More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3302 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  68.94 
 
 		 483 aa  677    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0375  GTP-binding protein EngA  68.94 
 
 		 483 aa  682    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0390  GTP-binding protein EngA  68.32 
 
 		 483 aa  678    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.270758  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4514  GTP-binding protein EngA  81.17 
 
 		 477 aa  782    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.194124 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  66.88 
 
 		 470 aa  654    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  100 
 
 		 474 aa  954    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  64.57 
 
 		 473 aa  648    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  84 
 
 		 474 aa  804    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  83.72 
 
 		 473 aa  794    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2545  GTP-binding protein EngA  61.06 
 
 		 458 aa  568  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  57.83 
 
 		 473 aa  548  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0762  GTP-binding protein EngA  58.26 
 
 		 467 aa  548  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0334743 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1166  GTP-binding protein EngA  57.08 
 
 		 490 aa  548  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000230797  normal  0.345653 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2317  GTP-binding protein EngA  57.77 
 
 		 470 aa  546  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318648  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  58.02 
 
 		 460 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  57.62 
 
 		 460 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0991  GTP-binding protein EngA  56.06 
 
 		 492 aa  543  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2427  GTP-binding protein EngA  57.51 
 
 		 489 aa  543  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2604  GTP-binding protein EngA  60.22 
 
 		 446 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3505  GTP-binding protein EngA  57.17 
 
 		 459 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0442058  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4625  GTP-binding protein EngA  60 
 
 		 447 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137577  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4043  GTP-binding protein EngA  58.8 
 
 		 446 aa  536  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0947633  normal  0.421854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4413  GTP-binding protein EngA  58.8 
 
 		 446 aa  536  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2448  GTP-binding protein EngA  56.96 
 
 		 459 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14966  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2169  GTP-binding protein EngA  56.96 
 
 		 479 aa  537  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  56.03 
 
 		 456 aa  533  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1686  GTP-binding protein EngA  56.96 
 
 		 460 aa  528  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0325003  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4525  GTP-binding protein EngA  58.15 
 
 		 446 aa  530  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68951 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2498  GTP-binding protein EngA  55.46 
 
 		 602 aa  523  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1356  GTP-binding protein EngA  54.83 
 
 		 487 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0284939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3890  GTP-binding protein EngA  56.99 
 
 		 448 aa  520  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337837  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2699  GTP-binding protein EngA  54.83 
 
 		 487 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220146  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2160  GTP-binding protein EngA  54.62 
 
 		 487 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2020  GTP-binding protein EngA  56.54 
 
 		 455 aa  512  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.866056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3126  GTP-binding protein EngA  52.34 
 
 		 454 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3084  GTP-binding protein EngA  49.1 
 
 		 500 aa  480  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2203  GTP-binding protein EngA  50.42 
 
 		 456 aa  476  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1203  small GTP-binding protein  49.46 
 
 		 490 aa  474  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.996743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  51.18 
 
 		 451 aa  464  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0863  GTP-binding protein EngA  52.01 
 
 		 461 aa  457  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145711  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3106  GTP-binding protein EngA  50.96 
 
 		 479 aa  449  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.564911 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  40.76 
 
 		 495 aa  334  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  40.74 
 
 		 444 aa  331  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  40.87 
 
 		 439 aa  330  4e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1098  GTP-binding protein EngA  38.41 
 
 		 441 aa  326  5e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  37.06 
 
 		 440 aa  325  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  40.6 
 
 		 490 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0524  GTP-binding protein EngA  38.05 
 
 		 439 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0504  GTP-binding protein EngA  37.05 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.696313  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3005  GTP-binding protein EngA  40.04 
 
 		 490 aa  317  4e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02403  GTP-binding protein EngA  40.6 
 
 		 490 aa  316  6e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000560332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1157  small GTP-binding protein  40.6 
 
 		 490 aa  316  6e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2795  GTP-binding protein EngA  40.6 
 
 		 490 aa  316  6e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000215643  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3735  GTP-binding protein EngA  40.6 
 
 		 490 aa  316  6e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0134821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2663  GTP-binding protein EngA  40.6 
 
 		 490 aa  316  6e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.194974 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2662  GTP-binding protein EngA  40.6 
 
 		 490 aa  316  6e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000307508  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1166  GTP-binding protein EngA  40.6 
 
 		 490 aa  316  6e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000585661  normal  0.0127623 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02365  hypothetical protein  40.6 
 
 		 490 aa  316  6e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00134909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  37.88 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2886  GTP-binding protein EngA  40.51 
 
 		 490 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684219  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3010  GTP-binding protein EngA  40.04 
 
 		 495 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  40.67 
 
 		 449 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  39.92 
 
 		 464 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  40.67 
 
 		 449 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  37.66 
 
 		 440 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  36.96 
 
 		 438 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.45 
 
 		 464 aa  312  9e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  37.72 
 
 		 441 aa  312  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2604  GTP-binding protein EngA  40.25 
 
 		 447 aa  311  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156486  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0733  GTP-binding protein EngA  38.33 
 
 		 500 aa  311  2e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  37.69 
 
 		 441 aa  311  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1262  GTP-binding protein EngA  39.62 
 
 		 495 aa  309  6.999999999999999e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4247  GTP-binding protein EngA  39.75 
 
 		 498 aa  309  8e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1232  GTP-binding protein EngA  38.72 
 
 		 488 aa  309  8e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1233  GTP-binding protein EngA  38.72 
 
 		 488 aa  309  8e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  37.67 
 
 		 436 aa  308  9e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  36.66 
 
 		 439 aa  309  9e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3308  GTP-binding protein EngA  38.72 
 
 		 487 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1303  GTP-binding protein EngA  38.72 
 
 		 488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  38.12 
 
 		 448 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1122  GTP-binding protein EngA  38.6 
 
 		 497 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.827994  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2648  GTP-binding protein EngA  38.27 
 
 		 488 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  36.46 
 
 		 439 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2238  GTP-binding protein EngA  39.92 
 
 		 445 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.746998  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1498  GTP-binding protein EngA  37.37 
 
 		 462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.73 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0738  ribosome-associated GTPase EngA  39.45 
 
 		 484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.922813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0980  ribosome-associated GTPase EngA  39.05 
 
 		 478 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  38.48 
 
 		 439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1876  GTP-binding protein EngA  39.92 
 
 		 445 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.900999 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1485  GTP-binding protein EngA  36.94 
 
 		 462 aa  303  5.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3122  GTP-binding protein EngA  39.87 
 
 		 482 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  39.83 
 
 		 445 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1467  GTP-binding protein EngA  38.99 
 
 		 445 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496612  normal  0.453892 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1759  GTP-binding protein EngA  37.16 
 
 		 473 aa  302  8.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1210  GTP-binding protein EngA  38.3 
 
 		 463 aa  302  9e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1879  GTP-binding protein EngA  39.05 
 
 		 437 aa  302  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  39.96 
 
 		 445 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  37.13 
 
 		 449 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  39.96 
 
 		 445 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>