
 
494 aa  411  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  45.98 
 
 
436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  46.45 
 
 
438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2292  GTP-binding protein EngA  44.96 
 
 
465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0406895  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  45.86 
 
 
493 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1562  GTP-binding protein EngA  45.98 
 
 
436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.496113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1532  GTP-binding protein EngA  45.98 
 
 
436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  44.19 
 
 
440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1009  GTPase  47.83 
 
 
442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2204  GTP-binding protein EngA  44.96 
 
 
465 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3568  GTP-binding protein EngA  44.17 
 
 
455 aa  398  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2155  GTP-binding protein EngA  43.65 
 
 
471 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.616734  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0893  GTP-binding protein EngA  47.27 
 
 
427 aa  397  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177025  hitchhiker  0.0000000000000146029 
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  46.21 
 
 
441 aa  390  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  46.77 
 
 
442 aa  390  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  44.27 
 
 
449 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  44.47 
 
 
448 aa  390  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1614  GTP-binding protein EngA  43.78 
 
 
499 aa  386  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106208 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  46.08 
 
 
441 aa  387  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  41.38 
 
 
438 aa  383  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  42.17 
 
 
495 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03881  GTP-binding protein EngA  43.05 
 
 
456 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1498  GTP-binding protein EngA  42.4 
 
 
462 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0333  GTP-binding protein EngA  43.18 
 
 
453 aa  372  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  44.39 
 
 
445 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  42.56 
 
 
434 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1341  GTP-binding protein EngA  44.39 
 
 
445 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380293  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1485  GTP-binding protein EngA  42.4 
 
 
462 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  44.39 
 
 
445 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2350  GTP-binding protein EngA  44.39 
 
 
445 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  44.16 
 
 
445 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2537  GTP-binding protein EngA  44.16 
 
 
445 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358302  hitchhiker  0.0000595621 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2028  GTP-binding protein EngA  42.37 
 
 
455 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.89204  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2340  GTP-binding protein EngA  45.1 
 
 
453 aa  372  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160254  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2238  GTP-binding protein EngA  44.16 
 
 
445 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.746998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1102  GTP-binding protein EngA  44.39 
 
 
445 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2223  GTP-binding protein EngA  44.39 
 
 
445 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  44.39 
 
 
445 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1830  GTP-binding protein EngA  44.39 
 
 
460 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2185  GTP-binding protein EngA  44.39 
 
 
445 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880216  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1719  GTP-binding protein EngA  44.16 
 
 
445 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.576586 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0066  GTP-binding protein EngA  44.39 
 
 
445 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225046  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  44.39 
 
 
445 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2981  GTP-binding protein EngA  43.19 
 
 
443 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0426  GTP-binding protein EngA  42.5 
 
 
442 aa  367  1e-100  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000271389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2896  GTP-binding protein EngA  42.69 
 
 
453 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0739755  hitchhiker  0.000158888 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0644  GTP-binding protein EngA  41.69 
 
 
455 aa  365  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1598  GTP-binding protein EngA  43.94 
 
 
445 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111864  normal  0.122269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1561  GTP-binding protein EngA  41.69 
 
 
453 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.53751  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  44.17 
 
 
467 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1360  small GTP-binding protein  42.08 
 
 
445 aa  365  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508315  hitchhiker  0.00000394324 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0789  small GTP-binding protein  43.94 
 
 
443 aa  364  2e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000826073  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1467  GTP-binding protein EngA  44.22 
 
 
445 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496612  normal  0.453892 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  42.4 
 
 
490 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1416  GTP-binding protein EngA  44.19 
 
 
446 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592606 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2886  GTP-binding protein EngA  42.37 
 
 
490 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>