More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1160 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  100 
 
 
439 aa  887    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  68.1 
 
 
443 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  66.36 
 
 
441 aa  615  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  61.87 
 
 
438 aa  568  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  60.73 
 
 
441 aa  563  1.0000000000000001e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  60.64 
 
 
439 aa  546  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  57.57 
 
 
436 aa  535  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  58.49 
 
 
436 aa  535  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  55.5 
 
 
436 aa  529  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  55.96 
 
 
436 aa  529  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  55.28 
 
 
436 aa  527  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  55.86 
 
 
436 aa  526  1e-148  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  55.28 
 
 
436 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  55.28 
 
 
436 aa  527  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  55.28 
 
 
436 aa  527  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  55.28 
 
 
436 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  55.28 
 
 
436 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  55.28 
 
 
436 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  55.05 
 
 
436 aa  520  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  55.05 
 
 
436 aa  519  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  54.2 
 
 
441 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  54.11 
 
 
440 aa  512  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1532  GTP-binding protein EngA  55.4 
 
 
436 aa  511  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1562  GTP-binding protein EngA  55.4 
 
 
436 aa  511  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.496113  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  56.75 
 
 
444 aa  509  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  56.29 
 
 
436 aa  508  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  56.82 
 
 
436 aa  507  9.999999999999999e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  55.84 
 
 
436 aa  504  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  54.46 
 
 
438 aa  500  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  54.46 
 
 
438 aa  500  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  54.69 
 
 
438 aa  498  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0799  GTP-binding protein EngA  54.69 
 
 
436 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.940642  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2390  GTP-binding protein EngA  53.51 
 
 
441 aa  488  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149599  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  52.83 
 
 
437 aa  483  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  52.75 
 
 
440 aa  472  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  52.39 
 
 
438 aa  474  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  50.91 
 
 
440 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0893  GTP-binding protein EngA  52.25 
 
 
427 aa  465  9.999999999999999e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177025  hitchhiker  0.0000000000000146029 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  51.56 
 
 
493 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  51.45 
 
 
494 aa  458  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  50.11 
 
 
440 aa  456  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  50.78 
 
 
449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1009  GTPase  50 
 
 
442 aa  447  1.0000000000000001e-124  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  51.13 
 
 
447 aa  444  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3568  GTP-binding protein EngA  50.45 
 
 
455 aa  444  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  49.88 
 
 
438 aa  444  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  49.66 
 
 
448 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  51.59 
 
 
449 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  50.11 
 
 
438 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  49.54 
 
 
439 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  47.83 
 
 
439 aa  431  1e-119  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  48.4 
 
 
441 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2896  GTP-binding protein EngA  49.21 
 
 
453 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0739755  hitchhiker  0.000158888 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03881  GTP-binding protein EngA  46.92 
 
 
456 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2028  GTP-binding protein EngA  46.15 
 
 
455 aa  421  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.89204  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  48.17 
 
 
440 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  47.95 
 
 
440 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04431  GTP-binding protein EngA  45.15 
 
 
456 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0422674  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1726  GTP-binding protein EngA  45.15 
 
 
456 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2134  GTP-binding protein EngA  46.45 
 
 
458 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0583205  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  48.51 
 
 
439 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0644  GTP-binding protein EngA  45.25 
 
 
455 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  49.54 
 
 
448 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  47.83 
 
 
441 aa  415  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  47.37 
 
 
441 aa  412  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1561  GTP-binding protein EngA  45.33 
 
 
453 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.53751  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  47.6 
 
 
442 aa  413  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21511  GTP-binding protein EngA  45.77 
 
 
461 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2340  GTP-binding protein EngA  47.18 
 
 
453 aa  410  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160254  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09700  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  46.82 
 
 
438 aa  409  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.253075  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0333  GTP-binding protein EngA  45.15 
 
 
453 aa  409  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  48.61 
 
 
434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3566  ribosome-associated GTPase EngA  46.28 
 
 
454 aa  407  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.173152  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0885  GTP-binding protein EngA  46.05 
 
 
452 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  46.28 
 
 
452 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  46.28 
 
 
452 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3073  GTP-binding protein EngA  47.45 
 
 
435 aa  405  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.348074  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06890  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  46.15 
 
 
444 aa  404  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.632761 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1879  GTP-binding protein EngA  46.82 
 
 
437 aa  399  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5226  ribosome-associated GTPase EngA  46.21 
 
 
435 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.814163 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04795  GTP-binding protein EngA  47.49 
 
 
434 aa  401  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl199  GTP-binding protein EngA  44.87 
 
 
435 aa  395  1e-109  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.316366  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0728  small GTP-binding protein  46.58 
 
 
441 aa  396  1e-109  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.390352 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1169  GTP-binding protein EngA  46.3 
 
 
433 aa  395  1e-109  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.306254 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04531  GTP-binding protein EngA  44.02 
 
 
458 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.491515  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  46.33 
 
 
435 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2143  GTP-binding protein EngA  47.13 
 
 
437 aa  394  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2356  GTP-binding protein EngA  44.72 
 
 
437 aa  392  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1337  small GTP-binding protein  45.56 
 
 
438 aa  392  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0503171  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0400  GTP-binding protein EngA  43.68 
 
 
436 aa  389  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.758155  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1651  GTP-binding protein EngA  45.35 
 
 
443 aa  389  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0577  GTP-binding protein EngA  43.74 
 
 
435 aa  389  1e-107  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.416412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1654  GTP-binding protein EngA  42.42 
 
 
465 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2204  GTP-binding protein EngA  43.08 
 
 
465 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0387  GTP-binding protein EngA  44.12 
 
 
457 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2292  GTP-binding protein EngA  42.64 
 
 
465 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0406895  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04421  GTP-binding protein EngA  43.89 
 
 
457 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0789  small GTP-binding protein  44.8 
 
 
443 aa  383  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000826073  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1813  GTP-binding protein EngA  44.27 
 
 
436 aa  382  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.18548  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04111  GTP-binding protein EngA  43.44 
 
 
457 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>